Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NGB6

Protein Details
Accession A0A1E3NGB6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-42GSGSGRPERSRKRSSTRGRNSRVSKPGRRBasic
165-189NGNAKPDGNPKPKRKERKTLEDLDNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-48GRPERSRKRSSTRGRNSRVSKPGRRGPPAAR
144-182GRAEPRPRRRNPKPVTVEGNGNGNAKPDGNPKPKRKERK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MSSLLEKSLDEIIGSGSGRPERSRKRSSTRGRNSRVSKPGRRGPPAARSFRGSVHNGSPNEIKIVNLHPELTTEDLTQLMETVGPTTRVEIKYNTHGKSIGVAFVEYEFGRDAMEAIKRFDGRLAAGQIISVSSTMPLIDRIGGRAEPRPRRRNPKPVTVEGNGNGNAKPDGNPKPKRKERKTLEDLDNELNMYMNGEAGEVQSEEQSTHLPQQDAEQASATVLVPAQESEAAQVPAQESAPVENGVEPAGNDVAME
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.12
4 0.15
5 0.18
6 0.22
7 0.3
8 0.39
9 0.48
10 0.56
11 0.61
12 0.68
13 0.76
14 0.83
15 0.85
16 0.86
17 0.88
18 0.86
19 0.88
20 0.85
21 0.84
22 0.83
23 0.81
24 0.79
25 0.77
26 0.79
27 0.78
28 0.77
29 0.74
30 0.71
31 0.72
32 0.72
33 0.7
34 0.64
35 0.59
36 0.55
37 0.52
38 0.51
39 0.44
40 0.38
41 0.38
42 0.42
43 0.38
44 0.4
45 0.38
46 0.32
47 0.32
48 0.28
49 0.21
50 0.16
51 0.19
52 0.2
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.17
57 0.19
58 0.19
59 0.17
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.09
74 0.15
75 0.16
76 0.18
77 0.19
78 0.22
79 0.3
80 0.36
81 0.36
82 0.31
83 0.3
84 0.28
85 0.29
86 0.27
87 0.19
88 0.13
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.12
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.05
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.15
133 0.23
134 0.31
135 0.41
136 0.49
137 0.56
138 0.66
139 0.73
140 0.79
141 0.76
142 0.77
143 0.75
144 0.72
145 0.7
146 0.62
147 0.57
148 0.47
149 0.45
150 0.36
151 0.3
152 0.24
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.17
158 0.25
159 0.34
160 0.43
161 0.51
162 0.61
163 0.7
164 0.8
165 0.82
166 0.84
167 0.83
168 0.85
169 0.84
170 0.82
171 0.8
172 0.73
173 0.68
174 0.6
175 0.51
176 0.4
177 0.32
178 0.23
179 0.16
180 0.11
181 0.08
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.14
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.21
201 0.27
202 0.28
203 0.27
204 0.22
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.16
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.14
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.11