Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AMX1

Protein Details
Accession H2AMX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
828-847LSKLEEKRRDHDRRENGFKHBasic
973-1000DYTKNRNDGMRNNRSRNRSRYSRTIPGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR018885  mRNA-bd_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0A02850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10567  Nab6_mRNP_bdg  
PF10378  RRM  
Amino Acid Sequences MMRPSYSRKNSGFHIYQSQQPAQDQYYSAFDTTNPLMSYPQFEQPYGATFPPPLSSSTHFQQTYYKGSPLPNAPPTPFDTAYGATLLPSHLLMGSPFISSPNVPTPQQQYFLQQQFNTNNNNGSSTPRKSFFKVSNRPISSRSSRFSEKRKSFIINNPTTNNSNNNNNNKEILEKLFTEPINISYVILPKGDDAYRTRSLLFENVDNAINLHSFITNFVKNNSIESIYLVPNKNDSNTCDIILSFLSRHICLDFYNNVLQRLKEFKKHLNSESLNLNFVSLKYNKTTRDNQGPSLEFNIVTRDATRSLAIELCSNENDSLILEKEQLFEKILNEILRTDENKRYVLESIDLVSTDKSNKEFGKNYAILSFLNITMAIEIMDYIQVISSKLNIGKCSFVTIQPLIENNVMNNSSALSSATNIQSSVSSEGNNNQNNNGSTFFHKNSINSLLSSESSVSIDEEVISIADKLKGIKLKDISLDILPRDYPEPEFNFSTDHLPNVTISVPTQLDQIPGTPRTQEIYINDMSPSFEGIDMMNSSSTMLSGNGTFISNTPMLIPSQSFYMDQNTQIQEAPFRSNSFIHPITDSLENQLSTSAKVASAMGSDAGNRTIYIGNINPRSKAEDICNVVRGGILQSIKFIESKHICFVTFIEAAAAVQFYANAFIDPIVLHGNTLKLGWGNYSGPLPKSIALAVTIGASRNVYVSLPEFAFKDKYINDPEFKEYHEKFKLPDPEQLRIDFSSYGPTEQINYLSDSHCCWVNFMNISSAIKLVEEATNDFDRFNEKFDERYNGLVINYGKDRCGNINKNLIAGKNSRFYKIRQNHNFKLSKLEEKRRDHDRRENGFKHVYNDEETIYNESMETDNQHNEESKENDGKFLQLDSLGISLESKNEIADDINDALTVDQFENEKSITKNNGFENTSFHSDSSSDIELIINSPNSLRTKDNDVLDSEKIINSANTTNRTGNANGYKNDYTKNRNDGMRNNRSRNRSRYSRTIPGSDVMAQYLAQLQHSTFMYAANILGASGEEEYYDEAELPTVNED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.53
4 0.56
5 0.55
6 0.48
7 0.46
8 0.45
9 0.38
10 0.38
11 0.33
12 0.28
13 0.29
14 0.27
15 0.25
16 0.21
17 0.19
18 0.21
19 0.22
20 0.24
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.27
26 0.25
27 0.31
28 0.28
29 0.28
30 0.29
31 0.28
32 0.32
33 0.3
34 0.27
35 0.21
36 0.2
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.19
41 0.2
42 0.24
43 0.28
44 0.32
45 0.39
46 0.36
47 0.36
48 0.42
49 0.41
50 0.45
51 0.43
52 0.41
53 0.36
54 0.38
55 0.44
56 0.43
57 0.46
58 0.45
59 0.45
60 0.44
61 0.44
62 0.46
63 0.47
64 0.42
65 0.36
66 0.31
67 0.28
68 0.28
69 0.26
70 0.21
71 0.14
72 0.14
73 0.12
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.17
88 0.21
89 0.24
90 0.25
91 0.29
92 0.35
93 0.37
94 0.41
95 0.38
96 0.36
97 0.42
98 0.47
99 0.48
100 0.42
101 0.45
102 0.48
103 0.51
104 0.51
105 0.44
106 0.42
107 0.37
108 0.38
109 0.32
110 0.33
111 0.36
112 0.36
113 0.39
114 0.4
115 0.44
116 0.45
117 0.52
118 0.54
119 0.58
120 0.63
121 0.66
122 0.72
123 0.73
124 0.72
125 0.67
126 0.66
127 0.64
128 0.6
129 0.55
130 0.51
131 0.55
132 0.59
133 0.66
134 0.69
135 0.67
136 0.66
137 0.67
138 0.65
139 0.64
140 0.66
141 0.67
142 0.64
143 0.63
144 0.6
145 0.59
146 0.57
147 0.52
148 0.5
149 0.43
150 0.45
151 0.48
152 0.54
153 0.54
154 0.53
155 0.52
156 0.46
157 0.44
158 0.38
159 0.32
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.28
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.23
168 0.22
169 0.2
170 0.18
171 0.15
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.23
182 0.27
183 0.28
184 0.27
185 0.25
186 0.26
187 0.28
188 0.27
189 0.22
190 0.2
191 0.21
192 0.21
193 0.2
194 0.18
195 0.14
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.22
