Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AMH3

Protein Details
Accession H2AMH3    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-72ITLLQNSSTKKKKNNDSNNSNSAKHHydrophilic
212-233IENYKIDKKRIEKKRNKPFSLQHydrophilic
404-425DSRNKNSKIKYLRKSCQPNVELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-227KKRIEKKRN
Subcellular Location(s) nucl 20, pero 2, golg 2, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG kaf:KAFR_0A01350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences MIHKPKVVPNVPESVQLKLLEVREQIQKEQKQRDSLFNPMNSPGPASITLLQNSSTKKKKNNDSNNSNSAKHSQPISREVTYVKEAKDDGSTSNRGLVAAAALTAAFVKPFPHKQSHEGEEQDNDDDHNEIQTDRSFNNALPENYIVNKQQNIITCMCGSNGTLDGDVKKNDLIQCNRCNRWQHLQCYGLENNLEILPLKFFCNICKPNLSIENYKIDKKRIEKKRNKPFSLQIQIEIQNQLQAQTKGKLAHNIPSTSDSNNKNNNNNNINRTHFSSNILKNNSNSHNTTKTLREVTNNNTSEYEYNDKYVRNFIDDHNSDDWVRPLNKELKLSSNSVEVKNLNRTMVGVYAVQNFQKNDLIMIYPGLIDFQKSYIDDPENEYKVWGTTRRFILFHPHWPIFIDSRNKNSKIKYLRKSCQPNVELKTIKVDDTIKFVIAAIEEINIGDELTISWQWDLRHPIAPVNNDNQTYLESLNHANKLWLIHSTNLVSKACPCACKNVNSCKFAIAKKFTDSIINNHVSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.35
4 0.33
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.28
9 0.29
10 0.33
11 0.35
12 0.39
13 0.44
14 0.5
15 0.55
16 0.63
17 0.65
18 0.67
19 0.68
20 0.72
21 0.66
22 0.68
23 0.67
24 0.59
25 0.56
26 0.49
27 0.48
28 0.38
29 0.36
30 0.28
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.23
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.29
41 0.35
42 0.39
43 0.43
44 0.51
45 0.59
46 0.68
47 0.76
48 0.82
49 0.84
50 0.85
51 0.87
52 0.87
53 0.82
54 0.73
55 0.65
56 0.59
57 0.51
58 0.45
59 0.41
60 0.36
61 0.37
62 0.42
63 0.44
64 0.41
65 0.39
66 0.37
67 0.36
68 0.37
69 0.36
70 0.3
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.23
77 0.24
78 0.26
79 0.24
80 0.27
81 0.25
82 0.22
83 0.21
84 0.17
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.07
96 0.12
97 0.19
98 0.24
99 0.32
100 0.35
101 0.41
102 0.49
103 0.51
104 0.53
105 0.49
106 0.46
107 0.41
108 0.39
109 0.34
110 0.27
111 0.23
112 0.17
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.1
119 0.12
120 0.14
121 0.13
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.22
126 0.25
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.22
134 0.2
135 0.21
136 0.2
137 0.22
138 0.23
139 0.26
140 0.24
141 0.23
142 0.21
143 0.2
144 0.19
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.12
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.15
158 0.18
159 0.25
160 0.29
161 0.34
162 0.42
163 0.49
164 0.52
165 0.54
166 0.56
167 0.54
168 0.58
169 0.58
170 0.55
171 0.54
172 0.55
173 0.5
174 0.5
175 0.45
176 0.36
177 0.29
178 0.24
179 0.18
180 0.14
181 0.13
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.22
191 0.24
192 0.25
193 0.27
194 0.27
195 0.29
196 0.35
197 0.36
198 0.31
199 0.31
200 0.37
201 0.36
202 0.4
203 0.39
204 0.36
205 0.37
206 0.41
207 0.49
208 0.52
209 0.61
210 0.66
211 0.75
212 0.82
213 0.88
214 0.84
215 0.79
216 0.75
217 0.74
218 0.72
219 0.62
220 0.52
221 0.46
222 0.44
223 0.4
224 0.34
225 0.24
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.24
237 0.22
238 0.27
239 0.29
240 0.28
241 0.26
242 0.27
243 0.27
244 0.23
245 0.28
246 0.26
247 0.29
248 0.36
249 0.38
250 0.4
251 0.44
252 0.49
253 0.49
254 0.49
255 0.47
256 0.43
257 0.43
258 0.39
259 0.38
260 0.33
261 0.27
262 0.28
263 0.31
264 0.33
265 0.36
266 0.38
267 0.35
268 0.34
269 0.39
270 0.38
271 0.35
272 0.33
273 0.3
274 0.3
275 0.31
276 0.32
277 0.29
278 0.29
279 0.29
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.32
284 0.38
285 0.37
286 0.34
287 0.31
288 0.3
289 0.27
290 0.27
291 0.26
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.19
296 0.19
297 0.23
298 0.2
299 0.18
300 0.19
301 0.18
302 0.26
303 0.26
304 0.3
305 0.26
306 0.27
307 0.25
308 0.24
309 0.24
310 0.19
311 0.19
312 0.15
313 0.19
314 0.25
315 0.27
316 0.3
317 0.3
318 0.31
319 0.33
320 0.34
321 0.3
322 0.3
323 0.3
324 0.28
325 0.29
326 0.24
327 0.25
328 0.29
329 0.3
330 0.23
331 0.2
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.15
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.18
345 0.16
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.22
366 0.28
367 0.28
368 0.27
369 0.26
370 0.22
371 0.22
372 0.24
373 0.24
374 0.21
375 0.25
376 0.3
377 0.33
378 0.33
379 0.33
380 0.4
381 0.38
382 0.43
383 0.44
384 0.4
385 0.37
386 0.38
387 0.4
388 0.32
389 0.35
390 0.36
391 0.32
392 0.4
393 0.48
394 0.5
395 0.52
396 0.53
397 0.55
398 0.57
399 0.63
400 0.65
401 0.67
402 0.71
403 0.77
404 0.84
405 0.81
406 0.81
407 0.74
408 0.73
409 0.68
410 0.69
411 0.61
412 0.51
413 0.53
414 0.44
415 0.4
416 0.35
417 0.33
418 0.25
419 0.29
420 0.3
421 0.22
422 0.21
423 0.21
424 0.18
425 0.15
426 0.14
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.12
443 0.18
444 0.24
445 0.24
446 0.29
447 0.29
448 0.35
449 0.38
450 0.42
451 0.42
452 0.41
453 0.44
454 0.4
455 0.4
456 0.35
457 0.31
458 0.27
459 0.23
460 0.18
461 0.15
462 0.2
463 0.24
464 0.25
465 0.24
466 0.23
467 0.24
468 0.25
469 0.24
470 0.24
471 0.22
472 0.22
473 0.25
474 0.27
475 0.3
476 0.33
477 0.32
478 0.28
479 0.27
480 0.34
481 0.33
482 0.37
483 0.34
484 0.39
485 0.44
486 0.52
487 0.58
488 0.6
489 0.65
490 0.63
491 0.63
492 0.58
493 0.59
494 0.56
495 0.57
496 0.53
497 0.49
498 0.49
499 0.51
500 0.46
501 0.49
502 0.45
503 0.42
504 0.44