FuNGI

H2AMD6

Protein Details

Accession

H2AMD6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-86	NHNPKKFSISGKKNTPKRSGTKPQLST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 9, cyto_nucl 7.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	kaf:KAFR_0A00980 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd21601 RRM1_PES4_MIP6 cd21602 RRM2_PES4_MIP6 cd21603 RRM3_PES4_MIP6

Amino Acid Sequences

MSTSFSQRLNILNNLSINKLQQNAERSLKQKVEGSMIDLSEEIKMPSKNSENFENQEDINHNPKKFSISGKKNTPKRSGTKPQLSTDFKSQKKVTPLFIGGLGPHVTESMLKELFNKFSSLYSVKICYDSETKKSLGYGYLNFSGSDEIDRVIEEFNYTEVFGSEIKIMPSLRNSLYRKNIGTNIFFSNLPLENSELTTRVFYDTFKKYGKILSCKLDHRKNIGFVYYEDDKVAREVIEKYNNTTFFGAKILCGLHFDKELRNFPDFEKRKSYLDKHIILEDELNTVEGKTSMLTKIKSSLPHPNAVFVKNLPIDTTEDEILDFFSVVGPVKSVFTSKVLKFKSEWAFITYKKGSDTERAIEELDGKKYKDRKISVTKAKARQQQHHHHQQQQQQQQQPIVKKASTKTTIQLNNLSTICTKEFLVELCIQEHLKFDRLKITEYEPDSGTFKGFATFKTKDDAKKFYNYLNGKLVGGSVINATFAAAKTNIGEADGKESANSETQGSASHFSMTKPQFPMPLQYFNPYYWGPPQGVHTRNVLPLYRNVQEMPTSNFFRQKSEHVTDTLKRQIKRAINYLKIQIIVKEKNLNCIAEYIVNVFWCGDLTNLSRYLLLLNTNIHYEEILHRQIEEAISKLGFTKGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.36
3	0.33
4	0.31
5	0.3
6	0.31
7	0.3
8	0.32
9	0.36
10	0.4
11	0.45
12	0.48
13	0.47
14	0.52
15	0.51
16	0.49
17	0.49
18	0.44
19	0.44
20	0.38
21	0.4
22	0.35
23	0.32
24	0.29
25	0.24
26	0.21
27	0.16
28	0.16
29	0.13
30	0.14
31	0.16
32	0.16
33	0.24
34	0.3
35	0.35
36	0.38
37	0.44
38	0.46
39	0.49
40	0.51
41	0.47
42	0.4
43	0.38
44	0.36
45	0.33
46	0.36
47	0.39
48	0.36
49	0.34
50	0.35
51	0.37
52	0.37
53	0.43
54	0.44
55	0.48
56	0.57
57	0.67
58	0.76
59	0.79
60	0.84
61	0.83
62	0.81
63	0.78
64	0.79
65	0.79
66	0.8
67	0.81
68	0.79
69	0.77
70	0.77
71	0.76
72	0.7
73	0.7
74	0.69
75	0.61
76	0.64
77	0.6
78	0.57
79	0.61
80	0.6
81	0.54
82	0.51
83	0.5
84	0.43
85	0.42
86	0.36
87	0.26
88	0.25
89	0.21
90	0.14
91	0.12
92	0.1
93	0.09
94	0.1
95	0.11
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.17
100	0.2
101	0.23
102	0.23
103	0.22
104	0.18
105	0.18
106	0.23
107	0.22
108	0.21
109	0.21
110	0.23
111	0.23
112	0.24
113	0.23
114	0.22
115	0.27
116	0.29
117	0.31
118	0.32
119	0.31
120	0.3
121	0.31
122	0.28
123	0.25
124	0.24
125	0.23
126	0.24
127	0.26
128	0.26
129	0.25
130	0.24
131	0.21
132	0.18
133	0.16
134	0.12
135	0.09
136	0.08
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.08
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.1
154	0.12
155	0.12
156	0.13
157	0.15
158	0.18
159	0.18
160	0.26
161	0.29
162	0.34
163	0.41
164	0.45
165	0.44
166	0.44
167	0.48
168	0.43
169	0.43
170	0.38
171	0.34
172	0.31
173	0.29
174	0.25
175	0.22
176	0.19
177	0.17
178	0.15
179	0.13
180	0.12
181	0.14
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.17
191	0.2
192	0.24
193	0.25
194	0.26
195	0.25
196	0.3
197	0.36
198	0.36
199	0.37
200	0.39
201	0.43
202	0.49
203	0.57
204	0.59
205	0.57
206	0.56
207	0.55
208	0.53
209	0.5
210	0.44
211	0.36
212	0.29
213	0.31
214	0.26
215	0.23
216	0.18
217	0.17
218	0.15
219	0.14
220	0.14
221	0.09
222	0.09
223	0.11
224	0.16
225	0.23
226	0.23
227	0.26
228	0.3
229	0.31
230	0.3
231	0.28
232	0.24
233	0.17
234	0.19
235	0.15
236	0.1
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.11
241	0.12
242	0.11
243	0.13
244	0.14
245	0.16
246	0.21
247	0.25
248	0.26
249	0.26
250	0.26
251	0.26
252	0.36
253	0.35
254	0.35
255	0.37
256	0.36
257	0.38
258	0.44
259	0.46
260	0.45
261	0.49
262	0.49
