Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3Q820

Protein Details
Accession A0A1E3Q820    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32SSIDGKQLSKRKQRAAQFRDAVHydrophilic
107-129DGDVQKRKRQKTEKGEKPQGPRFBasic
208-232GGGGKGTSRKQKLKEKNEKLEAERRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-92VKKQAKLAERDQRQKEVLERKRAREEVEGKKRK
113-120RKRQKTEK
214-225TSRKQKLKEKNE
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSQVDLAGSTSSIDGKQLSKRKQRAAQFRDAVKRGENFSNKKTKSLSEAEYLALKEAKEVKKQAKLAERDQRQKEVLERKRAREEVEGKKRKAVDDEEAPVEKTNEDGDVQKRKRQKTEKGEKPQGPRFILFIGNLPYTATQTALQTHLTASKPDLIRIPTEKNTQKAKGFAFAEFTGQDASKRMNVCLRLHHTEFEGRRINVELTAGGGGKGTSRKQKLKEKNEKLEAERRELQEVKATKERTRIAANSAGEQSAGAFIHPSRMARVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.23
4 0.32
5 0.41
6 0.51
7 0.59
8 0.67
9 0.73
10 0.79
11 0.82
12 0.8
13 0.81
14 0.78
15 0.78
16 0.78
17 0.72
18 0.65
19 0.59
20 0.55
21 0.49
22 0.5
23 0.51
24 0.48
25 0.53
26 0.61
27 0.57
28 0.58
29 0.56
30 0.5
31 0.48
32 0.48
33 0.43
34 0.37
35 0.37
36 0.34
37 0.33
38 0.31
39 0.26
40 0.21
41 0.17
42 0.16
43 0.23
44 0.26
45 0.3
46 0.36
47 0.41
48 0.47
49 0.5
50 0.53
51 0.54
52 0.56
53 0.59
54 0.62
55 0.65
56 0.67
57 0.68
58 0.66
59 0.59
60 0.55
61 0.54
62 0.55
63 0.54
64 0.56
65 0.57
66 0.58
67 0.65
68 0.64
69 0.59
70 0.57
71 0.58
72 0.58
73 0.63
74 0.66
75 0.59
76 0.62
77 0.6
78 0.53
79 0.49
80 0.41
81 0.36
82 0.32
83 0.34
84 0.33
85 0.32
86 0.31
87 0.27
88 0.23
89 0.17
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.11
95 0.15
96 0.25
97 0.27
98 0.32
99 0.39
100 0.42
101 0.51
102 0.57
103 0.62
104 0.63
105 0.72
106 0.78
107 0.81
108 0.85
109 0.81
110 0.8
111 0.76
112 0.71
113 0.62
114 0.52
115 0.42
116 0.34
117 0.3
118 0.22
119 0.18
120 0.14
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.19
143 0.16
144 0.19
145 0.22
146 0.25
147 0.24
148 0.32
149 0.34
150 0.37
151 0.42
152 0.43
153 0.42
154 0.42
155 0.39
156 0.37
157 0.35
158 0.3
159 0.28
160 0.24
161 0.23
162 0.19
163 0.18
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.11
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.18
173 0.23
174 0.24
175 0.31
176 0.36
177 0.39
178 0.39
179 0.39
180 0.36
181 0.39
182 0.39
183 0.38
184 0.38
185 0.31
186 0.31
187 0.32
188 0.31
189 0.24
190 0.23
191 0.16
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.15
201 0.23
202 0.31
203 0.39
204 0.47
205 0.58
206 0.67
207 0.75
208 0.82
209 0.83
210 0.86
211 0.88
212 0.85
213 0.81
214 0.79
215 0.71
216 0.68
217 0.64
218 0.56
219 0.54
220 0.5
221 0.44
222 0.44
223 0.43
224 0.42
225 0.43
226 0.44
227 0.41
228 0.48
229 0.5
230 0.46
231 0.5
232 0.46
233 0.43
234 0.47
235 0.45
236 0.41
237 0.39
238 0.34
239 0.27
240 0.25
241 0.2
242 0.15
243 0.13
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.15
248 0.17
249 0.18