Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APM9

Protein Details
Accession H2APM9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-500VNSTQKRRSRSRSQSHSHSPTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 2, extr 2, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040182  ATG13  
IPR018731  Atg13_N  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990316  C:Atg1/ULK1 kinase complex  
GO:0000407  C:phagophore assembly site  
GO:0000045  P:autophagosome assembly  
KEGG kaf:KAFR_0B00290  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10033  ATG13  
Amino Acid Sequences MPTSSSDCDILKIIDNFFLKSTLLICSSVSSNVLQDSPKISDEWFRSDESSTYFLPDLINNWLHFDGGKVLAPLVVETFLDLRGLPASYIVRLKDNDENLWNVCKGSKKTEIMLERWLIELDNSSTTFQSCQVEDDEEHNIQRQLVLLLRYIYTLIHILPVHELCASINAQLNSQTNISRPMPSVGTRIVDGSKPILSKGRIGLSKPIINSYSNVLNESNIPSHLDQKKITPVWTEYGLLRVSISYRKDCKFEIEDTESNTIISAPTNRKSISLSPKARPNLGFSSTESNHQFLQKHPMSISRQAQPFKIGSVNSVLQSTSQVPSRNPSTSSVLGTLYPRKSSISSNYGPMTKPSVEGTSVDSNSSRFLTSYGTLRRQSSINRMNDNKSNIKSNQLLEESNDDLLNFVKLIDEKPEITFKRDRDASNNTNSLNNEMISNSILKFQNLKPSNDLLSEDLSQSVTLDTSKHGISQTQAIPIVNSTQKRRSRSRSQSHSHSPTISFSSPPLYPSINSKLYANEQTTVEASNSGSSSRRNSTERSAMHFMPPILAGQTYSYTVNNHNGAEDIIHENEEHEAKLAEENSDLDESLANFQSSSWKASPRSFENISRSFPANKIQPYGQSYNYSKPTAMSIPAHAELHKPSVQSTDLLIDEANKSTSPVDDDNSQKNRKDQRESDDDELVFFMSNMSLSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.27
4 0.26
5 0.26
6 0.2
7 0.18
8 0.18
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.15
18 0.15
19 0.16
20 0.18
21 0.16
22 0.16
23 0.19
24 0.2
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.26
29 0.29
30 0.33
31 0.32
32 0.31
33 0.32
34 0.33
35 0.33
36 0.3
37 0.29
38 0.23
39 0.24
40 0.22
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.17
45 0.2
46 0.23
47 0.2
48 0.23
49 0.23
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.17
54 0.15
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.1
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.17
77 0.18
78 0.21
79 0.22
80 0.26
81 0.3
82 0.32
83 0.33
84 0.32
85 0.34
86 0.32
87 0.35
88 0.31
89 0.25
90 0.24
91 0.27
92 0.28
93 0.32
94 0.38
95 0.37
96 0.4
97 0.48
98 0.5
99 0.46
100 0.49
101 0.44
102 0.36
103 0.34
104 0.31
105 0.23
106 0.18
107 0.17
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.19
121 0.19
122 0.21
123 0.23
124 0.22
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.19
129 0.18
130 0.16
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.1
141 0.1
142 0.08
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.09
152 0.12
153 0.12
154 0.1
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.19
160 0.18
161 0.19
162 0.18
163 0.15
164 0.21
165 0.22
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.22
170 0.23
171 0.25
172 0.21
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.19
184 0.18
185 0.21
186 0.23
187 0.27
188 0.27
189 0.28
190 0.34
191 0.34
192 0.36
193 0.34
194 0.33
195 0.29
196 0.27
197 0.27
198 0.23
199 0.23
200 0.2
201 0.21
202 0.18
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.17
207 0.12
208 0.14
209 0.13
210 0.22
211 0.25
212 0.27
213 0.25
214 0.27
215 0.34
216 0.34
217 0.34
218 0.29
219 0.28
220 0.27
221 0.28
222 0.26
223 0.18
224 0.2
225 0.19
226 0.15
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.14
231 0.17
232 0.2
233 0.26
234 0.28
235 0.3
236 0.3
237 0.34
238 0.33
239 0.33
240 0.33
241 0.34
242 0.34
243 0.35
244 0.36
245 0.3
246 0.26
247 0.24
248 0.17
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.14
253 0.17
254 0.2
255 0.2
256 0.21
257 0.23
258 0.3
259 0.34
260 0.4
261 0.43
262 0.44
263 0.51
264 0.53
265 0.53
266 0.47
267 0.42
268 0.37
269 0.34
270 0.32
271 0.26
