Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APU2

Protein Details
Accession H2APU2    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-78ITPSPPPTVPRSKKVHKAKKSVKKESKPVQLPTRRSRRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-77PRSKKVHKAKKSVKKESKPVQLPTRRSRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG kaf:KAFR_0B00940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSDSNNDSNLTTFQRKRLENIKRNNDLLKKLNLSKLSNSITPSPPPTVPRSKKVHKAKKSVKKESKPVQLPTRRSRRLQGHSAPDAEPLKELSSSTSATPPAQELQDVKIIGDLKLSDIIKDEDKISRLSSIKISTGDFFDELKTLQSNTDNEKFMFENFKYSECKVIYDRISALYIHPDKERKIILAGDISGNVGLWNAKDVKEEDEEIYDVDEDVFRFQLFKKNVGRIDCFPNKMEKLAIASYDGFLRSLDLTGMQSDELLQLKNEYGDNLGISDFQFSYSDPNVLYLTTLSGEFTTIDMRENNLKNESIKLRRLADKKIGSMAINPKNSFQISTGSLDRTLKIWDIRKLVKKPDWSQYEDYPSHEIVATYDSRLSVSAVSYSPNDETLVCNGYDDTIRLFDVSDKNLQVSEDLQPKLTLKHNCQSGRWTSILKARFKPNKNVFAIANMSRFIDIYNSGGKQLAHLKTATVPAVINWHPSHNIVAGGNSSGKVFLFSEESTDDGPEYNKIKKEDAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.54
4 0.61
5 0.65
6 0.66
7 0.73
8 0.76
9 0.75
10 0.77
11 0.79
12 0.75
13 0.72
14 0.68
15 0.65
16 0.62
17 0.6
18 0.63
19 0.61
20 0.58
21 0.55
22 0.56
23 0.52
24 0.48
25 0.46
26 0.45
27 0.42
28 0.43
29 0.42
30 0.39
31 0.38
32 0.39
33 0.43
34 0.49
35 0.52
36 0.56
37 0.62
38 0.66
39 0.73
40 0.8
41 0.83
42 0.82
43 0.87
44 0.89
45 0.9
46 0.92
47 0.93
48 0.93
49 0.91
50 0.92
51 0.9
52 0.9
53 0.87
54 0.85
55 0.84
56 0.82
57 0.82
58 0.82
59 0.83
60 0.79
61 0.76
62 0.76
63 0.76
64 0.75
65 0.76
66 0.74
67 0.72
68 0.7
69 0.69
70 0.6
71 0.56
72 0.49
73 0.4
74 0.32
75 0.24
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.21
94 0.2
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.17
99 0.17
100 0.14
101 0.11
102 0.17
103 0.17
104 0.14
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.22
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.23
119 0.24
120 0.24
121 0.25
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.14
135 0.16
136 0.22
137 0.26
138 0.27
139 0.26
140 0.28
141 0.27
142 0.25
143 0.28
144 0.22
145 0.23
146 0.22
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.31
151 0.25
152 0.28
153 0.24
154 0.29
155 0.28
156 0.27
157 0.27
158 0.22
159 0.22
160 0.2
161 0.18
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.23
166 0.25
167 0.25
168 0.28
169 0.29
170 0.21
171 0.21
172 0.2
173 0.18
174 0.17
175 0.16
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.13
191 0.15
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.15
209 0.16
210 0.22
211 0.27
212 0.32
213 0.35
214 0.38
215 0.41
216 0.36
217 0.43
218 0.41
219 0.38
220 0.34
221 0.35
222 0.32
223 0.3
224 0.27
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.15
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.16
291 0.17
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.24
297 0.29
298 0.28
299 0.3
300 0.32
301 0.34
302 0.41
303 0.43
304 0.44
305 0.46
306 0.44
307 0.42
308 0.41
309 0.38
310 0.31
311 0.33
312 0.37
313 0.35
314 0.36
315 0.35
316 0.33
317 0.34
318 0.34
319 0.3
320 0.22
321 0.18
322 0.16
323 0.19
324 0.2
325 0.18
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.18
333 0.22
334 0.25
335 0.3
336 0.37
337 0.45
338 0.48
339 0.54
340 0.55
341 0.59
342 0.59
343 0.63
344 0.61
345 0.58
346 0.58
347 0.54
348 0.56
349 0.48
350 0.46
351 0.4
352 0.34
353 0.29
354 0.25
355 0.2
356 0.13
357 0.15
358 0.13
359 0.11
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.13
391 0.16
392 0.19
393 0.22
394 0.21
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.18
399 0.17
400 0.2
401 0.23
402 0.23
403 0.23
404 0.23
405 0.24
406 0.27
407 0.33
408 0.34
409 0.33
410 0.39
411 0.47
412 0.49
413 0.5
414 0.53
415 0.51
416 0.49
417 0.45
418 0.4
419 0.35
420 0.4
421 0.45
422 0.45
423 0.46
424 0.52
425 0.59
426 0.63
427 0.7
428 0.73
429 0.75
430 0.72
431 0.69
432 0.59
433 0.55
434 0.54
435 0.46
436 0.39
437 0.3
438 0.27
439 0.23
440 0.23
441 0.18
442 0.14
443 0.12
444 0.13
445 0.17
446 0.17
447 0.17
448 0.2
449 0.19
450 0.2
451 0.28
452 0.28
453 0.25
454 0.25
455 0.25
456 0.26
457 0.3
458 0.28
459 0.2
460 0.18
461 0.16
462 0.22
463 0.22
464 0.25
465 0.23
466 0.25
467 0.25
468 0.27
469 0.28
470 0.23
471 0.25
472 0.19
473 0.19
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.15
478 0.14
479 0.12
480 0.12
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.15
485 0.14
486 0.18
487 0.18
488 0.2
489 0.18
490 0.19
491 0.17
492 0.14
493 0.16
494 0.18
495 0.21
496 0.26
497 0.31
498 0.33