Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVS0

Protein Details
Accession H2AVS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MAQPNQNKNNKNQQQQQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 4, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR006594  LisH  
IPR007582  TFIID_NTD2  
IPR037264  TFIID_NTD2_sf  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031326  P:regulation of cellular biosynthetic process  
KEGG kaf:KAFR_0E03180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF04494  TFIID_NTD2  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd08044  TAF5_NTD2  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MAQPNQNKNNKNQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRQSSNSAQQANNGNASQQQSRPSSQFSAQDLNRIVLEYLNKKGYHRTEAMLRAESSRTITPQNKKSPGTTKNGKLPEPSTTPPVSDKTVKPVSNPILPPQQQPGVKRDNEGSVIMSSEQQVINSMSPGNYIRAYSLLKNWIDESLEIYKPELSYIIYPIFIYLFLNLISKDAIVARRFFDKFSSDYKILHGTDINRLYSINSVDHIKENETANAFISGKYRITISKTILNLLLYFLNENENVGGSLILSMINKHLQPVIVNSPVTAKDRLADGLKIESSTNDNNNANVNLEINSIPVKLGPLPKDEEFVKEVETELKIKDDQEKQQQDNNDANTKTLLQEYKSIQNDTASDAATVTDKNEDDKDKSDNLIKETKEEVLEENKNIIKTPVESKAFMVSPSIDTLPLPLKTSLDLKLEIQKVKESRDAIRLDNIQTSLPSVCMYTFHNTNKDMSCLEFSDDCRLAATGFQDSFIKIWSLDGSSLVTNKLPSYKKEEILTTGDETSSLLIGHSGAVYSTSFSPDNKFLLSGSEDKTVRLWSMDTHTTLVSYKGHNHPVWDVKFSPMGHYFATASHDQTARLWSCDHIYPLRIFAGHLNDVETVSFHPNGCYVFTGSADKTCRMWDISTGDSVRLFLGHTAPVLTTAVTPDGRWLCTGGEDGVINVWDIGTGKRLKQMRGHGKNAIHSFSFNKEGNILISGGADHSVRVWDLKKATPEPSAEPEQPFAGYVGDVTASVNQDIKEFGRRRAIVPTSDLVASFFTKKTPVFNVKFTRTNLALAGGAFRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.86
3 0.88
4 0.87
5 0.87
6 0.86
7 0.85
8 0.84
9 0.82
10 0.81
11 0.8
12 0.78
13 0.79
14 0.8
15 0.79
16 0.79
17 0.78
18 0.76
19 0.7
20 0.68
21 0.66
22 0.65
23 0.63
24 0.62
25 0.54
26 0.54
27 0.57
28 0.53
29 0.5
30 0.41
31 0.35
32 0.31
33 0.35
34 0.34
35 0.3
36 0.33
37 0.34
38 0.38
39 0.41
40 0.42
41 0.42
42 0.42
43 0.45
44 0.43
45 0.47
46 0.43
47 0.47
48 0.43
49 0.4
50 0.36
51 0.31
52 0.26
53 0.2
54 0.26
55 0.23
56 0.27
57 0.31
58 0.32
59 0.32
60 0.41
61 0.43
62 0.44
63 0.43
64 0.42
65 0.44
66 0.5
67 0.54
68 0.49
69 0.44
70 0.39
71 0.38
72 0.35
73 0.31
74 0.26
75 0.24
76 0.29
77 0.36
78 0.43
79 0.51
80 0.59
81 0.63
82 0.63
83 0.68
84 0.69
85 0.68
86 0.68
87 0.68
88 0.66
89 0.67
90 0.71
91 0.66
92 0.61
93 0.56
94 0.54
95 0.51
96 0.46
97 0.43
98 0.38
99 0.38
100 0.36
101 0.37
102 0.35
103 0.36
104 0.34
105 0.37
106 0.44
107 0.43
108 0.42
109 0.47
110 0.47
111 0.48
112 0.48
113 0.45
114 0.47
115 0.48
116 0.49
117 0.45
118 0.47
119 0.43
120 0.45
121 0.46
122 0.45
123 0.44
124 0.44
125 0.41
126 0.38
127 0.37
128 0.34
129 0.29
130 0.21
131 0.21
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.1
144 0.12
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.18
152 0.18
153 0.21
154 0.26
155 0.25
156 0.26
157 0.26
158 0.25
159 0.23
160 0.21
161 0.21
162 0.19
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.14
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.14
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.24
195 0.25
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.24
200 0.27
201 0.33
202 0.28
203 0.28
204 0.29
205 0.32
206 0.3
207 0.28
208 0.26
209 0.21
210 0.27
211 0.29
212 0.27
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.21
217 0.21
218 0.14
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.2
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.17
231 0.19
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.17
241 0.2
242 0.22
243 0.25
244 0.25
245 0.27
246 0.27
247 0.25
248 0.21
249 0.18
250 0.16
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.14
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.18
281 0.2
282 0.22
283 0.19
284 0.15
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.17
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.13
318 0.14
319 0.16
320 0.2
321 0.2
322 0.22
323 0.22
324 0.22
325 0.19
326 0.18
327 0.16
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.1
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.19
338 0.21
339 0.26
340 0.35
341 0.4
342 0.41
343 0.44
344 0.45
345 0.43
346 0.42
347 0.39
348 0.35
