Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APD1

Protein Details
Accession H2APD1    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-274LHTTKPVRPILKRKRPSNSNNIFLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG kaf:KAFR_0A07970  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MKSLKEICELAVLQNSRMLDDINNVPMYLILPLLSKIRNMKVEQVVKLERSNFGLIFESDFIWLHLLRVEFPNNIDHGFISNNDIISNYYTKFFQTDYLYDLNEFEKEYIERCIIEKLKKNPQKNKYELPPRMLYFKYENDTRKREERSAERLRMNVQEIAKEREKKQTVIVDAPFLLTNKKRGMGIWGNNRKRLSSYFHNKQNIKRQVSRVAFGGSAGRPIKEPPKSESTQLPAPLPPPVEIIRTPPDHLHTTKPVRPILKRKRPSNSNNIFLNTSTITTVSPTKRKPSLSPSPKAQPTQPSSRHNEPSQNCHKRKSLESYLKEKQFPKTGDPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.12
7 0.16
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.14
16 0.11
17 0.07
18 0.07
19 0.08
20 0.12
21 0.13
22 0.16
23 0.21
24 0.26
25 0.32
26 0.33
27 0.4
28 0.46
29 0.51
30 0.5
31 0.52
32 0.5
33 0.47
34 0.49
35 0.43
36 0.35
37 0.33
38 0.33
39 0.26
40 0.23
41 0.23
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.15
56 0.17
57 0.16
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.17
63 0.14
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.13
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.2
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.18
101 0.21
102 0.27
103 0.33
104 0.38
105 0.48
106 0.55
107 0.63
108 0.67
109 0.72
110 0.76
111 0.74
112 0.75
113 0.74
114 0.77
115 0.72
116 0.68
117 0.63
118 0.55
119 0.53
120 0.46
121 0.39
122 0.32
123 0.32
124 0.3
125 0.31
126 0.35
127 0.37
128 0.41
129 0.42
130 0.45
131 0.46
132 0.46
133 0.46
134 0.47
135 0.5
136 0.55
137 0.57
138 0.51
139 0.48
140 0.47
141 0.43
142 0.39
143 0.33
144 0.24
145 0.22
146 0.23
147 0.27
148 0.29
149 0.31
150 0.3
151 0.36
152 0.37
153 0.34
154 0.36
155 0.35
156 0.32
157 0.33
158 0.31
159 0.23
160 0.21
161 0.21
162 0.17
163 0.13
164 0.13
165 0.1
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.21
172 0.25
173 0.31
174 0.38
175 0.47
176 0.49
177 0.54
178 0.54
179 0.48
180 0.43
181 0.39
182 0.35
183 0.35
184 0.42
185 0.45
186 0.53
187 0.61
188 0.62
189 0.66
190 0.7
191 0.7
192 0.66
193 0.64
194 0.6
195 0.62
196 0.6
197 0.55
198 0.45
199 0.38
200 0.31
201 0.26
202 0.24
203 0.15
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.18
209 0.25
210 0.27
211 0.29
212 0.29
213 0.36
214 0.37
215 0.39
216 0.41
217 0.39
218 0.38
219 0.38
220 0.34
221 0.28
222 0.27
223 0.27
224 0.23
225 0.19
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.21
231 0.24
232 0.25
233 0.26
234 0.25
235 0.28
236 0.3
237 0.31
238 0.32
239 0.36
240 0.41
241 0.44
242 0.47
243 0.48
244 0.5
245 0.56
246 0.62
247 0.65
248 0.68
249 0.74
250 0.76
251 0.81
252 0.85
253 0.85
254 0.85
255 0.82
256 0.78
257 0.73
258 0.68
259 0.59
260 0.49
261 0.44
262 0.34
263 0.26
264 0.19
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.2
269 0.23
270 0.3
271 0.34
272 0.41
273 0.46
274 0.5
275 0.54
276 0.57
277 0.61
278 0.63
279 0.66
280 0.66
281 0.7
282 0.73
283 0.7
284 0.66
285 0.65
286 0.62
287 0.65
288 0.66
289 0.64
290 0.66
291 0.71
292 0.74
293 0.69
294 0.72
295 0.66
296 0.68
297 0.71
298 0.74
299 0.7
300 0.69
301 0.7
302 0.67
303 0.7
304 0.69
305 0.69
306 0.69
307 0.72
308 0.75
309 0.77
310 0.78
311 0.77
312 0.72
313 0.68
314 0.67
315 0.63