Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AY47

Protein Details
Accession H2AY47    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
683-735DYSKSEKILKGDKQRKKRESKKRQFDPFAASNEGPKAARKRKSGTRGRNLSYKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
690-731ILKGDKQRKKRESKKRQFDPFAASNEGPKAARKRKSGTRGRN
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG kaf:KAFR_0G02660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PF08066  PMC2NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06147  Rrp6p_like_exo  
Amino Acid Sequences MLLEEQKKLLSDVVNTVRASSTLAAQDVDFYRSLDSEVSHSINEVTDELNDMVNSIILSIDENYETLDEGKEELTESWKSLSNIVDNLFEKSDRSLDILKTGAKKKPTNPPFEYFENATTTENIPQKRINKPQLKFVPPIDNSESHPFIPLLKEKPNALKTIDESTKLINSDENVPEHYAHPYEYEIDNQPYNDSILQVREPIPSKSWSETEGVWVDNVESLNHMLNDIKKYTEIAIDLEHHDYRTYYGIVCLMQISTRETDYLVDTIALRNDLKVLNEVFTDPSVVKVLHGAFMDIIWLQRDLGLYIVSLFDTFHASRALGFPRHSLAYLLEEFANFKTSKKYQLADWRVRPLSKAMTAYARADTHFLLNIYDQLRNRLVETNKLVGVLNESRNVAKRRFEYSKFRPRVPSPNVYSALEKEDPWRTLMFQYNIPSEREDLLKGLFEWRDMIARRDDESPRYIMPNQLMVTLVAYTPTDPAGVISASQVVTDYVRSNSKIIANLIKNALTRAKDQNRQLQFVADNHTRESYRSTDKMTVSQIKETASVFIQIAEKLGTCNNDQQQSKSFARSNYFGSLSKKLDIIEYKNGEKHSVKQQQLVSRFNTYTKQVNELTNVRYELPVHKEPPQLQKDDVEEVKKTIIADSIPAKPEIDLDEVVVLKKVNRQPNKTKLEENEKIDFIDYSKSEKILKGDKQRKKRESKKRQFDPFAASNEGPKAARKRKSGTRGRNLSYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.35
4 0.32
5 0.29
6 0.29
7 0.21
8 0.19
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.21
14 0.2
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.18
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.24
69 0.23
70 0.25
71 0.26
72 0.29
73 0.25
74 0.27
75 0.26
76 0.23
77 0.21
78 0.2
79 0.21
80 0.16
81 0.19
82 0.21
83 0.2
84 0.23
85 0.24
86 0.27
87 0.32
88 0.38
89 0.39
90 0.43
91 0.49
92 0.53
93 0.62
94 0.66
95 0.68
96 0.68
97 0.68
98 0.66
99 0.64
100 0.61
101 0.53
102 0.46
103 0.39
104 0.35
105 0.3
106 0.27
107 0.24
108 0.26
109 0.29
110 0.28
111 0.28
112 0.33
113 0.38
114 0.45
115 0.54
116 0.58
117 0.62
118 0.62
119 0.7
120 0.73
121 0.72
122 0.67
123 0.62
124 0.62
125 0.53
126 0.58
127 0.52
128 0.44
129 0.43
130 0.45
131 0.42
132 0.32
133 0.32
134 0.26
135 0.23
136 0.26
137 0.27
138 0.26
139 0.29
140 0.31
141 0.33
142 0.42
143 0.43
144 0.41
145 0.38
146 0.36
147 0.33
148 0.39
149 0.38
150 0.31
151 0.29
152 0.28
153 0.29
154 0.26
155 0.24
156 0.17
157 0.16
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.21
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.23
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.15
187 0.18
188 0.2
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.25
193 0.26
194 0.26
195 0.24
196 0.23
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.19
201 0.16
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.12
307 0.15
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.13
324 0.09
325 0.1
326 0.14
327 0.15
328 0.22
329 0.24
330 0.25
331 0.27
332 0.37
333 0.45
334 0.48
335 0.5
336 0.5
337 0.48
338 0.48
339 0.43
340 0.35
341 0.3
342 0.24
343 0.22
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.2
367 0.19
368 0.21
369 0.24
