Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ATS3

Protein Details
Accession H2ATS3    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-94TIESEEPSKKRHKKKSTNDESDHLEHydrophilic
337-363ITATNKKSRNLRISRCKNMKKTQDSTSHydrophilic
404-436RATKGDNKTLKLKKKKQRSKTGRVTKRSIAFKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-84KKRHKKK
378-398KMGRARKALGKADKAALGKEL
401-443EGTRATKGDNKTLKLKKKKQRSKTGRVTKRSIAFKEASKKKDA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0D01270  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MSSIDNLFGSVDSSKVESTVSKLFDASNEKKVDDALSIKSRLRTILPTVTKRTNDKVESNEEESEATTGTIESEEPSKKRHKKKSTNDESDHLEEKYFAKLLKEDSEDKEETADLNKSSNEKTVKSQETKAKKIDLREDDLEKAERTLFVGNLTSEAIISKSIYKEFKNLFATIPKISEDDVETTNDEDFLVIESIRFRSISFDEALPRKVAFVRQKLHKSRQSVNAYIVYKNKKSIKPIISALNGKVFHNRHLKVDSVTHPAPHDKKRSIFVGNLDFEEDEESLWNHFSKCGEIEYVRIIRDSKTNLGKGFAYVQFSDLSSVNKALLLNNKPMASITATNKKSRNLRISRCKNMKKTQDSTSKSGKFSNLSEAQKTKMGRARKALGKADKAALGKELTIEGTRATKGDNKTLKLKKKKQRSKTGRVTKRSIAFKEASKKKDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.15
6 0.21
7 0.22
8 0.21
9 0.21
10 0.22
11 0.26
12 0.34
13 0.34
14 0.37
15 0.37
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.32
20 0.27
21 0.25
22 0.24
23 0.28
24 0.32
25 0.34
26 0.37
27 0.37
28 0.35
29 0.35
30 0.33
31 0.33
32 0.39
33 0.44
34 0.48
35 0.53
36 0.58
37 0.6
38 0.61
39 0.62
40 0.6
41 0.57
42 0.56
43 0.55
44 0.56
45 0.57
46 0.56
47 0.5
48 0.42
49 0.37
50 0.32
51 0.26
52 0.19
53 0.13
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.12
61 0.17
62 0.18
63 0.24
64 0.34
65 0.44
66 0.54
67 0.64
68 0.7
69 0.76
70 0.86
71 0.92
72 0.93
73 0.94
74 0.88
75 0.81
76 0.76
77 0.7
78 0.61
79 0.5
80 0.39
81 0.3
82 0.26
83 0.24
84 0.19
85 0.16
86 0.15
87 0.17
88 0.19
89 0.23
90 0.27
91 0.28
92 0.3
93 0.36
94 0.35
95 0.33
96 0.31
97 0.26
98 0.22
99 0.21
100 0.19
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.29
110 0.36
111 0.42
112 0.44
113 0.5
114 0.52
115 0.58
116 0.62
117 0.6
118 0.59
119 0.54
120 0.56
121 0.58
122 0.54
123 0.52
124 0.5
125 0.49
126 0.43
127 0.42
128 0.38
129 0.29
130 0.25
131 0.19
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.12
150 0.15
151 0.16
152 0.22
153 0.23
154 0.29
155 0.3
156 0.3
157 0.28
158 0.28
159 0.29
160 0.24
161 0.23
162 0.18
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.2
199 0.22
200 0.27
201 0.32
202 0.39
203 0.48
204 0.54
205 0.62
206 0.61
207 0.6
208 0.59
209 0.63
210 0.6
211 0.53
212 0.49
213 0.46
214 0.42
215 0.39
216 0.39
217 0.34
218 0.29
219 0.33
220 0.38
221 0.34
222 0.38
223 0.45
224 0.43
225 0.43
226 0.45
227 0.45
228 0.41
229 0.41
230 0.36
231 0.33
232 0.3
233 0.26
234 0.29
235 0.25
236 0.28
237 0.34
238 0.34
239 0.32
240 0.33
241 0.34
242 0.29
243 0.33
244 0.3
245 0.28
246 0.28
247 0.25
248 0.25
249 0.3
250 0.33
251 0.36
252 0.39
253 0.37
254 0.39
255 0.41
256 0.44
257 0.41
258 0.37
259 0.35
260 0.35
261 0.32
262 0.29
263 0.27
264 0.23
265 0.2
266 0.19
267 0.14
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.07
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.21
290 0.23
291 0.24
292 0.28
293 0.31
294 0.31
295 0.32
296 0.31
297 0.28
298 0.3
299 0.25
300 0.22
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.17
305 0.18
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.2
315 0.22
316 0.25
317 0.28
318 0.28
319 0.26
320 0.26
321 0.25
322 0.21
323 0.22
324 0.24
325 0.31
326 0.34
327 0.39
328 0.42
329 0.47
330 0.51
331 0.55
332 0.59
333 0.6
334 0.67
335 0.73
336 0.8
337 0.85
338 0.87
339 0.88
340 0.87
341 0.87
342 0.87
343 0.85
344 0.81
345 0.8
346 0.79
347 0.76
348 0.72
349 0.73
350 0.68
351 0.61
352 0.59
353 0.53
354 0.46
355 0.42
356 0.44
357 0.42
358 0.41
359 0.45
360 0.43
361 0.42
362 0.43
363 0.42
364 0.41
365 0.39
366 0.43
367 0.43
368 0.49
369 0.55
370 0.58
371 0.65
372 0.66
373 0.68
374 0.66
375 0.64
376 0.59
377 0.55
378 0.49
379 0.42
380 0.35
381 0.28
382 0.22
383 0.2
384 0.17
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.12
389 0.14
390 0.15
391 0.14
392 0.16
393 0.21
394 0.24
395 0.33
396 0.39
397 0.41
398 0.5
399 0.6
400 0.68
401 0.72
402 0.79
403 0.8
404 0.84
405 0.9
406 0.91
407 0.93
408 0.93
409 0.93
410 0.94
411 0.95
412 0.94
413 0.92
414 0.88
415 0.85
416 0.83
417 0.81
418 0.74
419 0.7
420 0.63
421 0.63
422 0.66
423 0.67