Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ATJ4

Protein Details
Accession H2ATJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-141AIREANNFKVKRRKKRDKKGGKGKTQRIKRDRVLDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-135KVKRRKKRDKKGGKGKTQRIKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG kaf:KAFR_0D00470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MVLTRGKGSKPPVVEEEEEDHSVEMNGSNDEDEEHLYHNIDDLKRLIGSDDGGETDDIASDYSNESDYSRVSAEDGYNSSDEDSLLAVFSDYGEVSEDDEENFMDAIREANNFKVKRRKKRDKKGGKGKTQRIKRDRVLDPEVAQLLSEANEAFVRNDLVVAERLYNEIIKKDPRNFAAYETLGDIYHLQGRLNDCCNSWFLAAHINSSDWEFWKIVAILSADLEHYRQAIYCFSRVININHEEWEALYRRSILYKKIGQIGKALEGFQKLYKNNPFDANILRELAILYVDYDRVNDAIDLYMKVYDTNIKRREAIEKASENALESSGDENNEADFSQDEEKEDDLQLDSQIEEMAAYPDVNWKKINKKFKCIPFDWSSLNILAELFLKLTVGSNSGIKTIKSCARWIQHRELQTFWDDVTDDSEFDERRIKNSRYDSLTDVEKAKSYTLPIDIRIRLGLLRLNNENFIEALNHFQFLYDEPFSDISDLHFEAALALTKAEKFQEAIDFFQPLLGFSDYRTVELFENLARCYKETENYESAKTYYELAVEQAPTVLEHKLNLAEVHYHLGNNDVFKSMLAEVTEMKKRQEAELYGSVEKVPETTISTQNQKDVSSKPLLEDSMFRQFHGKRKRTPQDLEREKIERERKITSKVVNKFKSLKELETGVKMGNERDISTWIDNVSDLVDVFSSVKNFFVRSRSKKFVGIIRRTKRFNTVLDYQLERLSKLSEGEPLGDGLPLMEERVTLTSTTELRGLTYDQWFELFMDLSLTLTKFQSVEDGLSVVETAQEVNVFVQNPERAKVMKFVKLAIVLQLQDEEELAENLRGLLNQFQFNRKVLQIFMYSLSQGQSSLNILSSTVQQKFFLRQLKAFDSCRFNTHVNGQASITNKEVDNPERKSSPYLYYIYAVLLYSSKGFLSSLQYLNWLDKDIPDDPMVNLLMGLAHIHRSMQRLTASRHFQILHGLRYLYRYYDLRQKCYSVLEKQEADYNIGRAFHLIGLTSIAVFYYNKVLNNYDDRKLKRHAAYNSLIIYQESGNTELANYTMEKYLSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.43
4 0.41
5 0.39
6 0.34
7 0.29
8 0.23
9 0.21
10 0.18
11 0.14
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.18
26 0.23
27 0.21
28 0.23
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.2
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.16
60 0.16
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.17
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.18
98 0.27
99 0.28
100 0.36
101 0.45
102 0.54
103 0.63
104 0.73
105 0.79
106 0.82
107 0.92
108 0.95
109 0.96
110 0.97
111 0.97
112 0.96
113 0.96
114 0.95
115 0.94
116 0.93
117 0.91
118 0.91
119 0.88
120 0.87
121 0.84
122 0.82
123 0.79
124 0.77
125 0.74
126 0.67
127 0.6
128 0.55
129 0.49
130 0.39
131 0.32
132 0.23
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.19
157 0.25
158 0.32
159 0.38
160 0.43
161 0.44
162 0.47
163 0.46
164 0.45
165 0.44
166 0.38
167 0.32
168 0.28
169 0.25
170 0.21
171 0.2
172 0.17
173 0.11
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.18
179 0.22
180 0.26
181 0.26
182 0.22
183 0.23
184 0.25
185 0.24
186 0.21
187 0.17
188 0.13
189 0.2
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.2
197 0.13
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.22
223 0.24
224 0.25
225 0.27
226 0.27
227 0.27
228 0.27
229 0.27
230 0.23
231 0.2
232 0.22
233 0.18
234 0.15
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.2
239 0.22
240 0.23
241 0.28
242 0.33
243 0.36
244 0.43
245 0.44
246 0.39
247 0.41
248 0.39
249 0.35
250 0.31
251 0.28
252 0.22
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.25
257 0.21
258 0.28
259 0.34
260 0.35
261 0.36