370 0.23
371 0.22
372 0.22
373 0.21
374 0.15
375 0.18
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.15
380 0.15
381 0.2
382 0.23
383 0.22
384 0.23
385 0.25
386 0.3
387 0.36
388 0.4
389 0.45
390 0.51
391 0.6
392 0.59
393 0.59
394 0.58
395 0.56
396 0.61
397 0.58
398 0.56
399 0.5
400 0.53
401 0.52
402 0.47
403 0.44
404 0.35
405 0.34
406 0.27
407 0.22
408 0.19
409 0.21
410 0.2
411 0.2
412 0.2
413 0.16
414 0.18
415 0.24
416 0.22
417 0.21
418 0.23
419 0.26
420 0.27
421 0.26
422 0.24
423 0.2
424 0.2
425 0.18
426 0.16
427 0.13
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.12
432 0.11
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.14
437 0.15
438 0.17
439 0.17
440 0.18
441 0.2
442 0.24
443 0.25
444 0.24
445 0.25
446 0.25
447 0.22
448 0.24
449 0.23
450 0.21
451 0.21
452 0.22
453 0.2
454 0.18
455 0.17
456 0.14
457 0.14
458 0.11
459 0.1
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.09
480 0.09
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.16
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.25
489 0.24
490 0.26
491 0.27
492 0.26
493 0.24
494 0.24
495 0.25
496 0.2
497 0.23
498 0.3
499 0.36
500 0.41
501 0.47
502 0.54
503 0.54
504 0.56
505 0.52
506 0.45
507 0.4
508 0.35
509 0.37
510 0.31
511 0.28
512 0.26
513 0.28
514 0.25
515 0.24
516 0.25
517 0.23
518 0.26
519 0.27
520 0.3
521 0.33
522 0.34
523 0.37
524 0.4
525 0.43
526 0.38
527 0.39
528 0.36
529 0.32
530 0.32
531 0.29
532 0.24
533 0.16
534 0.16
535 0.13
536 0.13
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.19
547 0.23
548 0.3
549 0.31
550 0.33
551 0.36
552 0.41
553 0.42
554 0.41
555 0.4
556 0.37
557 0.41
558 0.4
559 0.38
560 0.35
561 0.36
562 0.34
563 0.35
564 0.37
565 0.35
566 0.34
567 0.31
568 0.27
569 0.29
570 0.3
571 0.3
572 0.33
573 0.35
574 0.37
575 0.4
576 0.4
577 0.4
578 0.37
579 0.38
580 0.4
581 0.45
582 0.44
583 0.47
584 0.52
585 0.55
586 0.6
587 0.59
588 0.52
589 0.49
590 0.47
591 0.43
592 0.41
593 0.37
594 0.38
595 0.34
596 0.36
597 0.34
598 0.35
599 0.39
600 0.39
601 0.38
602 0.34
603 0.34
604 0.29
605 0.27
606 0.26
607 0.26
608 0.3
609 0.33
610 0.32
611 0.37
612 0.43
613 0.48
614 0.56
615 0.57
616 0.53
617 0.49
618 0.5
619 0.47
620 0.47
621 0.46
622 0.39
623 0.34
624 0.32
625 0.31
626 0.28
627 0.25
628 0.19
629 0.17
630 0.14
631 0.17
632 0.19
633 0.24
634 0.24
635 0.25
636 0.24
637 0.22
638 0.23
639 0.22
640 0.21
641 0.16
642 0.15
643 0.17
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.14
648 0.12
649 0.2
650 0.27
651 0.35
652 0.43
653 0.52
654 0.61
655 0.71
656 0.78
657 0.75
658 0.75
659 0.74
660 0.75
661 0.74
662 0.7
663 0.65
664 0.57
665 0.53
666 0.46
667 0.38
668 0.29
669 0.28
670 0.23
671 0.23
672 0.24
673 0.25
674 0.27
675 0.3
676 0.35
677 0.37
678 0.45
679 0.5
680 0.59
681 0.67
682 0.75
683 0.83
684 0.87
685 0.89
686 0.92
687 0.92
688 0.93
689 0.94
690 0.95
691 0.94
692 0.95
693 0.92
694 0.87
695 0.84
696 0.79
697 0.73
698 0.68
699 0.58
700 0.51
701 0.45
702 0.42
703 0.34
704 0.35
705 0.4
706 0.43
707 0.51
708 0.55
709 0.61
710 0.68
711 0.78
712 0.82
713 0.83
714 0.85
715 0.86