Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3PWR6

Protein Details
Accession A0A1E3PWR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-303ESPVRSEHRKGQRSRHRRREENEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-297RKGQRSRHRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MENPGKIRWVPLRVSPSDQPPVILLAHFTRTTDSYSFTVTDLQSHWFDSASRDDIIDRALQDRCIVDVSQSANLNVLLARLSDSLTGKELPEGTKLEAMRFEENLRITISLQMSASSRPLVWIFRLQFAPSPKLSHNIFLGSLGIIDALQSQISALQAIASEKDYHISALQEVLQECHANLYAPRRYRDSFAQFNAETWIQSWKDSKTTTCKASEIYFRGVSECSQWWGWCANGKWEITDGDFNDIQTDDQWTSRKSNNSALPGISSKRKHYTSSSSNESPVRSEHRKGQRSRHRRREENEDDESSSGNENQIKLVIGGRRRRRNDTDSDFRDKHVRTSRKNSGRTGPKQRLTHGRYEDASDASNSASESESQSPGMIIGGRSRQSQASSPPKSSRTVKEELLRSSPSSSEEEEILSGVPSSAPSAHGVIGGGMIGGSRSRSSKRATPIGGNIDIRDTSPSPLPMHQSGSLQEKQETSVKPRSPSPPNDAGDIASERRRMLDAQLQARKRVPVRRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.53
4 0.54
5 0.51
6 0.44
7 0.37
8 0.36
9 0.3
10 0.25
11 0.2
12 0.16
13 0.21
14 0.2
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.25
19 0.23
20 0.24
21 0.21
22 0.23
23 0.24
24 0.21
25 0.25
26 0.21
27 0.22
28 0.2
29 0.23
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.16
34 0.17
35 0.17
36 0.21
37 0.2
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.21
43 0.2
44 0.16
45 0.17
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.16
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.14
63 0.12
64 0.08
65 0.07
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.16
74 0.15
75 0.17
76 0.18
77 0.16
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.24
87 0.24
88 0.23
89 0.23
90 0.24
91 0.23
92 0.21
93 0.18
94 0.16
95 0.2
96 0.19
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.22
110 0.22
111 0.25
112 0.27
113 0.26
114 0.29
115 0.31
116 0.33
117 0.27
118 0.3
119 0.26
120 0.31
121 0.31
122 0.29
123 0.27
124 0.24
125 0.22
126 0.19
127 0.18
128 0.12
129 0.11
130 0.08
131 0.06
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.16
169 0.21
170 0.24
171 0.27
172 0.3
173 0.32
174 0.35
175 0.41
176 0.41
177 0.41
178 0.39
179 0.42
180 0.38
181 0.37
182 0.36
183 0.28
184 0.21
185 0.16
186 0.19
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.16
191 0.19
192 0.2
193 0.23
194 0.27
195 0.31
196 0.33
197 0.33
198 0.32
199 0.3
200 0.32
201 0.34
202 0.29
203 0.28
204 0.26
205 0.24
206 0.24
207 0.23
208 0.2
209 0.17
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.16
220 0.19
221 0.2
222 0.18
223 0.19
224 0.19
225 0.16
226 0.17
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.1
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.15
241 0.19
242 0.22
243 0.22
244 0.29
245 0.31
246 0.33
247 0.33
248 0.29
249 0.27
250 0.25
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.22
255 0.27
256 0.29
257 0.3
258 0.32
259 0.38
260 0.39
261 0.43
262 0.46
263 0.41
264 0.42
265 0.42
266 0.38
267 0.31
268 0.26
269 0.27
270 0.25
271 0.26
272 0.32
273 0.4
274 0.48
275 0.52
276 0.61
277 0.64
278 0.72
279 0.8
280 0.83
281 0.82
282 0.82
283 0.81
284 0.82
285 0.79
286 0.75
287 0.69
288 0.6
289 0.51
290 0.43
291 0.39
292 0.29
293 0.21
294 0.15
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.13
303 0.14
304 0.19
305 0.27
306 0.36
307 0.45
308 0.49
309 0.56
310 0.6
311 0.62
312 0.65
313 0.65
314 0.66
315 0.63
316 0.67
317 0.61
318 0.55
319 0.57
320 0.48
321 0.48
322 0.48
323 0.5
324 0.49
325 0.57
326 0.67
327 0.69
328 0.73
329 0.69
330 0.69
331 0.71
332 0.72
333 0.74
334 0.73
335 0.71
336 0.68
337 0.69
338 0.7
339 0.64
340 0.64
341 0.58
342 0.52
343 0.46
344 0.46
345 0.42
346 0.33
347 0.29
348 0.21
349 0.17
350 0.13
351 0.12
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.11
357 0.13
358 0.14
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.09
365 0.07
366 0.1
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.19
371 0.2
372 0.21
373 0.24
374 0.3
375 0.36
376 0.39
377 0.43
378 0.47
379 0.48
380 0.51
381 0.54
382 0.53
383 0.49
384 0.5
385 0.5
386 0.52
387 0.55
388 0.53
389 0.51
390 0.45
391 0.4
392 0.37
393 0.33
394 0.28
395 0.26
396 0.24
397 0.21
398 0.19
399 0.18
400 0.16
401 0.16
402 0.13
403 0.1
404 0.08
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.07
426 0.11
427 0.14
428 0.19
429 0.24
430 0.31
431 0.39
432 0.46
433 0.49
434 0.51
435 0.55
436 0.57
437 0.57
438 0.51
439 0.43
440 0.38
441 0.34
442 0.29
443 0.26
444 0.21
445 0.19
446 0.21
447 0.24
448 0.24
449 0.27
450 0.32
451 0.3
452 0.34
453 0.33
454 0.32
455 0.32
456 0.37
457 0.37
458 0.34
459 0.34
460 0.3
461 0.31
462 0.36
463 0.36
464 0.36
465 0.42
466 0.45
467 0.46
468 0.52
469 0.58
470 0.6
471 0.63
472 0.64
473 0.64
474 0.61
475 0.61
476 0.54
477 0.47
478 0.42
479 0.38
480 0.34
481 0.29
482 0.29
483 0.26
484 0.27
485 0.28
486 0.25
487 0.28
488 0.31
489 0.35
490 0.43
491 0.52
492 0.53
493 0.56
494 0.59
495 0.6
496 0.6
497 0.62