FuNGI

A0A2P5HTN0

Protein Details

Accession

A0A2P5HTN0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
393-413	VEAHRPRKIAPPKRSSRSPSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
147-152	RSRGKG
171-186	VKKAKREAMEAAARKR
397-406	RPRKIAPPKR
489-509	RPAANPPAKKKKVDIFMRRKR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MPVKSLVQLCQATVRKHIDQVDYVSTLPYWRIKDPILKHIKNASQLAVIEENSPQIVGEDSELWEAMCKRDFMVPMKRDPREPENPRAWRQVYEYYAEEERKKEAVALEQLGASFAGLNKMKLANKTAIGDPRKLPKAPTAGLAFGRSRGKGAGPGATLNFGGGARTSNAVKKAKREAMEAAARKRLSVPKNVRQTGNLAKVTQAPESMKTEARIRAQPKYVPPGSSNATKRQREEEEEEDHDDDERGQMESRLLAAKRPRIQPKAMSDEELRPGSSGSAEGSHRAATPRSEPRPSTTPSKPRGLFSRPQSASIQQSKVTTKTVGKPGPSAAPQSAQKTKASLPGRSAATMPSSFAGQSASPPTKRPSRPEPPRVSTVSKNGTDMSRFISPGVEAHRPRKIAPPKRSSRSPSVASSIFGSPEPEASGPSGRRSSFNSNSSRSSSSPGPPQARPAQHLNTPPTASSSHAAIPGSPSKRKLDDAPTSGEGRPAANPPAKKKKVDIFMRRKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.42
3	0.46
4	0.51
5	0.46
6	0.44
7	0.46
8	0.43
9	0.38
10	0.35
11	0.31
12	0.25
13	0.22
14	0.22
15	0.23
16	0.22
17	0.22
18	0.26
19	0.29
20	0.38
21	0.42
22	0.49
23	0.55
24	0.52
25	0.55
26	0.6
27	0.61
28	0.59
29	0.57
30	0.48
31	0.41
32	0.4
33	0.38
34	0.32
35	0.28
36	0.22
37	0.2
38	0.19
39	0.15
40	0.14
41	0.1
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.13
52	0.14
53	0.15
54	0.16
55	0.15
56	0.16
57	0.21
58	0.25
59	0.28
60	0.37
61	0.39
62	0.46
63	0.55
64	0.56
65	0.56
66	0.59
67	0.61
68	0.61
69	0.64
70	0.63
71	0.65
72	0.7
73	0.7
74	0.73
75	0.66
76	0.58
77	0.56
78	0.54
79	0.46
80	0.43
81	0.39
82	0.34
83	0.37
84	0.37
85	0.35
86	0.29
87	0.3
88	0.27
89	0.26
90	0.24
91	0.21
92	0.23
93	0.25
94	0.25
95	0.23
96	0.22
97	0.22
98	0.2
99	0.18
100	0.12
101	0.08
102	0.06
103	0.11
104	0.12
105	0.12
106	0.13
107	0.18
108	0.21
109	0.22
110	0.26
111	0.24
112	0.25
113	0.28
114	0.3
115	0.34
116	0.35
117	0.36
118	0.36
119	0.41
120	0.44
121	0.42
122	0.4
123	0.38
124	0.41
125	0.38
126	0.4
127	0.33
128	0.31
129	0.31
130	0.33
131	0.27
132	0.24
133	0.26
134	0.21
135	0.2
136	0.18
137	0.18
138	0.19
139	0.2
140	0.19
141	0.17
142	0.19
143	0.18
144	0.18
145	0.17
146	0.13
147	0.12
148	0.08
149	0.07
150	0.06
151	0.07
152	0.06
153	0.08
154	0.1
155	0.12
156	0.19
157	0.25
158	0.27
159	0.31
160	0.39
161	0.44
162	0.44
163	0.44
164	0.4
165	0.41
166	0.47
167	0.46
168	0.41
169	0.41
170	0.39
171	0.36
172	0.37
173	0.38
174	0.33
175	0.39
176	0.45
177	0.47
178	0.57
179	0.61
180	0.58
181	0.51
182	0.53
183	0.51
184	0.49
185	0.42
186	0.33
187	0.3
188	0.33
189	0.33
190	0.28
191	0.23
192	0.16
193	0.17
194	0.2
195	0.21
196	0.18
197	0.18
198	0.22
199	0.24
200	0.26
201	0.3
202	0.3
203	0.33
204	0.35
205	0.37
206	0.36
207	0.4
208	0.39
209	0.34
210	0.32
211	0.31
212	0.31
213	0.34
214	0.34
215	0.35
216	0.42
217	0.43
218	0.44
219	0.46
220	0.46
221	0.45
222	0.47
223	0.42
224	0.38
225	0.37
226	0.38
227	0.32
228	0.29
229	0.24
230	0.18
231	0.14
232	0.1
233	0.08
234	0.07
235	0.06
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.1
241	0.09
242	0.12
243	0.16
244	0.22
245	0.27
246	0.35
247	0.41
248	0.42
249	0.45
250	0.47
251	0.5
252	0.51
253	0.46
254	0.41
255	0.36
256	0.35
257	0.35
258	0.3
259	0.23
260	0.16
261	0.15
262	0.13
263	0.11
264	0.08
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.17
276	0.24
277	0.28
278	0.31
279	0.32
280	0.35
281	0.39
282	0.41
283	0.42
284	0.42
285	0.47
286	0.48
287	0.55
288	0.52
289	0.49
290	0.52
291	0.51
292	0.5
293	0.46
294	0.52
295	0.44
296	0.46
297	0.45
298	0.42
299	0.43
300	0.42
301	0.38
302	0.29
303	0.32
304	0.31
305	0.3
306	0.29
307	0.25
308	0.24
309	0.28
310	0.34
311	0.34
312	0.33
313	0.33
314	0.33
315	0.34
316	0.32
317	0.29
318	0.21
319	0.23
320	0.25
321	0.29
322	0.32
323	0.3
324	0.29
325	0.29
326	0.29
327	0.34
328	0.35
329	0.31
330	0.29
331	0.33
332	0.33
333	0.31
334	0.3
335	0.23
336	0.22
337	0.2
338	0.18
339	0.13
340	0.12
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.07
345	0.09
346	0.15
347	0.19
348	0.2
349	0.23
350	0.27
351	0.36
352	0.4
353	0.45
354	0.49
355	0.55
356	0.65
357	0.73
358	0.77
359	0.74
360	0.75
361	0.73
362	0.68
363	0.62
364	0.59
365	0.56
366	0.47
367	0.43
368	0.39
369	0.36
370	0.32
371	0.28
372	0.24
373	0.2
374	0.19
375	0.18
376	0.17
377	0.15
378	0.16
379	0.2
380	0.24
381	0.25
382	0.3
383	0.35
384	0.36
385	0.38
386	0.45
387	0.51
388	0.53
389	0.6
390	0.66
391	0.7
392	0.76
393	0.83
394	0.8
395	0.79
396	0.76
397	0.7
398	0.63
399	0.59
400	0.52
401	0.45
402	0.41
403	0.32
404	0.26
405	0.22
406	0.2
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.12
411	0.12
412	0.13
413	0.19
414	0.19
415	0.23
416	0.27
417	0.27
418	0.29
419	0.34
420	0.41
421	0.43
422	0.5
423	0.52
424	0.51
425	0.54
426	0.57
427	0.54
428	0.46
429	0.43
430	0.41
431	0.39
432	0.43
433	0.47
434	0.49
435	0.46
436	0.52
437	0.56
438	0.56
439	0.55
440	0.54
441	0.5
442	0.51
443	0.57
444	0.54
445	0.51
446	0.48
447	0.44
448	0.39
449	0.35
450	0.32
451	0.26
452	0.24
453	0.21
454	0.22
455	0.22
456	0.19
457	0.23
458	0.29
459	0.33
460	0.36
461	0.37
462	0.4
463	0.44
464	0.48
465	0.5
466	0.51
467	0.54
468	0.54
469	0.56
470	0.54
471	0.54
472	0.5
473	0.46
474	0.37
475	0.29
476	0.28
477	0.25
478	0.29
479	0.32
480	0.38
481	0.46
482	0.56
483	0.61
484	0.62
485	0.66
486	0.67
487	0.71
488	0.76
489	0.77

A0A2P5HTN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer