Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APG5

Protein Details
Accession H2APG5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-73EYERQTGKVPSKRKLRKVSKVKMGHGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-66KVPSKRKLRKVSKV
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto 11, mito_nucl 8.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0A08310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MNGIFAIEKPSGITSNQFMMKLQHLLNNSRVFSKEIARATAERMKEYERQTGKVPSKRKLRKVSKVKMGHGGTLDPLASGVLVIGIGSGTKKLANYLSGTVKVYETEALFGVSTTSGDVEGEILSQNSTKHLNLDDLKTLKKKFEGDLKQTPPIFAALKMNGKPLHQYAREGKPLPRAIEPRQVKVYELDIFEDSLSKSHAYPLLKPVTDEAKDTVKNLNANMLKDTLYFSKEYCDEQGWESEVAQVEDPIMLSEEERSQIEEAGDEYRAPLLHFKAKVSSGTYIRSLISDIGKAMRSSCYMVKLIRLQQQDWSLERQNVFKFEDFSEKDEKVWSKVLAAVFEKGAEINVVEELTRAQKEFEQEAASLKCAYEAQQSTEDVTCDDNKSNTEVVVPDGERLKRKIEEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.31
9 0.3
10 0.28
11 0.3
12 0.34
13 0.4
14 0.42
15 0.4
16 0.38
17 0.37
18 0.35
19 0.34
20 0.36
21 0.35
22 0.32
23 0.34
24 0.35
25 0.34
26 0.38
27 0.41
28 0.37
29 0.32
30 0.32
31 0.34
32 0.37
33 0.4
34 0.44
35 0.41
36 0.42
37 0.44
38 0.51
39 0.56
40 0.57
41 0.6
42 0.59
43 0.67
44 0.74
45 0.79
46 0.81
47 0.82
48 0.85
49 0.89
50 0.9
51 0.9
52 0.88
53 0.82
54 0.81
55 0.72
56 0.64
57 0.55
58 0.45
59 0.36
60 0.29
61 0.24
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.15
83 0.18
84 0.21
85 0.23
86 0.24
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.16
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.18
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.26
124 0.3
125 0.33
126 0.33
127 0.3
128 0.3
129 0.3
130 0.29
131 0.37
132 0.41
133 0.43
134 0.52
135 0.53
136 0.56
137 0.53
138 0.5
139 0.4
140 0.34
141 0.27
142 0.19
143 0.19
144 0.16
145 0.21
146 0.21
147 0.25
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.28
153 0.25
154 0.29
155 0.31
156 0.36
157 0.41
158 0.41
159 0.4
160 0.41
161 0.44
162 0.41
163 0.4
164 0.39
165 0.37
166 0.45
167 0.44
168 0.4
169 0.4
170 0.38
171 0.34
172 0.3
173 0.29
174 0.22
175 0.2
176 0.18
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.19
191 0.23
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.23
196 0.23
197 0.22
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.2
202 0.21
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.23
207 0.21
208 0.21
209 0.21
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.18
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.12
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.24
267 0.26
268 0.22
269 0.24
270 0.24
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.18
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.24
291 0.28
292 0.33
293 0.37
294 0.39
295 0.36
296 0.38
297 0.42
298 0.42
299 0.38
300 0.37
301 0.34
302 0.35
303 0.36
304 0.36
305 0.34
306 0.34
307 0.35
308 0.31
309 0.3
310 0.27
311 0.35
312 0.32
313 0.34
314 0.36
315 0.33
316 0.32
317 0.35
318 0.35
319 0.29
320 0.31
321 0.28
322 0.23
323 0.27
324 0.27
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.14
332 0.13
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.21
347 0.24
348 0.25
349 0.23
350 0.22
351 0.27
352 0.27
353 0.26
354 0.22
355 0.19
356 0.18
357 0.16
358 0.18
359 0.21
360 0.22
361 0.25
362 0.28
363 0.29
364 0.31
365 0.32
366 0.3
367 0.22
368 0.23
369 0.22
370 0.21
371 0.23
372 0.22
373 0.23
374 0.26
375 0.26
376 0.23
377 0.22
378 0.2
379 0.19
380 0.23
381 0.22
382 0.22
383 0.27
384 0.32
385 0.36
386 0.37
387 0.41