262 0.39
263 0.38
264 0.35
265 0.39
266 0.35
267 0.29
268 0.26
269 0.24
270 0.2
271 0.18
272 0.15
273 0.11
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.15
294 0.18
295 0.27
296 0.31
297 0.32
298 0.34
299 0.36
300 0.42
301 0.39
302 0.39
303 0.38
304 0.35
305 0.36
306 0.35
307 0.34
308 0.28
309 0.25
310 0.2
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.12
347 0.13
348 0.15
349 0.17
350 0.2
351 0.29
352 0.37
353 0.48
354 0.46
355 0.54
356 0.62
357 0.68
358 0.73
359 0.65
360 0.65
361 0.59
362 0.58
363 0.51
364 0.44
365 0.37
366 0.29
367 0.27
368 0.2
369 0.14
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.2
389 0.2
390 0.22
391 0.26
392 0.32
393 0.4
394 0.44
395 0.49
396 0.48
397 0.52
398 0.51
399 0.46
400 0.41
401 0.36
402 0.3
403 0.21
404 0.17
405 0.12
406 0.1
407 0.12
408 0.1
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.17
415 0.15
416 0.19
417 0.26
418 0.27
419 0.32
420 0.37
421 0.42
422 0.39
423 0.42
424 0.4
425 0.35
426 0.35
427 0.3
428 0.27
429 0.22
430 0.19
431 0.17
432 0.15
433 0.13
434 0.12
435 0.12
436 0.14
437 0.15
438 0.17
439 0.21
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.18
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.1
448 0.13
449 0.15
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.13
455 0.12
456 0.1
457 0.07
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.13
466 0.1
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.1
473 0.07
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.07
481 0.06
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.13
499 0.09
500 0.1
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.14
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.13
519 0.14
520 0.17
521 0.19
522 0.24
523 0.25
524 0.27
525 0.27
526 0.25
527 0.24
528 0.21
529 0.18
530 0.14
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.07
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.12
570 0.16
571 0.15
572 0.16
573 0.17
574 0.18
575 0.19
576 0.21
577 0.19
578 0.21
579 0.25
580 0.28
581 0.25
582 0.25
583 0.23
584 0.2
585 0.18
586 0.13
587 0.08
588 0.06
589 0.08
590 0.11
591 0.15
592 0.18
593 0.23
594 0.23
595 0.26
596 0.26
597 0.24
598 0.24
599 0.22
600 0.24
601 0.22
602 0.22
603 0.2
604 0.21
605 0.2
606 0.18
607 0.18
608 0.17
609 0.23
610 0.23
611 0.22
612 0.26
613 0.29
614 0.37
615 0.46
616 0.48
617 0.46
618 0.57
619 0.66
620 0.68
621 0.72
622 0.72
623 0.72
624 0.74
625 0.69
626 0.63
627 0.57
628 0.51
629 0.52
630 0.5
631 0.43
632 0.38
633 0.41
634 0.4
635 0.43
636 0.47
637 0.46
638 0.48
639 0.53
640 0.59
641 0.56
642 0.57
643 0.57
644 0.53
645 0.55
646 0.48
647 0.41
648 0.34
649 0.34
650 0.31
651 0.28
652 0.27
653 0.19
654 0.18
655 0.17
656 0.15
657 0.15
658 0.14
659 0.13
660 0.13
661 0.14
662 0.15
663 0.16
664 0.16
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.1
669 0.09
670 0.06
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.09
680 0.09
681 0.11
682 0.12
683 0.19
684 0.28
685 0.35
686 0.43
687 0.47
688 0.49
689 0.52
690 0.53
691 0.54
692 0.54
693 0.56
694 0.59
695 0.61
696 0.66
