Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B0X5

Protein Details
Accession H2B0X5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-282EQEALFKKKKKADKKRKKNTGSSSKNVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-280KKKKKADKKRKKNTGSSSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG kaf:KAFR_0J02110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSEDLFSQALQNKNEVLNLELPKDDIDVDEISDSDSESGKVIADSKQVLSEDSEERVDSSSGTDESSDDSSEEQSSSDDDSEVEGDQEVEGDEEEEEEEEEEAGASGPIRSKHELTEEPLIEIPDDYKVDPNTNISEAGSIQSLFENNVIIHSNMSGERRVLKEGSIFCLEDRNVIGTLSEVFGPLQNPFYRVSFKSSRTDIKKLVEENTGKKVYIVVADATWVDTFELKRFKGTDASNNFDEELPEEEQEFSDDEQEALFKKKKKADKKRKKNTGSSSKNVESQAKKPKASWNNSSNLPQIKPPMGMVSHGYKSRNNRESNQTHRNQIPNRQQETYQHSSNNHPALQQPAYNAYQQQSMPMPPFQQPLHQFNNPYGQQPMPMANQFIPPQPQYPYQQHFPNQPPHMGQSLPPHGQYNGLQPPLPQPQQQQQNLQQVYQLHQLLMQQQQQQSQQHNHPTGSQPPHNDAPPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.27
7 0.25
8 0.24
9 0.23
10 0.23
11 0.19
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.11
29 0.13
30 0.16
31 0.18
32 0.18
33 0.21
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.22
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.17
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.14
53 0.15
54 0.13
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.11
96 0.15
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.36
104 0.33
105 0.31
106 0.31
107 0.29
108 0.23
109 0.2
110 0.17
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.19
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.2
151 0.2
152 0.23
153 0.22
154 0.21
155 0.18
156 0.22
157 0.21
158 0.18
159 0.17
160 0.14
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.24
181 0.26
182 0.29
183 0.32
184 0.35
185 0.41
186 0.43
187 0.47
188 0.44
189 0.43
190 0.43
191 0.4
192 0.39
193 0.38
194 0.36
195 0.34
196 0.36
197 0.34
198 0.29
199 0.27
200 0.25
201 0.19
202 0.17
203 0.14
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.09
215 0.13
216 0.12
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.2
221 0.21
222 0.27
223 0.27
224 0.32
225 0.31
226 0.3
227 0.3
228 0.24
229 0.23
230 0.15
231 0.14
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.11
247 0.16
248 0.19
249 0.25
250 0.32
251 0.41
252 0.52
253 0.62
254 0.7
255 0.77
256 0.83
257 0.89
258 0.93
259 0.92
260 0.9
261 0.89
262 0.89
263 0.85
264 0.79
265 0.75
266 0.66
267 0.62
268 0.55
269 0.51
270 0.43
271 0.43
272 0.49
273 0.47
274 0.46
275 0.44
276 0.51
277 0.54
278 0.57
279 0.58
280 0.53
281 0.52
282 0.54
283 0.55
284 0.5
285 0.44
286 0.39
287 0.32
288 0.3
289 0.27
290 0.25
291 0.22
292 0.2
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.22
299 0.23
300 0.25
301 0.32
302 0.41
303 0.47
304 0.46
305 0.49
306 0.56
307 0.62
308 0.67
309 0.69
310 0.62
311 0.6
312 0.61
313 0.65
314 0.6
315 0.61
316 0.63
317 0.63
318 0.63
319 0.59
320 0.56
321 0.54
322 0.58
323 0.54
324 0.47
325 0.41
326 0.39
327 0.43
328 0.48
329 0.45
330 0.37
331 0.32
332 0.3
333 0.32
334 0.32
335 0.27
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.24
340 0.24
341 0.2
342 0.22
343 0.21
344 0.22
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.22
349 0.23
350 0.22
351 0.26
352 0.24
353 0.29
354 0.33
355 0.37
356 0.42
357 0.43
358 0.41
359 0.4
360 0.49
361 0.42
362 0.38
363 0.34
364 0.28
365 0.26
366 0.26
367 0.27
368 0.22
369 0.22
370 0.23
371 0.21
372 0.25
373 0.25
374 0.26
375 0.27
376 0.25
377 0.26
378 0.28
379 0.32
380 0.35
381 0.42
382 0.44
383 0.45
384 0.51
385 0.52
386 0.57
387 0.59
388 0.62
389 0.57
390 0.55
391 0.52
392 0.48
393 0.47
394 0.39
395 0.35
396 0.35
397 0.39
398 0.37
399 0.36
400 0.35
401 0.33
402 0.35
403 0.34
404 0.33
405 0.32
406 0.32
407 0.31
408 0.3
409 0.36
410 0.42
411 0.44
412 0.39
413 0.38
414 0.45
415 0.55
416 0.59
417 0.61
418 0.61
419 0.68
420 0.65
421 0.59
422 0.54
423 0.46
424 0.45
425 0.43
426 0.35
427 0.25
428 0.25
429 0.27
430 0.28
431 0.33
432 0.35
433 0.34
434 0.36
435 0.41
436 0.46
437 0.5
438 0.53
439 0.54
440 0.57
441 0.61
442 0.62
443 0.58
444 0.57
445 0.56
446 0.58
447 0.58
448 0.56
449 0.51
450 0.53
451 0.58