263	0.43
264	0.43
265	0.4
266	0.34
267	0.3
268	0.21
269	0.14
270	0.1
271	0.09
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.05
277	0.04
278	0.06
279	0.08
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.15
284	0.18
285	0.2
286	0.22
287	0.3
288	0.29
289	0.34
290	0.34
291	0.35
292	0.34
293	0.33
294	0.31
295	0.21
296	0.23
297	0.18
298	0.18
299	0.13
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.15
304	0.11
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.07
310	0.05
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.09
323	0.15
324	0.16
325	0.24
326	0.24
327	0.25
328	0.25
329	0.32
330	0.34
331	0.32
332	0.31
333	0.28
334	0.3
335	0.29
336	0.35
337	0.28
338	0.24
339	0.21
340	0.22
341	0.2
342	0.22
343	0.24
344	0.2
345	0.2
346	0.2
347	0.19
348	0.18
349	0.21
350	0.18
351	0.19
352	0.19
353	0.18
354	0.22
355	0.28
356	0.32
357	0.36
358	0.37
359	0.42
360	0.5
361	0.59
362	0.64
363	0.68
364	0.72
365	0.72
366	0.76
367	0.75
368	0.71
369	0.7
370	0.7
371	0.71
372	0.72
373	0.75
374	0.74
375	0.75
376	0.76
377	0.75
378	0.74
379	0.72
380	0.7
381	0.64
382	0.6
383	0.56
384	0.54
385	0.5
386	0.46
387	0.41
388	0.35
389	0.33
390	0.33
391	0.37
392	0.35
393	0.33
394	0.31
395	0.37
396	0.4
397	0.39
398	0.41
399	0.34
400	0.35
401	0.34
402	0.31
403	0.23
404	0.21
405	0.19
406	0.15
407	0.14
408	0.1
409	0.11
410	0.1
411	0.13
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.15
416	0.14
417	0.14
418	0.16
419	0.14
420	0.18
421	0.18
422	0.18
423	0.24
424	0.25
425	0.27
426	0.26
427	0.29
428	0.3
429	0.31
430	0.33
431	0.26
432	0.26
433	0.26
434	0.24
435	0.2
436	0.14
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.19
442	0.21
443	0.21
444	0.26
445	0.3
446	0.34
447	0.39
448	0.44
449	0.41
450	0.46
451	0.47
452	0.44
453	0.49
454	0.45
455	0.44
456	0.42
457	0.39
458	0.32
459	0.3
460	0.27
461	0.18
462	0.16
463	0.11
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.09
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.11
479	0.09
480	0.15
481	0.15
482	0.14
483	0.13
484	0.15
485	0.15
486	0.16
487	0.16
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.13
492	0.14
493	0.15
494	0.14
495	0.15
496	0.15
497	0.15
498	0.24
499	0.25
500	0.29
501	0.3
502	0.31
503	0.34
504	0.34
505	0.42
506	0.38
507	0.42
508	0.38
509	0.39
510	0.4
511	0.35
512	0.38
513	0.3
514	0.28
515	0.24
516	0.26
517	0.22
518	0.21
519	0.27
520	0.32
521	0.34
522	0.34
523	0.34
524	0.34
525	0.37
526	0.39
527	0.36
528	0.29
529	0.33
530	0.36
531	0.34
532	0.33
533	0.3
534	0.28
535	0.29
536	0.29
537	0.3
538	0.31
539	0.33
540	0.34
541	0.4
542	0.39
543	0.4
544	0.41
545	0.4
546	0.43
547	0.44
548	0.44
549	0.41
550	0.47
551	0.47
552	0.5
553	0.54
554	0.51
555	0.46
556	0.48
557	0.53
558	0.55
559	0.57
560	0.6
561	0.6
562	0.61
563	0.65
564	0.65
565	0.59
566	0.54
567	0.49
568	0.43
569	0.42
570	0.39
571	0.39
572	0.43
573	0.41
574	0.47
575	0.49
576	0.45
577	0.38
578	0.35
579	0.32
580	0.25
581	0.25
582	0.19
583	0.17
584	0.16
585	0.16
586	0.14
587	0.12
588	0.1
589	0.1
590	0.08
591	0.1
592	0.13
593	0.16
594	0.18
595	0.18
596	0.18
597	0.18
598	0.19
599	0.17
600	0.17
601	0.16
602	0.17
603	0.18
604	0.2
605	0.2
606	0.19
607	0.17
608	0.17
609	0.19
610	0.23
611	0.26
612	0.24
613	0.24
614	0.24
615	0.26
616	0.27
617	0.24
618	0.19
619	0.18
620	0.18
621	0.18
622	0.18

H2AMD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer