Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2P5HF16

Protein Details
Accession A0A2P5HF16    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210IDSSEQRKTKRRKRSSAVSDGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-202KTKRRKR
244-253GGRRKKRKLR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011659  PD40  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07676  PD40  
Amino Acid Sequences MSRKAQDPVYDERSSENEDDLSSSFGEGGTPSKSTEQMDVDEADSDEEELERLVLGNKAGFRENLLRHAEDAGDGEALKSLGLDDGRHAPGAIGHEDLDDSALFMFDTGSAPAQGKQPTEMPRHAANDDGPQPAWLDSDDEKLAVSLAGVKQLRKLRESDADDLIGGVEYTRRLRQYYLRLNPLPSWAIDSSEQRKTKRRKRSSAVSDGSDTSSGSEPSGDEEDISALPLERFLRDAGALHGEGGRRKKRKLRPEVIDIQRTRDIPDTHKGPVESISFHPQHPVLLSSSKSSILYLHHVDPSAHPTPNPQLTSVQVQSVPIRRSAFVHPNGDEIILAGRRRFFHSWNLSNGIVKKVTKIQGHQEEQKSMERFRLSPDGKHMALVATSRRGGGMLNIISLISMQWVAQARLDSRGGIADFSWWRDGQGITILGRDGQVGEWSLATRRAVGIWRDEGSIGGTVMALGGRDGPPEVGGDKWVALGSTSGVLNIYDRAELISKAPGGAVEVKPLPTPTRSLEQLTTPITVTAFSPDGQLLAFASQHKKDAFKLVHLPSCTVYRNWPTEQTPMGRVTAVALGRSKDTDVLVVGNDVGKIRMWEIRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.3
4 0.23
5 0.22
6 0.24
7 0.21
8 0.2
9 0.14
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.23
29 0.21
30 0.17
31 0.15
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.12
44 0.14
45 0.16
46 0.18
47 0.18
48 0.21
49 0.28
50 0.29
51 0.34
52 0.36
53 0.35
54 0.34
55 0.35
56 0.31
57 0.23
58 0.22
59 0.16
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.17
76 0.15
77 0.17
78 0.2
79 0.18
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.11
100 0.16
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.25
105 0.31
106 0.36
107 0.37
108 0.37
109 0.39
110 0.42
111 0.4
112 0.36
113 0.31
114 0.32
115 0.32
116 0.3
117 0.25
118 0.22
119 0.22
120 0.2
121 0.19
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.23
139 0.29
140 0.32
141 0.3
142 0.32
143 0.31
144 0.38
145 0.43
146 0.41
147 0.37
148 0.35
149 0.32
150 0.3
151 0.25
152 0.16
153 0.1
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.09
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.18
162 0.25
163 0.34
164 0.43
165 0.48
166 0.54
167 0.54
168 0.55
169 0.53
170 0.5
171 0.41
172 0.3
173 0.27
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.24
178 0.26
179 0.33
180 0.37
181 0.36
182 0.46
183 0.54
184 0.61
185 0.67
186 0.73
187 0.75
188 0.79
189 0.86
190 0.86
191 0.85
192 0.8
193 0.71
194 0.63
195 0.54
196 0.46
197 0.36
198 0.26
199 0.17
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.11
229 0.11
230 0.15
231 0.22
232 0.29
233 0.31
234 0.37
235 0.46
236 0.53
237 0.63
238 0.7
239 0.73
240 0.71
241 0.75
242 0.8
243 0.76
244 0.76
245 0.65
246 0.59
247 0.52
248 0.46
249 0.39
250 0.34
251 0.3
252 0.25
253 0.3
254 0.28
255 0.27
256 0.28
257 0.26
258 0.22
259 0.23
260 0.2
261 0.17
262 0.16
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.15
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.19
289 0.19
290 0.17
291 0.15
292 0.16
293 0.2
294 0.24
295 0.24
296 0.19
297 0.17
298 0.19
299 0.23
300 0.21
301 0.18
302 0.14
303 0.14
304 0.16
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.19
309 0.18
310 0.21
311 0.25
312 0.3
313 0.29
314 0.32
315 0.29
316 0.29
317 0.29
318 0.26
319 0.21
320 0.13
321 0.11
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.17
328 0.19
329 0.19
330 0.26
331 0.34
332 0.37
333 0.38
334 0.41
335 0.37
336 0.37
337 0.36
338 0.3
339 0.24
340 0.2
341 0.19
342 0.21
343 0.26
344 0.26
345 0.28
346 0.34
347 0.41
348 0.45
349 0.51
350 0.48
351 0.44
352 0.44
353 0.48
354 0.41
355 0.33
356 0.32
357 0.27
358 0.24
359 0.26
360 0.33
361 0.29
362 0.29
363 0.35
364 0.35
365 0.33
366 0.33
367 0.29
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.14
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.13
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.08
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.16
397 0.16
398 0.13
399 0.12
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.14
407 0.16
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.15
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.12
434 0.15
435 0.17
436 0.2
437 0.21
438 0.22
439 0.22
440 0.22
441 0.2
442 0.17
443 0.16
444 0.11
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.04
451 0.03
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.09
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.13
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.11
489 0.12
490 0.18
491 0.17
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.21
496 0.23
497 0.23
498 0.19
499 0.22
500 0.22
501 0.26
502 0.28
503 0.32
504 0.32
505 0.32
506 0.35
507 0.34
508 0.31
509 0.25
510 0.23
511 0.19
512 0.17
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.13
518 0.12
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.13
526 0.18
527 0.19
528 0.24
529 0.26
530 0.28
531 0.29
532 0.38
533 0.36
534 0.37
535 0.45
536 0.47
537 0.51
538 0.5
539 0.49
540 0.42
541 0.44
542 0.41
543 0.33
544 0.34
545 0.36
546 0.4
547 0.42
548 0.46
549 0.44
550 0.47
551 0.51
552 0.48
553 0.44
554 0.41
555 0.38
556 0.32
557 0.29
558 0.25
559 0.25
560 0.21
561 0.2
562 0.2
563 0.2
564 0.22
565 0.23
566 0.23
567 0.19
568 0.19
569 0.18
570 0.16
571 0.16
572 0.15
573 0.14
574 0.13
575 0.12
576 0.13
577 0.12
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.13