Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P5HYJ0

Protein Details
Accession A0A2P5HYJ0    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-243DEFFIKPSKDKKNKGSKGDKDLNKKFKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-106RGKPTDEAPRGGARGGRGARGRGGRGAT
222-242PSKDKKNKGSKGDKDLNKKFK
253-299ERTNEGRGGGRGRGGERGDRRGGPARGRGGASRGDGPPRGGQRGGRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLYDLLGNDTEEGSENPAPVKTVTKASTKTGKANADGTGPASSAPASGARSGGGFSQTEKAYRDRGVGSGANRGKPTDEAPRGGARGGRGARGRGGRGATHHRNADDRHTKNIAPGSEKQAAQSWGANEGTAELNDEQAGEAIAQSEKKDAEAEDAEAVSQEPEVKTMSLDAFYAQREVNRAALNATTSVRQVEGGNEPTGEEYVKDEGDEFFIKPSKDKKNKGSKGDKDLNKKFKTLEIDHAFKEERTNEGRGGGRGRGGERGDRRGGPARGRGGASRGDGPPRGGQRGGRGGAAPLSLDHQNFPGLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.2
14 0.17
15 0.23
16 0.26
17 0.32
18 0.35
19 0.4
20 0.47
21 0.47
22 0.51
23 0.52
24 0.52
25 0.48
26 0.47
27 0.42
28 0.36
29 0.32
30 0.28
31 0.21
32 0.17
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.2
53 0.22
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.22
58 0.22
59 0.24
60 0.25
61 0.24
62 0.29
63 0.31
64 0.31
65 0.31
66 0.3
67 0.28
68 0.26
69 0.28
70 0.29
71 0.29
72 0.28
73 0.3
74 0.33
75 0.32
76 0.31
77 0.29
78 0.2
79 0.23
80 0.22
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.26
88 0.27
89 0.23
90 0.26
91 0.34
92 0.35
93 0.37
94 0.38
95 0.36
96 0.38
97 0.39
98 0.44
99 0.44
100 0.4
101 0.41
102 0.41
103 0.4
104 0.4
105 0.42
106 0.34
107 0.29
108 0.3
109 0.3
110 0.32
111 0.32
112 0.3
113 0.29
114 0.29
115 0.25
116 0.24
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.09
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.11
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.14
207 0.15
208 0.18
209 0.26
210 0.34
211 0.42
212 0.5
213 0.58
214 0.66
215 0.74
216 0.81
217 0.83
218 0.8
219 0.81
220 0.83
221 0.8
222 0.79
223 0.81
224 0.81
225 0.72
226 0.67
227 0.58
228 0.54
229 0.54
230 0.48
231 0.48
232 0.45
233 0.46
234 0.44
235 0.47
236 0.42
237 0.35
238 0.36
239 0.27
240 0.25
241 0.25
242 0.27
243 0.25
244 0.28
245 0.3
246 0.29
247 0.31
248 0.27
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.33
255 0.34
256 0.4
257 0.42
258 0.4
259 0.44
260 0.47
261 0.5
262 0.47
263 0.49
264 0.47
265 0.46
266 0.47
267 0.44
268 0.38
269 0.37
270 0.34
271 0.32
272 0.3
273 0.32
274 0.32
275 0.33
276 0.37
277 0.38
278 0.39
279 0.37
280 0.37
281 0.4
282 0.46
283 0.44
284 0.39
285 0.35
286 0.32
287 0.31
288 0.28
289 0.21
290 0.13
291 0.15
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.17