Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APV5

Protein Details
Accession H2APV5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MAKTYSNKVAKKHTKKTRKKSSALKTLHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-21AKKHTKKTRKKS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
KEGG kaf:KAFR_0B01070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MAKTYSNKVAKKHTKKTRKKSSALKTLHGALKSLLQDTTTESMTFKKKVSVGGGVKHNEIPVLKENGVVYIMSKENVLIPRLSDDEIMAKHKKADETMKTVWNNIIDKYENLDDQGDLIDLQKGEILEDNGHIRNLGQNGSIDEKIRYKSTLKGLIPTTDGSRDGADDSEEDNEFSVWQDDASKSDASEDSSDESFTSNSSSDEESDSDVESTASSSDDSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.88
3 0.94
4 0.94
5 0.93
6 0.92
7 0.92
8 0.91
9 0.9
10 0.84
11 0.78
12 0.7
13 0.67
14 0.63
15 0.53
16 0.43
17 0.33
18 0.33
19 0.3
20 0.27
21 0.2
22 0.15
23 0.15
24 0.18
25 0.2
26 0.16
27 0.15
28 0.14
29 0.19
30 0.23
31 0.25
32 0.22
33 0.24
34 0.24
35 0.28
36 0.3
37 0.34
38 0.34
39 0.37
40 0.43
41 0.41
42 0.41
43 0.38
44 0.34
45 0.27
46 0.24
47 0.21
48 0.19
49 0.22
50 0.2
51 0.21
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.16
56 0.12
57 0.1
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.11
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.16
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.25
82 0.24
83 0.29
84 0.32
85 0.37
86 0.35
87 0.35
88 0.33
89 0.29
90 0.26
91 0.2
92 0.2
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.15
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.15
128 0.16
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.19
135 0.17
136 0.22
137 0.28
138 0.35
139 0.33
140 0.36
141 0.36
142 0.35
143 0.35
144 0.31
145 0.27
146 0.2
147 0.2
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.16
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.15
181 0.15
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.11
200 0.08
201 0.08