Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QCX0

Protein Details
Accession A0A1E3QCX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
367-414RDSYRSRSYSRSRSRTPRSWTPRSRTPQSRTPSRSRSRSYSRTPSRSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-340RKVREEREIGARSTRRRSASPRPVRDR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATTYNEYGAVITASDASKENKIPPYGQRTGWRPKALDDFGEGGAFPEINMKQYPLDMGRTKQGPSNALAIQVDSQGKIKYDAIARQGHGASRIVHTSFSDLIPLRQRANIGEINLGRPSEDDVAETTAKTKAAFEMIVSGKSKAANAKSITNSKAQEPTYIRYTPSNMMGERGDTEHRQRIIKMVDLPEDPMEPPKFKHTKVPRGPPSPPAPLLRSPPRKLTAKDAEDFNIPPSVSKWKNPKGYTIALDKRLAADGRGLEEVKINDNFAKLSEALYAADRHAREEVKQRALLQQKIADQEKDAKEEHLRMLARKVREEREIGARSTRRRSASPRPVRDRSVSRDRSRSPSISYDSRYGSRSPSHDRDSYRSRSYSRSRSRTPRSWTPRSRTPQSRTPSRSRSRSYSRTPSRSMSRSLSRTPRSRSRSYSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.12
4 0.14
5 0.19
6 0.22
7 0.27
8 0.32
9 0.35
10 0.38
11 0.45
12 0.51
13 0.52
14 0.54
15 0.56
16 0.58
17 0.65
18 0.69
19 0.67
20 0.59
21 0.59
22 0.63
23 0.57
24 0.51
25 0.44
26 0.39
27 0.33
28 0.32
29 0.26
30 0.18
31 0.16
32 0.14
33 0.1
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.21
42 0.17
43 0.24
44 0.25
45 0.27
46 0.33
47 0.34
48 0.35
49 0.35
50 0.37
51 0.32
52 0.31
53 0.34
54 0.27
55 0.27
56 0.26
57 0.23
58 0.2
59 0.21
60 0.2
61 0.15
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.22
69 0.25
70 0.29
71 0.32
72 0.32
73 0.34
74 0.34
75 0.31
76 0.29
77 0.27
78 0.23
79 0.2
80 0.23
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.16
87 0.18
88 0.16
89 0.19
90 0.25
91 0.27
92 0.26
93 0.25
94 0.26
95 0.23
96 0.28
97 0.27
98 0.21
99 0.24
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.23
104 0.17
105 0.15
106 0.17
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.15
124 0.15
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.17
132 0.18
133 0.22
134 0.23
135 0.27
136 0.3
137 0.35
138 0.35
139 0.35
140 0.35
141 0.31
142 0.35
143 0.3
144 0.32
145 0.31
146 0.32
147 0.33
148 0.32
149 0.31
150 0.27
151 0.3
152 0.25
153 0.26
154 0.25
155 0.2
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.14
163 0.18
164 0.22
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.26
170 0.27
171 0.27
172 0.24
173 0.24
174 0.23
175 0.24
176 0.2
177 0.19
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.15
183 0.22
184 0.25
185 0.25
186 0.35
187 0.39
188 0.49
189 0.56
190 0.66
191 0.65
192 0.67
193 0.69
194 0.65
195 0.61
196 0.54
197 0.48
198 0.41
199 0.36
200 0.32
201 0.36
202 0.4
203 0.42
204 0.4
205 0.43
206 0.45
207 0.46
208 0.45
209 0.48
210 0.47
211 0.44
212 0.44
213 0.4
214 0.36
215 0.34
216 0.33
217 0.25
218 0.18
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.18
223 0.18
224 0.23
225 0.32
226 0.37
227 0.46
228 0.46
229 0.5
230 0.48
231 0.5
232 0.47
233 0.47
234 0.44
235 0.39
236 0.39
237 0.34
238 0.29
239 0.28
240 0.25
241 0.16
242 0.14
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.12
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.09
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.15
270 0.16
271 0.17
272 0.26
273 0.32
274 0.34
275 0.35
276 0.35
277 0.4
278 0.45
279 0.45
280 0.39
281 0.36
282 0.34
283 0.38
284 0.39
285 0.32
286 0.28
287 0.33
288 0.32
289 0.32
290 0.29
291 0.26
292 0.27
293 0.29
294 0.29
295 0.26
296 0.26
297 0.24
298 0.31
299 0.34
300 0.34
301 0.38
302 0.43
303 0.41
304 0.43
305 0.44
306 0.39
307 0.44
308 0.44
309 0.39
310 0.41
311 0.42
312 0.44
313 0.49
314 0.51
315 0.45
316 0.48
317 0.54
318 0.57
319 0.63
320 0.68
321 0.72
322 0.75
323 0.77
324 0.77
325 0.76
326 0.72
327 0.69
328 0.7
329 0.68
330 0.66
331 0.69
332 0.69
333 0.69
334 0.68
335 0.63
336 0.56
337 0.54
338 0.53
339 0.5
340 0.5
341 0.47
342 0.44
343 0.44
344 0.41
345 0.36
346 0.34
347 0.34
348 0.36
349 0.41
350 0.44
351 0.48
352 0.51
353 0.54
354 0.58
355 0.6
356 0.62
357 0.59
358 0.57
359 0.54
360 0.57
361 0.61
362 0.65
363 0.67
364 0.69
365 0.71
366 0.77
367 0.84
368 0.84
369 0.84
370 0.84
371 0.83
372 0.85
373 0.85
374 0.83
375 0.84
376 0.83
377 0.85
378 0.84
379 0.81
380 0.79
381 0.79
382 0.81
383 0.79
384 0.8
385 0.8
386 0.8
387 0.83
388 0.81
389 0.81
390 0.81
391 0.82
392 0.81
393 0.82
394 0.83
395 0.81
396 0.79
397 0.77
398 0.77
399 0.72
400 0.69
401 0.66
402 0.64
403 0.63
404 0.67
405 0.69
406 0.69
407 0.73
408 0.75
409 0.78
410 0.76
411 0.78