Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVD3

Protein Details
Accession H2AVD3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34KQDVTVSKEDKKKKQAQEEEELSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 5, cyto_nucl 4.5, cyto 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016643  26S_Psome_Rpn1  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR002015  Proteasome/cyclosome_rpt  
IPR041433  RPN1_C  
IPR040892  RPN1_N  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0030234  F:enzyme regulator activity  
GO:0042176  P:regulation of protein catabolic process  
KEGG kaf:KAFR_0E01790  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01851  PC_rep  
PF18051  RPN1_C  
PF17781  RPN1_RPN2_N  
Amino Acid Sequences MAEEKKEIESKQDVTVSKEDKKKKQAQEEEELSEEDLKLKTDLELLVETLKENDSNLYETSLNQLKDFIKNATSSMTAVPKPLKFLRSSYPDLCAVHDRWTDKTMKSSLADVLSVLSMTYSDNGKHDSLRYRLLSDVTNIESWGHEYIRHLALEIGEVYYEQVEKEANLNSSDESELSTPVPTASEFSKDEILNLSLDIVPYFLKHNGEEEAVDLLSEIESIEKLPQFVDENTYKRVCQYMIACVPLLPPPEDIAFLQTAYSIYLSESQLTEALSLAIRLGDESLIRATFDATNDEVMHKQLAYILATQKVSFKHEGVQEIIGNTKLSEHFLYLAKELNLTAPKVPEDIYKSHLDSSKSVFGSVGLDSAQQNLAAAFVNSFLNLGYCKDNLIVDNDNWVYKTKGDGMTSAVASIGSVFQWSLDGLQQLDKYLYVEETEVKAGALLGIGISAAGIHDGDVEPALLLLQDYVNNSNSKISSAAILGLGIAFAGSKNEEVLGLLLPLASDTSIPLEQSTMASLALAHIFVGTCNGDITTCIMDNFLERSAIELKTEWVRFLALALGLLYLGQGEQVDDVIETLSAIEHPMTSAIEVLINACAYTGTGDVLLIQDLLHRLTPEATKKNDEEDEEDEEIEEQGSEIRDFLAEAAAGKEERENNDNQDNEDHDVDMDAEDNAPSAEEKKDEEITETKEDAKVEEGKTEKEEEGEKEKENETESSLIDELSFAVLGIALVAIGEDIGKEMSLRHFGHLMHYGNEHIRRMVPLAMGLVSIADPQMKVFDTLSRFSHDADLDVSMNSIFAMGLCGVGTNNARLAQLLRQLASYYSREQDALFITRMAQGLIHLGKGTMTMDVFNDAQVLNKVTLASLLTVLVGMVSPSFMLTNHQLFYMLNSGVRPKFILTLNEEGEPIKVNVRVGQAVETVGQAGKPKTITGWITQSTPVLLGHGERAELENDEYISYTSNIEGVVILKKNPDYEEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.48
3 0.47
4 0.5
5 0.56
6 0.6
7 0.63
8 0.72
9 0.77
10 0.79
11 0.84
12 0.85
13 0.84
14 0.85
15 0.82
16 0.75
17 0.67
18 0.58
19 0.49
20 0.4
21 0.32
22 0.25
23 0.19
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.14
37 0.15
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.23
48 0.27
49 0.25
50 0.23
51 0.27
52 0.26
53 0.3
54 0.33
55 0.29
56 0.26
57 0.26
58 0.27
59 0.25
60 0.24
61 0.21
62 0.22
63 0.25
64 0.23
65 0.27
66 0.31
67 0.29
68 0.35
69 0.39
70 0.39
71 0.36
72 0.39
73 0.44
74 0.46
75 0.52
76 0.47
77 0.46
78 0.46
79 0.44
80 0.44
81 0.41
82 0.35
83 0.35
84 0.37
85 0.35
86 0.34
87 0.38
88 0.4
89 0.35
90 0.41
91 0.36
92 0.36
93 0.35
94 0.34
95 0.33
96 0.3
97 0.28
98 0.21
99 0.19
100 0.15
101 0.13
102 0.11
103 0.07
104 0.05
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.12
110 0.15
111 0.17
112 0.19
113 0.23
114 0.28
115 0.3
116 0.36
117 0.37
118 0.35
119 0.36
120 0.36
121 0.33
122 0.28
123 0.28
124 0.24
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.14
132 0.12
133 0.14
134 0.18
135 0.21
136 0.2
137 0.19
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.16
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.1
153 0.13
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.14
173 0.15
174 0.17
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.22
179 0.21
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.19
217 0.21
218 0.24
219 0.29
220 0.3
221 0.29
222 0.27
223 0.29
224 0.23
225 0.23
226 0.22
227 0.25
228 0.27
229 0.28
230 0.27
231 0.25
232 0.25
233 0.23
234 0.23
235 0.15
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.07
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.16
294 0.17
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.22
299 0.21
300 0.2
301 0.22
302 0.24
303 0.26
304 0.25
305 0.25
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.16
310 0.13
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.15
320 0.14
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.15
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.25
340 0.28
341 0.26
342 0.24
343 0.27
344 0.29
345 0.26
346 0.26
347 0.22
348 0.19
349 0.19
350 0.17
351 0.13
352 0.07
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.13
379 0.14
380 0.12
381 0.16
