Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3Q542

Protein Details
Accession A0A1E3Q542    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-38RDRDRERDRDRDKERDRDRDRERYYBasic
54-75DNRSDRYREKHRDPDRDRDRGRBasic
153-197REYGRDDVDRRRRRRRDSASEDRRQSTEKRGRRRTRTPSASPVRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-36GKDRERDRDRDRERDRDRDKERDRDRDRER
51-97RDRDNRSDRYREKHRDPDRDRDRGRSYRSDRRSRSPRGDQGDRERVK
134-196RSPGSRKRGGTQSRTPSREREYGRDDVDRRRRRRRDSASEDRRQSTEKRGRRRTRTPSASPVR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDRDRGKDRERDRDRDRERDRDRDKERDRDRDRERYYRDREIMRDRDLHRDRDNRSDRYREKHRDPDRDRDRGRSYRSDRRSRSPRGDQGDRERVKGSVRYREKEDSHRRMVRYDDIDDGYSRDSRLGQDRSRSPGSRKRGGTQSRTPSREREYGRDDVDRRRRRRRDSASEDRRQSTEKRGRRRTRTPSASPVRRLRSPDAMDTANDSEEDETVRMAKLMGFAGFGTTKQKRVVGNDVGAVAKEKVPQYRQYMNREGGFNRALSPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.79
3 0.8
4 0.8
5 0.8
6 0.79
7 0.8
8 0.79
9 0.79
10 0.79
11 0.79
12 0.79
13 0.79
14 0.8
15 0.81
16 0.8
17 0.8
18 0.81
19 0.8
20 0.8
21 0.79
22 0.78
23 0.77
24 0.78
25 0.77
26 0.75
27 0.7
28 0.69
29 0.69
30 0.67
31 0.62
32 0.62
33 0.55
34 0.59
35 0.59
36 0.58
37 0.57
38 0.58
39 0.57
40 0.6
41 0.66
42 0.62
43 0.64
44 0.68
45 0.65
46 0.67
47 0.73
48 0.72
49 0.73
50 0.76
51 0.79
52 0.8
53 0.79
54 0.82
55 0.8
56 0.8
57 0.75
58 0.72
59 0.71
60 0.67
61 0.67
62 0.66
63 0.66
64 0.66
65 0.72
66 0.75
67 0.71
68 0.74
69 0.77
70 0.76
71 0.77
72 0.76
73 0.75
74 0.73
75 0.74
76 0.7
77 0.7
78 0.72
79 0.64
80 0.57
81 0.49
82 0.42
83 0.38
84 0.38
85 0.34
86 0.34
87 0.39
88 0.41
89 0.45
90 0.51
91 0.51
92 0.56
93 0.61
94 0.58
95 0.61
96 0.63
97 0.58
98 0.54
99 0.53
100 0.48
101 0.41
102 0.35
103 0.29
104 0.24
105 0.24
106 0.22
107 0.2
108 0.16
109 0.13
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.16
115 0.2
116 0.21
117 0.26
118 0.29
119 0.34
120 0.37
121 0.37
122 0.36
123 0.39
124 0.44
125 0.46
126 0.46
127 0.45
128 0.5
129 0.54
130 0.56
131 0.56
132 0.59
133 0.59
134 0.61
135 0.59
136 0.54
137 0.53
138 0.54
139 0.48
140 0.44
141 0.42
142 0.42
143 0.43
144 0.44
145 0.42
146 0.44
147 0.52
148 0.55
149 0.58
150 0.65
151 0.7
152 0.73
153 0.81
154 0.81
155 0.81
156 0.82
157 0.85
158 0.85
159 0.85
160 0.81
161 0.72
162 0.64
163 0.56
164 0.49
165 0.49
166 0.48
167 0.48
168 0.54
169 0.63
170 0.71
171 0.77
172 0.85
173 0.84
174 0.85
175 0.85
176 0.81
177 0.8
178 0.81
179 0.79
180 0.77
181 0.76
182 0.71
183 0.66
184 0.65
185 0.6
186 0.59
187 0.54
188 0.5
189 0.46
190 0.41
191 0.37
192 0.35
193 0.31
194 0.22
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197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.09
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202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
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209 0.09
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211 0.09
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214 0.11
215 0.18
216 0.19
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218 0.24
219 0.29
220 0.3
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222 0.43
223 0.41
224 0.41
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227 0.34
228 0.31
229 0.27
230 0.21
231 0.16
232 0.18
233 0.2
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236 0.36
237 0.41
238 0.5
239 0.56
240 0.6
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242 0.64
243 0.64
244 0.62
245 0.55
246 0.52
247 0.46
248 0.38