Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AT25

Protein Details
Accession H2AT25    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-380PWGTLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKNKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-78KRRRKLAKE
83-84KK
114-141IHAKQRGGRNNEGKITVRHRGGGHKRRL
337-346GRGKSKSNKL
352-380GTLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKNK
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR022671  Ribosomal_L2_CS  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006412  P:translation  
KEGG kaf:KAFR_0C05340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00467  RIBOSOMAL_L2  
Amino Acid Sequences MSLLLNSCRRLLYRQYHPEIAVRSFSTSIALNQRTDSTEILTNNISPRLLKIIPNNSDIVELEKQDELIKRRRKLAKEVTTLKKYKPVSPGLRWYRKPIYPYLFKGRPVKSLTIHAKQRGGRNNEGKITVRHRGGGHKRRLRLIDFNRWDSGTHKIERIEYDPNRSAHIALVKNEKTEKLSYIIACDGLRVGDTVQSFRKGIPSNLLSEMGGHVDPAILSVKTAQRGNCLPISMIPIGAVIHNVGVTTVGPARLCRSAGTYARLISKLPEAKRAIVRLKSGEHRYVSLEACATIGVVSNIDHQNASIGKAGRSRRLGIRPSVRGVAMNKCDHPHGGGRGKSKSNKLSMSPWGTLAKGYKTRRGKNQNRMKVKDRPRGKNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.61
3 0.64
4 0.63
5 0.64
6 0.58
7 0.52
8 0.46
9 0.36
10 0.33
11 0.29
12 0.27
13 0.24
14 0.2
15 0.22
16 0.27
17 0.29
18 0.27
19 0.27
20 0.29
21 0.3
22 0.31
23 0.27
24 0.22
25 0.24
26 0.23
27 0.24
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.21
33 0.17
34 0.18
35 0.22
36 0.23
37 0.25
38 0.31
39 0.38
40 0.42
41 0.44
42 0.43
43 0.38
44 0.37
45 0.33
46 0.29
47 0.22
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.24
54 0.25
55 0.33
56 0.41
57 0.43
58 0.53
59 0.61
60 0.62
61 0.68
62 0.73
63 0.73
64 0.74
65 0.79
66 0.79
67 0.8
68 0.78
69 0.69
70 0.66
71 0.58
72 0.55
73 0.53
74 0.53
75 0.52
76 0.55
77 0.64
78 0.67
79 0.74
80 0.7
81 0.7
82 0.68
83 0.63
84 0.6
85 0.58
86 0.55
87 0.53
88 0.57
89 0.59
90 0.55
91 0.57
92 0.62
93 0.56
94 0.55
95 0.52
96 0.5
97 0.42
98 0.47
99 0.5
100 0.49
101 0.53
102 0.5
103 0.52
104 0.52
105 0.57
106 0.57
107 0.55
108 0.56
109 0.57
110 0.57
111 0.54
112 0.53
113 0.48
114 0.44
115 0.43
116 0.4
117 0.34
118 0.33
119 0.32
120 0.39
121 0.48
122 0.53
123 0.58
124 0.58
125 0.6
126 0.62
127 0.65
128 0.59
129 0.58
130 0.56
131 0.56
132 0.54
133 0.54
134 0.5
135 0.47
136 0.43
137 0.34
138 0.34
139 0.28
140 0.25
141 0.24
142 0.24
143 0.25
144 0.27
145 0.28
146 0.3
147 0.26
148 0.31
149 0.34
150 0.33
151 0.33
152 0.32
153 0.29
154 0.22
155 0.26
156 0.22
157 0.19
158 0.26
159 0.25
160 0.26
161 0.27
162 0.26
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.15
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.09
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.17
195 0.15
196 0.15
197 0.11
198 0.09
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.08
208 0.1
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.18
213 0.19
214 0.23
215 0.21
216 0.2
217 0.17
218 0.16
219 0.2
220 0.16
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.19
245 0.22
246 0.25
247 0.24
248 0.24
249 0.27
250 0.27
251 0.24
252 0.19
253 0.24
254 0.27
255 0.27
256 0.33
257 0.32
258 0.36
259 0.4
260 0.45
261 0.44
262 0.41
263 0.43
264 0.38
265 0.41
266 0.44
267 0.46
268 0.45
269 0.4
270 0.38
271 0.38
272 0.38
273 0.34
274 0.27
275 0.22
276 0.16
277 0.15
278 0.13
279 0.1
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.15
291 0.15
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.25
297 0.29
298 0.33
299 0.36
300 0.38
301 0.41
302 0.48
303 0.52
304 0.55
305 0.6
306 0.58
307 0.59
308 0.57
309 0.5
310 0.46
311 0.43
312 0.43
313 0.41
314 0.4
315 0.38
316 0.37
317 0.39
318 0.36
319 0.36
320 0.33
321 0.35
322 0.39
323 0.42
324 0.46
325 0.51
326 0.58
327 0.62
328 0.65
329 0.64
330 0.63
331 0.62
332 0.6
333 0.59
334 0.6
335 0.6
336 0.52
337 0.48
338 0.43
339 0.38
340 0.38
341 0.35
342 0.34
343 0.37
344 0.4
345 0.47
346 0.54
347 0.63
348 0.7
349 0.78
350 0.81
351 0.83
352 0.89
353 0.9
354 0.91
355 0.9
356 0.87
357 0.86
358 0.86
359 0.85
360 0.85