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.16
386 0.13
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.16
397 0.12
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.05
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.02
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.02
451 0.02
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.08
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.02
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.02
494 0.03
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.08
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.16
539 0.16
540 0.14
541 0.12
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.03
553 0.03
554 0.02
555 0.02
556 0.02
557 0.02
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.08
604 0.12
605 0.18
606 0.23
607 0.25
608 0.29
609 0.29
610 0.33
611 0.33
612 0.31
613 0.29
614 0.26
615 0.29
616 0.26
617 0.25
618 0.21
619 0.19
620 0.17
621 0.13
622 0.1
623 0.04
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.04
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.09
640 0.11
641 0.13
642 0.16
643 0.17
644 0.21
645 0.26
646 0.27
647 0.25
648 0.25
649 0.25
650 0.24
651 0.23
652 0.19
653 0.13
654 0.13
655 0.12
656 0.1
657 0.08
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.05
663 0.04
664 0.05
665 0.06
666 0.07
667 0.08
668 0.1
669 0.13
670 0.15
671 0.15
672 0.18
673 0.2
674 0.24
675 0.26
676 0.26
677 0.24
678 0.23
679 0.23
680 0.2
681 0.2
682 0.21
683 0.18
684 0.22
685 0.23
686 0.22
687 0.24
688 0.26
689 0.23
690 0.2
691 0.22
692 0.21
693 0.26
694 0.27
695 0.27
696 0.27
697 0.28
698 0.27
699 0.27
700 0.24
701 0.2
702 0.19
703 0.18
704 0.17
705 0.16
706 0.14
707 0.12
708 0.11
709 0.09
710 0.07
711 0.07
712 0.04
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.03
717 0.03
718 0.02
719 0.02
720 0.02
721 0.02
722 0.02
723 0.02
724 0.02
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.05
730 0.07
731 0.14
732 0.15
733 0.16
734 0.19
735 0.19
736 0.23
737 0.28
738 0.28
739 0.23
740 0.23
741 0.24
742 0.27
743 0.3
744 0.26
745 0.21
746 0.21
747 0.2
748 0.21
749 0.21
750 0.16
751 0.14
752 0.14
753 0.13
754 0.11
755 0.1
756 0.08
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.07
764 0.08
765 0.09
766 0.09
767 0.14
768 0.17
769 0.2
770 0.21
771 0.24
772 0.24
773 0.24
774 0.28
775 0.23
776 0.21
777 0.19
778 0.19
779 0.16
780 0.15
781 0.14
782 0.09
783 0.09
784 0.08
785 0.07
786 0.04
787 0.04
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.08
795 0.09
796 0.09
797 0.1
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.14
802 0.15
803 0.21
804 0.22
805 0.21
806 0.2
807 0.21
808 0.22
809 0.24
810 0.24
811 0.21
812 0.21
813 0.21
814 0.21
815 0.21
816 0.22
817 0.21
818 0.21
819 0.19
820 0.17
821 0.17
822 0.19
823 0.19
824 0.16
825 0.13
826 0.1
827 0.14
828 0.15
829 0.14
830 0.12
831 0.12
832 0.12
833 0.12
834 0.12
835 0.08
836 0.08
837 0.08
838 0.09
839 0.11
840 0.12
841 0.11
842 0.11
843 0.1
844 0.11
845 0.13
846 0.14
847 0.12
848 0.13
849 0.13
850 0.11
851 0.13
852 0.12
853 0.1
854 0.09
855 0.08
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.06
860 0.05
861 0.04
862 0.04
863 0.04
864 0.04
865 0.04
866 0.05
867 0.05
868 0.09
869 0.14
870 0.17
871 0.18
872 0.18
873 0.18
874 0.18
875 0.21
876 0.21
877 0.17
878 0.15
879 0.16
880 0.22
881 0.22
882 0.23
883 0.21
884 0.18
885 0.22
886 0.25
887 0.29
888 0.28
889 0.34
890 0.35
891 0.35
892 0.34
893 0.3
894 0.27
895 0.24
896 0.2
897 0.16
898 0.16
899 0.16
900 0.2
901 0.23
902 0.24
903 0.22
904 0.23
905 0.21
906 0.2
907 0.2
908 0.16
909 0.14
910 0.12
911 0.12
912 0.15
913 0.15
914 0.17
915 0.17
916 0.18
917 0.18
918 0.24
919 0.25
920 0.26
921 0.33
922 0.31
923 0.33
924 0.34
925 0.33
926 0.27
927 0.26
928 0.21
929 0.14
930 0.13
931 0.12
932 0.15
933 0.15
934 0.14
935 0.14
936 0.16
937 0.16
938 0.17
939 0.17
940 0.15
941 0.15
942 0.15
943 0.15
944 0.14
945 0.14
946 0.13
947 0.13
948 0.11
949 0.11
950 0.1
951 0.1
952 0.1
953 0.1
954 0.15
955 0.16
956 0.17
957 0.21
958 0.23
959 0.25
960 0.26