Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ASI0

Protein Details
Accession H2ASI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-199KLGKRPSQMKQINRKIKKKPSSDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-194KRPSQMKQINRKIKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG kaf:KAFR_0C03380  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSALTYQLKRAQISDSFSNDPFNDSLFQNKFDLNDTIDIFKLYSLAKDNLQYSERILNLSWRLQNINRLKSSNSKYDVLTNLKNIDTPEPDLTSRDSNYSLFSNDYGSYTNLTSYTGGSNFAMSLPIAIQSHDNFVDLDLPSNSVHSQFIDSFNDFPSDGNDFMSSFLFESKTAVKLGKRPSQMKQINRKIKKKPSSDTQVNICHNCQTSTTPLWRKDSEGHPLCNACGLFLRLHGVMRPLSLKTDVIKKRQRNSTAANRRSNNINTNNNINNFNAGAGGKGSDTSYGSYSNPTLDWLSFGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.39
4 0.39
5 0.42
6 0.37
7 0.35
8 0.29
9 0.25
10 0.22
11 0.19
12 0.27
13 0.25
14 0.27
15 0.26
16 0.26
17 0.26
18 0.26
19 0.28
20 0.21
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.11
30 0.12
31 0.15
32 0.17
33 0.18
34 0.22
35 0.24
36 0.26
37 0.27
38 0.25
39 0.23
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.2
44 0.22
45 0.24
46 0.29
47 0.28
48 0.25
49 0.29
50 0.3
51 0.39
52 0.41
53 0.45
54 0.44
55 0.43
56 0.44
57 0.49
58 0.52
59 0.51
60 0.47
61 0.42
62 0.4
63 0.42
64 0.45
65 0.42
66 0.39
67 0.33
68 0.31
69 0.29
70 0.3
71 0.26
72 0.24
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.16
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.09
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.18
164 0.26
165 0.31
166 0.36
167 0.39
168 0.42
169 0.51
170 0.57
171 0.6
172 0.64
173 0.67
174 0.72
175 0.77
176 0.81
177 0.8
178 0.84
179 0.84
180 0.81
181 0.77
182 0.76
183 0.76
184 0.74
185 0.69
186 0.65
187 0.64
188 0.61
189 0.56
190 0.47
191 0.41
192 0.35
193 0.31
194 0.26
195 0.2
196 0.21
197 0.23
198 0.31
199 0.34
200 0.37
201 0.42
202 0.42
203 0.42
204 0.44
205 0.44
206 0.46
207 0.44
208 0.42
209 0.4
210 0.4
211 0.37
212 0.35
213 0.3
214 0.2
215 0.17
216 0.16
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.14
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.28
233 0.32
234 0.4
235 0.49
236 0.55
237 0.62
238 0.7
239 0.73
240 0.7
241 0.73
242 0.74
243 0.76
244 0.77
245 0.77
246 0.7
247 0.67
248 0.68
249 0.65
250 0.62
251 0.6
252 0.59
253 0.53
254 0.59
255 0.61
256 0.57
257 0.53
258 0.45
259 0.38
260 0.31
261 0.27
262 0.21
263 0.15
264 0.13
265 0.11
266 0.11
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.17