Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

H2AYI6

Protein Details
Accession H2AYI6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-317GELPTIKTNQKSKKKQRRKKGAMSDISGFHydrophilic
405-430DEVSKGKLSMKRNRERQKQVDNLTNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-309KSKKKQRRKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG kaf:KAFR_0H03530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSKRFSKQNAQKYVVVHRPHDDPHFYDEGASKHILVPVDDPNAKKQSGVPATVKVEPKGENKHVGEAALYGIEFDDSKYDYTQHLRPMGVNADSVFIPAKAETAGGKKKNIDDLFVEPEYKETDGVKPKSVFVRGVADPEYLKHQQDVSEDITGFRPNMDPALREVLEALEDDAYVVNDDIVVASKKPADAEEEEDEDDVFAELLQGGEVADEDEVDEWDIDNFEDYEDETYLKEMEQFDNLENLDDLQNIDYQADVRRFQMQSKGDMDLQSENEFNDEEEEEENDMLGELPTIKTNQKSKKKQRRKKGAMSDISGFSMSSSAIARTETMTVLDDHYDQIITGYENYEEEQEEEEDNYKPFNMENERSDFESMLDDFLDNYELEKGGRKLVKKNPEVQRMKDAADEVSKGKLSMKRNRERQKQVDNLTNSLSSLKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.62
3 0.56
4 0.5
5 0.49
6 0.49
7 0.52
8 0.47
9 0.42
10 0.43
11 0.43
12 0.39
13 0.37
14 0.36
15 0.31
16 0.3
17 0.28
18 0.22
19 0.2
20 0.23
21 0.22
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.28
26 0.3
27 0.3
28 0.35
29 0.38
30 0.37
31 0.35
32 0.33
33 0.36
34 0.38
35 0.42
36 0.38
37 0.4
38 0.44
39 0.49
40 0.49
41 0.4
42 0.39
43 0.38
44 0.42
45 0.44
46 0.45
47 0.47
48 0.46
49 0.49
50 0.46
51 0.42
52 0.35
53 0.27
54 0.22
55 0.14
56 0.12
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.15
68 0.2
69 0.23
70 0.27
71 0.3
72 0.29
73 0.29
74 0.31
75 0.32
76 0.28
77 0.25
78 0.19
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.13
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.16
91 0.24
92 0.26
93 0.29
94 0.32
95 0.34
96 0.43
97 0.41
98 0.37
99 0.32
100 0.33
101 0.35
102 0.33
103 0.32
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.16
109 0.12
110 0.17
111 0.26
112 0.28
113 0.33
114 0.32
115 0.34
116 0.37
117 0.38
118 0.33
119 0.26
120 0.3
121 0.24
122 0.26
123 0.25
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.23
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.19
134 0.22
135 0.18
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.13
143 0.11
144 0.09
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.13
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.13
185 0.12
186 0.07
187 0.05
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.1
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.18
246 0.18
247 0.2
248 0.27
249 0.25
250 0.27
251 0.28
252 0.29
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.2
257 0.2
258 0.17
259 0.15
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.1
282 0.15
283 0.24
284 0.34
285 0.44
286 0.55
287 0.65
288 0.75
289 0.85
290 0.89
291 0.92
292 0.94
293 0.93
294 0.93
295 0.93
296 0.91
297 0.86
298 0.81
299 0.73
300 0.63
301 0.53
302 0.43
303 0.31
304 0.21
305 0.15
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.17
349 0.23
350 0.26
351 0.3
352 0.35
353 0.38
354 0.39
355 0.4
356 0.34
357 0.27
358 0.25
359 0.21
360 0.16
361 0.14
362 0.11
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.15
372 0.16
373 0.22
374 0.27
375 0.31
376 0.38
377 0.47
378 0.57
379 0.58
380 0.67
381 0.69
382 0.76
383 0.78
384 0.74
385 0.75
386 0.68
387 0.63
388 0.56
389 0.47
390 0.4
391 0.36
392 0.34
393 0.25
394 0.26
395 0.25
396 0.22
397 0.27
398 0.3
399 0.35
400 0.43
401 0.53
402 0.59
403 0.69
404 0.8
405 0.84
406 0.89
407 0.9
408 0.91
409 0.9
410 0.87
411 0.86
412 0.8
413 0.72
414 0.65
415 0.55
416 0.45