272 0.31
273 0.29
274 0.32
275 0.29
276 0.25
277 0.23
278 0.25
279 0.25
280 0.19
281 0.28
282 0.25
283 0.25
284 0.24
285 0.29
286 0.29
287 0.35
288 0.38
289 0.34
290 0.38
291 0.38
292 0.38
293 0.35
294 0.31
295 0.25
296 0.24
297 0.18
298 0.14
299 0.16
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.17
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.21
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.21
320 0.18
321 0.17
322 0.18
323 0.2
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.18
330 0.21
331 0.22
332 0.22
333 0.25
334 0.26
335 0.26
336 0.25
337 0.24
338 0.22
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.13
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.11
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.15
359 0.18
360 0.22
361 0.24
362 0.25
363 0.26
364 0.26
365 0.27
366 0.32
367 0.36
368 0.36
369 0.4
370 0.42
371 0.44
372 0.47
373 0.49
374 0.45
375 0.38
376 0.39
377 0.34
378 0.35
379 0.35
380 0.32
381 0.31
382 0.27
383 0.26
384 0.21
385 0.23
386 0.19
387 0.17
388 0.16
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.06
394 0.04
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.13
402 0.2
403 0.2
404 0.24
405 0.29
406 0.26
407 0.32
408 0.36
409 0.36
410 0.35
411 0.43
412 0.43
413 0.44
414 0.46
415 0.39
416 0.38
417 0.37
418 0.33
419 0.26
420 0.21
421 0.15
422 0.12
423 0.12
424 0.09
425 0.1
426 0.08
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.17
431 0.18
432 0.28
433 0.3
434 0.32
435 0.3
436 0.32
437 0.33
438 0.3
439 0.3
440 0.21
441 0.2
442 0.19
443 0.16
444 0.13
445 0.12
446 0.11
447 0.1
448 0.08
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.17
460 0.18
461 0.18
462 0.2
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.2
467 0.19
468 0.21
469 0.23
470 0.31
471 0.37
472 0.44
473 0.52
474 0.57
475 0.63
476 0.7
477 0.76
478 0.77
479 0.78
480 0.81
481 0.82
482 0.8
483 0.71
484 0.63
485 0.53
486 0.46
487 0.44
488 0.36
489 0.26
490 0.21
491 0.22
492 0.19
493 0.19
494 0.19
495 0.15
496 0.15
497 0.2
498 0.26
499 0.26
500 0.26
501 0.26
502 0.26
503 0.3
504 0.34
505 0.3
506 0.26
507 0.24
508 0.24
509 0.24
510 0.22
511 0.18
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.13
519 0.18
520 0.21
521 0.26
522 0.27
523 0.31
524 0.36
525 0.43
526 0.43
527 0.46
528 0.47
529 0.43
530 0.43
531 0.42
532 0.35
533 0.28
534 0.26
535 0.19
536 0.14
537 0.13
538 0.11
539 0.09
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.13
545 0.16
546 0.21
547 0.22
548 0.21
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.16
553 0.16
554 0.14
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.14
560 0.15
561 0.12
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.13
566 0.14
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.14
577 0.15
578 0.12
579 0.11
580 0.12
581 0.19
582 0.19
583 0.24
584 0.23
585 0.28
586 0.31
587 0.37
588 0.44
589 0.42
590 0.48
591 0.47
592 0.51
593 0.53
594 0.54
595 0.53
596 0.5
597 0.48
598 0.44
599 0.41
600 0.42
601 0.41
602 0.4
603 0.4
604 0.39
605 0.42
606 0.46
607 0.48
608 0.45
609 0.45
610 0.45
611 0.49
612 0.51
613 0.47
614 0.4
615 0.36
616 0.37
617 0.32
618 0.33
619 0.27
620 0.26
621 0.29
622 0.32
623 0.32
624 0.28
625 0.28
626 0.26
627 0.3
628 0.29
629 0.24
630 0.22
631 0.25
632 0.26
633 0.24
634 0.23
635 0.21
636 0.19
637 0.19
638 0.18
639 0.16
640 0.16
641 0.17
642 0.17
643 0.13
644 0.13
645 0.14
646 0.15
647 0.18
648 0.19
649 0.2
650 0.25
651 0.31
652 0.4
653 0.48
654 0.53
655 0.52
656 0.58
657 0.65
658 0.68
659 0.72
660 0.7
661 0.7
662 0.74
663 0.77
664 0.73
665 0.7
666 0.61
667 0.51
668 0.44
669 0.36
670 0.26
671 0.19
672 0.14
673 0.07