697 0.65
698 0.63
699 0.63
700 0.57
701 0.5
702 0.46
703 0.43
704 0.41
705 0.41
706 0.41
707 0.35
708 0.34
709 0.31
710 0.25
711 0.2
712 0.17
713 0.14
714 0.14
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.15
719 0.14
720 0.14
721 0.13
722 0.11
723 0.1
724 0.06
725 0.07
726 0.05
727 0.05
728 0.04
729 0.04
730 0.05
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.08
735 0.1
736 0.11
737 0.12
738 0.13
739 0.11
740 0.11
741 0.12
742 0.13
743 0.13
744 0.15
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.13
751 0.1
752 0.07
753 0.08
754 0.07
755 0.07
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.08
760 0.09
761 0.08
762 0.08
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.09
767 0.1
768 0.09
769 0.09
770 0.08
771 0.06
772 0.05
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.05
778 0.06
779 0.08
780 0.08
781 0.08
782 0.13
783 0.16
784 0.17
785 0.18
786 0.19
787 0.18
788 0.19
789 0.27
790 0.28
791 0.31
792 0.3
793 0.3
794 0.31
795 0.32
796 0.31
797 0.26
798 0.24
799 0.18
800 0.17
801 0.17
802 0.14
803 0.12
804 0.11
805 0.09
806 0.07
807 0.07
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.13
816 0.15
817 0.2
818 0.22
819 0.27
820 0.3
821 0.31
822 0.34
823 0.3
824 0.28
825 0.24
826 0.25
827 0.22
828 0.21
829 0.22
830 0.2
831 0.18
832 0.17
833 0.17
834 0.14
835 0.12
836 0.11
837 0.09
838 0.1
839 0.1
840 0.1
841 0.1
842 0.1
843 0.1
844 0.15
845 0.2
846 0.22
847 0.22
848 0.23
849 0.25
850 0.29
851 0.35
852 0.38
853 0.35
854 0.35
855 0.4
856 0.45
857 0.49
858 0.48
859 0.47
860 0.46
861 0.45
862 0.44
863 0.43
864 0.38
865 0.36
866 0.38
867 0.41
868 0.36
869 0.36
870 0.33
871 0.32
872 0.33
873 0.32
874 0.27
875 0.2
876 0.19
877 0.2
878 0.24
879 0.28
880 0.33
881 0.36
882 0.4
883 0.4
884 0.42
885 0.44
886 0.43
887 0.41
888 0.37
889 0.35
890 0.32
891 0.31
892 0.3
893 0.26
894 0.23
895 0.18
896 0.13
897 0.11
898 0.1
899 0.09
900 0.09
901 0.08
902 0.08
903 0.08
904 0.1
905 0.15
906 0.2
907 0.2
908 0.2
909 0.24
910 0.24
911 0.27
912 0.26
913 0.22
914 0.17
915 0.17
916 0.21
917 0.19
918 0.21
919 0.2
920 0.2
921 0.18
922 0.21
923 0.2
924 0.15
925 0.13
926 0.1
927 0.09
928 0.08
929 0.09
930 0.06
931 0.07
932 0.08
933 0.09
934 0.12
935 0.15
936 0.17
937 0.2
938 0.25
939 0.29
940 0.35
941 0.43
942 0.47
943 0.45
944 0.49
945 0.45
946 0.4
947 0.45
948 0.44
949 0.38
950 0.34
951 0.34
952 0.3
953 0.33
954 0.34
955 0.26
956 0.25
957 0.24
958 0.25
959 0.35
960 0.4
961 0.43
962 0.45
963 0.46
964 0.43
965 0.48
966 0.51
967 0.49
968 0.51
969 0.52
970 0.5
971 0.48
972 0.53
973 0.46
974 0.44
975 0.39
976 0.33
977 0.28
978 0.27
979 0.26
980 0.2
981 0.2
982 0.16
983 0.15
984 0.13
985 0.1
986 0.11
987 0.11
988 0.1
989 0.09
990 0.07
991 0.08
992 0.08
993 0.09
994 0.15
995 0.17
996 0.2
997 0.22
998 0.25
999 0.29
1000 0.38
1001 0.42
1002 0.43
1003 0.49
1004 0.51
1005 0.54
1006 0.59
1007 0.63
1008 0.61
1009 0.64
1010 0.63
1011 0.63
1012 0.64
1013 0.64
1014 0.6
1015 0.53
1016 0.46
1017 0.37
1018 0.32
1019 0.24
1020 0.22
1021 0.18
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.12
1031 0.14