349 0.29
350 0.27
351 0.24
352 0.22
353 0.19
354 0.17
355 0.16
356 0.11
357 0.15
358 0.17
359 0.24
360 0.25
361 0.25
362 0.23
363 0.23
364 0.22
365 0.2
366 0.18
367 0.12
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.11
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.18
382 0.17
383 0.18
384 0.22
385 0.21
386 0.23
387 0.26
388 0.24
389 0.24
390 0.24
391 0.24
392 0.19
393 0.18
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.16
398 0.17
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.16
403 0.11
404 0.11
405 0.14
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.2
410 0.22
411 0.21
412 0.2
413 0.17
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.08
419 0.07
420 0.09
421 0.11
422 0.1
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.12
427 0.14
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.2
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.24
437 0.24
438 0.26
439 0.29
440 0.25
441 0.24
442 0.29
443 0.31
444 0.27
445 0.3
446 0.29
447 0.26
448 0.26
449 0.24
450 0.17
451 0.15
452 0.15
453 0.11
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.07
459 0.09
460 0.11
461 0.16
462 0.18
463 0.21
464 0.22
465 0.25
466 0.24
467 0.24
468 0.21
469 0.18
470 0.17
471 0.14
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.19
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.15
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.09
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.16
505 0.17
506 0.18
507 0.27
508 0.3
509 0.33
510 0.35
511 0.35
512 0.32
513 0.32
514 0.32
515 0.25
516 0.21
517 0.18
518 0.16
519 0.15
520 0.11
521 0.09
522 0.06
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.03
530 0.04
531 0.04
532 0.06
533 0.06
534 0.08
535 0.09
536 0.1
537 0.14
538 0.15
539 0.16
540 0.15
541 0.15
542 0.13
543 0.14
544 0.17
545 0.17
546 0.17
547 0.22
548 0.22
549 0.22
550 0.23
551 0.21
552 0.19
553 0.16
554 0.14
555 0.1
556 0.15
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.18
563 0.18
564 0.15
565 0.14
566 0.19
567 0.23
568 0.3
569 0.3
570 0.31
571 0.34
572 0.4
573 0.4
574 0.38
575 0.33
576 0.29
577 0.33
578 0.31
579 0.31
580 0.25
581 0.25
582 0.21
583 0.22
584 0.2
585 0.17
586 0.21
587 0.17
588 0.16
589 0.17
590 0.18
591 0.17
592 0.18
593 0.23
594 0.2
595 0.2
596 0.2
597 0.17
598 0.2
599 0.21
600 0.23
601 0.19
602 0.21
603 0.2
604 0.22
605 0.22
606 0.19
607 0.17
608 0.17
609 0.2
610 0.19
611 0.19
612 0.18
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.14
617 0.11
618 0.12
619 0.14
620 0.12
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.15
625 0.14
626 0.13
627 0.12
628 0.13
629 0.17
630 0.16
631 0.2
632 0.22
633 0.22
634 0.21
635 0.22
636 0.22
637 0.21
638 0.21
639 0.21
640 0.22
641 0.23
642 0.27
643 0.26
644 0.25
645 0.22
646 0.22
647 0.17
648 0.13
649 0.12
650 0.09
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.09
656 0.1
657 0.1
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.11
662 0.11
663 0.11
664 0.16
665 0.18
666 0.19
667 0.19
668 0.19
669 0.16
670 0.17
671 0.18
672 0.13
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.07
680 0.06
681 0.05
682 0.06
683 0.07
684 0.12
685 0.14
686 0.16
687 0.23
688 0.27
689 0.31
690 0.38
691 0.48
692 0.53
693 0.6
694 0.64
695 0.65
696 0.64
697 0.68
698 0.65
699 0.57
700 0.47
701 0.4
702 0.38
703 0.34
704 0.37
705 0.3
706 0.27
707 0.24
708 0.24
709 0.23
710 0.22
711 0.18
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.08
722 0.12
723 0.13
724 0.18
725 0.22
726 0.27
727 0.33
728 0.36
729 0.4
730 0.41
731 0.43
732 0.42
733 0.45
734 0.47
735 0.44
736 0.42
737 0.4
738 0.36
739 0.33
740 0.29
741 0.23
742 0.17
743 0.12
744 0.1
745 0.08
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.1
750 0.11
751 0.12
752 0.14
753 0.13
754 0.14
755 0.16
756 0.18
757 0.25
758 0.27
759 0.31
760 0.39
761 0.4
762 0.42
763 0.49
764 0.52
765 0.45
766 0.47
767 0.44
768 0.37
769 0.36
770 0.34
771 0.25
772 0.22
773 0.21
774 0.2
775 0.18
776 0.16
777 0.2
778 0.21
779 0.25
780 0.32
781 0.4
782 0.42
783 0.51
784 0.59
785 0.62
786 0.68
787 0.65
788 0.64
789 0.55
790 0.52
791 0.44
792 0.37
793 0.31
794 0.24