207 0.22
208 0.24
209 0.23
210 0.2
211 0.17
212 0.19
213 0.21
214 0.19
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.27
221 0.26
222 0.26
223 0.26
224 0.26
225 0.26
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.18
230 0.17
231 0.1
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.17
240 0.15
241 0.16
242 0.22
243 0.23
244 0.26
245 0.27
246 0.27
247 0.25
248 0.33
249 0.34
250 0.35
251 0.39
252 0.44
253 0.52
254 0.58
255 0.58
256 0.59
257 0.57
258 0.52
259 0.55
260 0.47
261 0.39
262 0.33
263 0.3
264 0.21
265 0.19
266 0.21
267 0.15
268 0.16
269 0.19
270 0.24
271 0.27
272 0.33
273 0.4
274 0.42
275 0.52
276 0.53
277 0.53
278 0.55
279 0.52
280 0.47
281 0.43
282 0.36
283 0.26
284 0.23
285 0.21
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.15
324 0.17
325 0.2
326 0.23
327 0.24
328 0.25
329 0.26
330 0.25
331 0.24
332 0.23
333 0.2
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.15
345 0.17
346 0.21
347 0.24
348 0.26
349 0.33
350 0.32
351 0.32
352 0.29
353 0.27
354 0.22
355 0.2
356 0.19
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.07
376 0.1
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.19
383 0.18
384 0.16
385 0.19
386 0.18
387 0.18
388 0.17
389 0.18
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.11
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.06
403 0.06
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.14
416 0.21
417 0.23
418 0.22
419 0.21
420 0.23
421 0.23
422 0.24
423 0.21
424 0.16
425 0.17
426 0.21
427 0.21
428 0.22
429 0.22
430 0.21
431 0.23
432 0.26
433 0.23
434 0.19
435 0.19
436 0.16
437 0.16
438 0.16
439 0.13
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.08
457 0.12
458 0.13
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.2
463 0.21
464 0.2
465 0.17
466 0.18
467 0.14
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.1
473 0.1
474 0.13
475 0.15
476 0.17
477 0.18
478 0.17
479 0.18
480 0.18
481 0.2
482 0.17
483 0.15
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.07
490 0.06
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.11
508 0.14
509 0.15
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.05
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.05
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.11
551 0.12
552 0.13
553 0.16
554 0.16
555 0.16
556 0.16
557 0.16
558 0.14
559 0.15
560 0.17
561 0.14
562 0.14
563 0.15
564 0.15
565 0.16
566 0.2
567 0.19
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.18
573 0.17
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.12
578 0.13
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.09
600 0.1
601 0.15
602 0.22
603 0.23
604 0.22
605 0.22
606 0.26
607 0.26
608 0.25
609 0.23
610 0.23
611 0.26
612 0.27
613 0.28
614 0.24
615 0.23
616 0.21
617 0.18
618 0.12
619 0.12
620 0.11
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.11
625 0.12
626 0.11
627 0.15
628 0.18
629 0.2
630 0.22
631 0.23
632 0.22
633 0.22
634 0.22
635 0.19
636 0.16
637 0.14
638 0.11
639 0.1
640 0.1
641 0.09
642 0.08
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.07
659 0.08
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.06
665 0.07
666 0.09
667 0.09
668 0.1
669 0.12
670 0.13
671 0.13
672 0.14
673 0.15
674 0.13
675 0.13
