Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QDY5

Protein Details
Accession A0A1E3QDY5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-169HKKSVYSQEKYKRRKQQKFLRRFTPCSHydrophilic
410-436VLPSKVQAGGKKRRKPNAPKPTSNGDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-429GGKKRRKPNAPK
Subcellular Location(s) cysk 17, cyto 5.5, cyto_nucl 5.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MNEDKIEPNSYVFIRLPSATLRITKLAPRSTIHLGKFGSFYADDIIGKSYGYTYEIKDDKHVDTIYSSEGLFPSSTVDADEEEDGEETENTPVPEEKEVGTNENTRDDPAVQKLSMTDIEALKKTASGEKIIETVIKSHAAFHKKSVYSQEKYKRRKQQKFLRRFTPCSVGSCEIIEYFQYKDHHRILELTSESLGLILSLANIRPGGKYIVIDETGGLVAGAMMERMGGEGMIMFAHENEHPNMDVMKFMNFPEALVAQMIKTINLFELFYPEEEEDVKVLSEDTLSKMKSSRRGQYYRRLARHVELQSIFQHISDGLFDGLILATTLETKPLLDRLIPALQGSRQIVVYNTAKEPLVATSHDLIADLRVLAPTILESRVRKYQVFPGRTHPEMTSKSGGGYILWGTRVLPSKVQAGGKKRRKPNAPKPTSNGDAANRAKVAETWREEPTDAVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.23
4 0.21
5 0.24
6 0.23
7 0.25
8 0.26
9 0.26
10 0.29
11 0.33
12 0.38
13 0.39
14 0.4
15 0.39
16 0.41
17 0.47
18 0.51
19 0.47
20 0.46
21 0.41
22 0.4
23 0.39
24 0.33
25 0.28
26 0.21
27 0.2
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.13
41 0.22
42 0.25
43 0.25
44 0.3
45 0.33
46 0.32
47 0.35
48 0.33
49 0.26
50 0.24
51 0.25
52 0.22
53 0.19
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.23
88 0.26
89 0.25
90 0.27
91 0.27
92 0.23
93 0.23
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.21
99 0.21
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.18
104 0.16
105 0.15
106 0.18
107 0.18
108 0.19
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.19
118 0.18
119 0.19
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.16
126 0.22
127 0.26
128 0.27
129 0.29
130 0.36
131 0.34
132 0.37
133 0.42
134 0.44
135 0.42
136 0.51
137 0.58
138 0.59
139 0.67
140 0.74
141 0.75
142 0.78
143 0.84
144 0.85
145 0.86
146 0.87
147 0.9
148 0.88
149 0.88
150 0.84
151 0.79
152 0.72
153 0.68
154 0.59
155 0.51
156 0.48
157 0.4
158 0.33
159 0.28
160 0.25
161 0.17
162 0.16
163 0.13
164 0.09
165 0.08
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.2
170 0.24
171 0.24
172 0.23
173 0.25
174 0.22
175 0.25
176 0.24
177 0.19
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.05
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.05
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.08
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.16
277 0.2
278 0.29
279 0.34
280 0.4
281 0.46
282 0.54
283 0.59
284 0.66
285 0.73
286 0.73
287 0.72
288 0.68
289 0.61
290 0.56
291 0.59
292 0.5
293 0.46
294 0.37
295 0.34
296 0.31
297 0.32
298 0.29
299 0.2
300 0.18
301 0.11
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.15
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.16
330 0.2
331 0.2
332 0.16
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.19
337 0.21
338 0.2
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.19
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.1
364 0.14
365 0.16
366 0.21
367 0.28
368 0.32
369 0.32
370 0.33
371 0.41
372 0.46
373 0.5
374 0.47
375 0.5
376 0.54
377 0.54
378 0.53
379 0.45
380 0.44
381 0.42
382 0.45
383 0.4
384 0.33
385 0.32
386 0.31
387 0.29
388 0.21
389 0.19
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.17
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.24
400 0.28
401 0.33
402 0.38
403 0.4
404 0.45
405 0.54
406 0.61
407 0.69
408 0.74
409 0.78
410 0.83
411 0.87
412 0.89
413 0.89
414 0.89
415 0.89
416 0.86
417 0.85
418 0.78
419 0.7
420 0.65
421 0.57
422 0.57
423 0.51
424 0.49
425 0.4
426 0.37
427 0.34
428 0.31
429 0.33
430 0.32
431 0.35
432 0.35
433 0.38
434 0.4
435 0.4