Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B1Y4

Protein Details
Accession H2B1Y4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
545-575FDSVPYLTTKRRKKHEHVWKVRKNVLRRGQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
554-572KRRKKHEHVWKVRKNVLRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 3, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0L00270  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MMNINLFQLNDPRSNSVIVCLKEKQLLYLSGVFDVQIVKGGIVYNNAHYSSSKQELSFWHPLSNSIPPIQSSYYAGWEEPLNLGARFRHSIDRDVFNDESFTCILRISNAQIDGLIDAHKLYPDVRQLWKIRENDPYSTTIRTFTILNEMQDQFVPLITTNQWTSMVEKMKMSHKDSTFDIRIIVIGGKNSGKSTFLRLLCENLIHNDEDSFSSQEELLYLDLDPGQPEYSLPDCLSLNEIKQQNPNKTFALGQHFGQESNNFRALKQYYYGSNSPQDNPTTYLDMADQLINYFEEQCFVGTSLLNLPGWVKGFGINIINHVIQKYKPTHIITLESKSNSLINEFNIPNIFSNPLQDDYEPIILSLSAFKTFNDSQARFHAPQIRTYKTLLNFHLMSNHNYDFDPLLFKSPVQISFGSFGIQGIQYMETDFQKLHEDDIKGSLEGTIVALNIFQQNNISEYINAAGTYPMISKKININALKFVTLALIHSIDEKRKIMNLYIPCSNLSHVKSSAKETQWILIRNKTETPFCEVFPPNQEVFFSSFDSVPYLTTKRRKKHEHVWKVRKNVLRRGQLMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.33
5 0.31
6 0.33
7 0.33
8 0.34
9 0.38
10 0.37
11 0.34
12 0.32
13 0.32
14 0.31
15 0.33
16 0.31
17 0.26
18 0.26
19 0.23
20 0.19
21 0.17
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.21
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.26
38 0.3
39 0.3
40 0.27
41 0.3
42 0.33
43 0.41
44 0.46
45 0.41
46 0.39
47 0.36
48 0.38
49 0.38
50 0.39
51 0.34
52 0.28
53 0.28
54 0.25
55 0.29
56 0.28
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.23
61 0.22
62 0.21
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.15
67 0.16
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.22
75 0.28
76 0.29
77 0.36
78 0.39
79 0.44
80 0.41
81 0.45
82 0.43
83 0.35
84 0.34
85 0.27
86 0.25
87 0.19
88 0.17
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.14
102 0.11
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.11
110 0.17
111 0.21
112 0.25
113 0.32
114 0.36
115 0.42
116 0.49
117 0.49
118 0.47
119 0.52
120 0.52
121 0.48
122 0.47
123 0.44
124 0.39
125 0.38
126 0.35
127 0.27
128 0.24
129 0.21
130 0.19
131 0.15
132 0.21
133 0.2
134 0.21
135 0.24
136 0.24
137 0.23
138 0.23
139 0.23
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.07
144 0.09
145 0.09
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.14
152 0.18
153 0.21
154 0.2
155 0.21
156 0.23
157 0.3
158 0.35
159 0.37
160 0.39
161 0.36
162 0.37
163 0.39
164 0.44
165 0.38
166 0.33
167 0.29
168 0.22
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.1
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.17
182 0.22
183 0.23
184 0.26
185 0.26
186 0.28
187 0.27
188 0.28
189 0.23
190 0.18
191 0.18
192 0.15
193 0.15
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.11
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.14
224 0.12
225 0.11
226 0.16
227 0.18
228 0.18
229 0.25
230 0.31
231 0.37
232 0.38
233 0.41
234 0.35
235 0.34
236 0.34
237 0.3
238 0.32
239 0.25
240 0.23
241 0.24
242 0.23
243 0.23
244 0.22
245 0.21
246 0.17
247 0.19
248 0.23
249 0.2
250 0.19
251 0.24
252 0.25
253 0.24
254 0.22
255 0.2
256 0.18
257 0.22
258 0.23
259 0.2
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.24
264 0.23
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.1
311 0.15
312 0.17
313 0.18
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.26
318 0.31
319 0.29
320 0.3
321 0.31
322 0.26
323 0.24
324 0.22
325 0.22
326 0.17
327 0.16
328 0.13
329 0.1
330 0.16
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.09
339 0.11
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.14
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.14
358 0.15
359 0.21
360 0.27
361 0.27
362 0.28
363 0.33
364 0.39
365 0.34
366 0.38
367 0.4
368 0.33
369 0.4
370 0.44
371 0.42
372 0.38
373 0.39
374 0.41
375 0.37
376 0.41
377 0.35
378 0.34
379 0.32
380 0.3
381 0.35
382 0.32
383 0.29
384 0.29
385 0.28
386 0.24
387 0.23
388 0.24
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.12
393 0.15
394 0.15
395 0.14
396 0.17
397 0.19
398 0.2
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.16
405 0.13
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.14
420 0.15
421 0.17
422 0.2
423 0.21
424 0.21
425 0.25
426 0.25
427 0.2
428 0.2
429 0.17
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.07
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.13
444 0.15
445 0.15
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.15
460 0.21
461 0.28
462 0.35
463 0.37
464 0.38
465 0.42
466 0.44
467 0.42
468 0.35
469 0.29
470 0.22
471 0.18
472 0.16
473 0.12
474 0.11
475 0.1
476 0.14
477 0.17
478 0.2
479 0.24
480 0.24
481 0.23
482 0.27
483 0.29
484 0.28
485 0.32
486 0.35
487 0.36
488 0.39
489 0.39
490 0.36
491 0.35
492 0.34
493 0.33
494 0.29
495 0.29
496 0.28
497 0.32
498 0.33
499 0.38
500 0.45
501 0.41
502 0.44
503 0.41
504 0.43
505 0.44
506 0.49
507 0.47
508 0.45
509 0.46
510 0.44
511 0.49
512 0.46
513 0.45
514 0.41
515 0.45
516 0.4
517 0.37
518 0.42
519 0.38
520 0.38
521 0.4
522 0.43
523 0.35
524 0.34
525 0.34
526 0.29
527 0.3
528 0.28
529 0.24
530 0.21
531 0.2
532 0.2
533 0.21
534 0.19
535 0.17
536 0.19
537 0.21
538 0.28
539 0.37
540 0.46
541 0.53
542 0.64
543 0.72
544 0.77
545 0.83
546 0.86
547 0.88
548 0.9
549 0.92
550 0.91
551 0.9
552 0.89
553 0.86
554 0.83
555 0.82
556 0.81
557 0.79