676 0.13
677 0.11
678 0.1
679 0.09
680 0.08
681 0.08
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.07
692 0.09
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.12
697 0.14
698 0.13
699 0.15
700 0.14
701 0.19
702 0.24
703 0.27
704 0.28
705 0.29
706 0.33
707 0.3
708 0.32
709 0.36
710 0.31
711 0.36
712 0.37
713 0.36
714 0.33
715 0.4
716 0.47
717 0.41
718 0.47
719 0.43
720 0.45
721 0.46
722 0.46
723 0.41
724 0.32
725 0.31
726 0.25
727 0.2
728 0.2
729 0.18
730 0.18
731 0.15
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.16
736 0.11
737 0.13
738 0.14
739 0.14
740 0.15
741 0.14
742 0.15
743 0.17
744 0.15
745 0.15
746 0.15
747 0.18
748 0.2
749 0.19
750 0.2
751 0.18
752 0.19
753 0.18
754 0.16
755 0.12
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.1
762 0.14
763 0.16
764 0.17
765 0.16
766 0.15
767 0.18
768 0.18
769 0.19
770 0.2
771 0.19
772 0.21
773 0.24
774 0.3
775 0.27
776 0.29
777 0.27
778 0.23
779 0.22
780 0.24
781 0.22
782 0.19
783 0.21
784 0.2
785 0.19
786 0.2
787 0.22
788 0.23
789 0.33
790 0.36
791 0.38
792 0.46
793 0.45
794 0.47
795 0.47
796 0.42
797 0.36
798 0.35
799 0.33
800 0.32
801 0.33
802 0.35
803 0.35
804 0.36
805 0.44
806 0.48
807 0.55
808 0.58
809 0.66
810 0.68
811 0.76
812 0.78
813 0.67
814 0.68
815 0.61
816 0.61
817 0.6
818 0.64
819 0.64
820 0.67
821 0.73
822 0.74
823 0.79
824 0.77
825 0.78
826 0.78
827 0.78
828 0.81
829 0.78
830 0.74
831 0.72
832 0.66
833 0.6
834 0.52
835 0.45
836 0.38
837 0.36
838 0.31
839 0.25
840 0.24
841 0.24
842 0.21
843 0.18
844 0.15
845 0.15
846 0.14
847 0.13
848 0.15
849 0.14
850 0.17
851 0.18
852 0.19
853 0.2
854 0.21
855 0.25
856 0.25
857 0.28
858 0.32
859 0.31
860 0.33
861 0.31
862 0.31
863 0.27
864 0.25
865 0.19
866 0.12
867 0.13
868 0.1
869 0.1
870 0.09
871 0.08
872 0.08
873 0.08
874 0.08
875 0.1
876 0.09
877 0.08
878 0.09
879 0.09
880 0.09
881 0.1
882 0.12
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.11
887 0.1
888 0.1
889 0.11
890 0.08
891 0.08
892 0.09
893 0.1
894 0.12
895 0.12
896 0.15
897 0.14
898 0.2
899 0.25
900 0.28
901 0.33
902 0.35
903 0.42
904 0.41
905 0.4
906 0.4
907 0.39
908 0.41
909 0.37
910 0.33
911 0.27
912 0.25
913 0.26
914 0.25
915 0.21
916 0.16
917 0.15
918 0.16
919 0.14
920 0.15
921 0.16
922 0.12
923 0.1
924 0.11
925 0.16
926 0.18
927 0.21
928 0.22
929 0.23
930 0.31
931 0.36
932 0.39
933 0.37
934 0.38
935 0.39
936 0.37
937 0.36
938 0.3
939 0.24
940 0.21
941 0.2
942 0.17
943 0.16
944 0.21
945 0.23
946 0.26
947 0.3
948 0.31
949 0.32
950 0.35
951 0.33
952 0.36
953 0.39
954 0.41
955 0.39
956 0.44
957 0.46
958 0.44
959 0.5
960 0.49
961 0.48
962 0.5
963 0.56
964 0.56
965 0.59
966 0.63
967 0.66
968 0.69
969 0.73
970 0.75
971 0.77
972 0.78
973 0.81
974 0.84
975 0.83
976 0.82
977 0.81
978 0.79
979 0.8
980 0.81
981 0.81
982 0.78
983 0.74
984 0.67
985 0.59
986 0.54
987 0.47
988 0.39
989 0.3
990 0.25
991 0.19
992 0.17
993 0.2
994 0.17
995 0.14
996 0.14
997 0.13
998 0.17
999 0.18
1000 0.19
1001 0.14
1002 0.15
1003 0.14
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.1
1007 0.09
1008 0.08
1009 0.08
1010 0.07
1011 0.07
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.06
1015 0.07
1016 0.08
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.08
1021 0.09
1022 0.09