Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QF80

Protein Details
Accession A0A1E3QF80    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-387QTNTSQPPPGNKRKPGEKRRHKQRRNVFASDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-380GNKRKPGEKRRHKQRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, extr 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MAASPRAPQSAISMQPLVSAHLPLSPATVLPKSSSTTVPPRSLADAIAERKQLFQTRMAIPGVQPTFQKLKTPLQSIPTSTDFTRSNTPSSATTPITSTTPTTVSGYNALSTPASSDVPKLTIFGALDAFERKIADLIETVGLYSPGAGTAKDLVDLDLQLDKAVDELLLYQENKALIAKLSAESSDLDSQLNILLKALSDARAALLSIPGADDLGSNDTPDTPKTSYTELLAYATRISKFASAPPGFAPPASWASQPPPELAKTETSADGQAPTVAETVSATLKEAYKDPSSIPANLPWPTEDEMRRGMLVQYNRMFGSDGGENGVVATEIAVVVPGQEGHPDNKPHEMSSSQVQTNTSQPPPGNKRKPGEKRRHKQRRNVFASDIDDDDDSSDDGDGEADDDDDGFDDGGNNDDGILSSSSDYADTQDALPHPNPNSGLGNNGTTAPASNGGHVRQDGAVNREALLDLDLFEPDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.31
4 0.27
5 0.21
6 0.19
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.14
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.16
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.23
21 0.25
22 0.27
23 0.35
24 0.4
25 0.42
26 0.41
27 0.41
28 0.42
29 0.41
30 0.35
31 0.31
32 0.31
33 0.31
34 0.34
35 0.35
36 0.32
37 0.33
38 0.37
39 0.38
40 0.33
41 0.34
42 0.36
43 0.35
44 0.39
45 0.38
46 0.35
47 0.29
48 0.35
49 0.31
50 0.27
51 0.24
52 0.25
53 0.3
54 0.3
55 0.36
56 0.32
57 0.4
58 0.45
59 0.49
60 0.48
61 0.48
62 0.5
63 0.47
64 0.47
65 0.41
66 0.37
67 0.33
68 0.34
69 0.29
70 0.29
71 0.35
72 0.32
73 0.32
74 0.3
75 0.32
76 0.29
77 0.31
78 0.32
79 0.26
80 0.24
81 0.22
82 0.23
83 0.22
84 0.21
85 0.19
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.12
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.19
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.21
234 0.2
235 0.19
236 0.17
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.15
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.2
279 0.22
280 0.23
281 0.22
282 0.22
283 0.24
284 0.24
285 0.24
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.22
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.18
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.23
303 0.23
304 0.22
305 0.17
306 0.18
307 0.13
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.08
328 0.1
329 0.16
330 0.19
331 0.2
332 0.26
333 0.27
334 0.25
335 0.27
336 0.25
337 0.22
338 0.26
339 0.3
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.26
344 0.3
345 0.33
346 0.28
347 0.26
348 0.26
349 0.34
350 0.42
351 0.52
352 0.56
353 0.58
354 0.64
355 0.71
356 0.81
357 0.83
358 0.85
359 0.85
360 0.87
361 0.91
362 0.95
363 0.93
364 0.92
365 0.92
366 0.92
367 0.89
368 0.84
369 0.76
370 0.7
371 0.65
372 0.57
373 0.47
374 0.37
375 0.28
376 0.23
377 0.2
378 0.15
379 0.11
380 0.09
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.15
417 0.16
418 0.2
419 0.22
420 0.25
421 0.26
422 0.29
423 0.29
424 0.29
425 0.32
426 0.27
427 0.3
428 0.27
429 0.26
430 0.23
431 0.23
432 0.2
433 0.16
434 0.16
435 0.13
436 0.16
437 0.15
438 0.18
439 0.21
440 0.22
441 0.26
442 0.26
443 0.26
444 0.23
445 0.27
446 0.28
447 0.29
448 0.31
449 0.27
450 0.27
451 0.26
452 0.24
453 0.2
454 0.17
455 0.13
456 0.1
457 0.1
458 0.1