Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3QCH6

Protein Details
Accession A0A1E3QCH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-124VDERMDSRRKARREAREKREQEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-120RRKARREAREKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MFAAPRRDFLNEPAPENYVPGLGRGATGFTTRSDIGPAREGPSEDAIKAALAKRAEALENGEAVDEEDDNERFRDNENDEGLFASGTYDEDDEEADRIYKEVDERMDSRRKARREAREKREQEEYELKNPKMSKQFADLKRALSTVTDYEWASIPEVGDLTGRNRRGRQILQQERRFYAVPDSVLTSRGQAAYDNAIDTTDGTTSSVDGTITDFRQISEAKDKMLGMRLDQAGTDSVSGATNIDPKGYLTSLSSTITRSDEISSIAKNRELLLSVVKTDPKHANGWIAIAKLEEQSNRLSSARKLIQQGCDSCPKSEDVWLENMRLNQPVHAKIIAAKAVQNLPRSVKLWLEAMKLETDVNAKKRVIRKALENIPQSVTLWKEAVNLEEDPTNAKILLARAVELIPLSVDLWLALARLETDENARKVLNKARQAVRTSHEIWIAAAKLEENAGNPARVEIVIKRGIAELQRRGGMLERDQWITESEECEKEGAVITCQAIIRSTLGQGLEEEDQEAIWLDDARNSVARGCYETARAIYAYALRVFPSVQVLWREATNLEKQHGTKESLFDVLESAVEACPTSKDLWLLYSKEKLISSDLEGARSVLSRAFEHNPNDEDIWLAAVDIEAENNQHDRARLLLSRARQEAGTERVWIKSVVLERQLKDSEAALELVNQALHEYPKSAKSWMMKGQIYEVNNRIAQAREAYLSGTKSCPTSVTLWLLLSRLEESQGIIIRCRSVLERAALVNSKSPELWLERIRVEKRANNINQAKNLLAKALQECSMSGAIWAESVSMEPRTQRKPRLIAGLKTCENDPILIAAIARLFWSERRADKAKSWFEKAIKADSDVGDHWAMMNKFLQIYGTEQERNDLIAKFIMADPHHGELWTKIMKDVNNFGKSKEELLELASSQISP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.36
4 0.3
5 0.23
6 0.2
7 0.18
8 0.17
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.23
22 0.25
23 0.29
24 0.3
25 0.29
26 0.31
27 0.32
28 0.3
29 0.33
30 0.32
31 0.26
32 0.24
33 0.21
34 0.19
35 0.21
36 0.21
37 0.19
38 0.18
39 0.18
40 0.2
41 0.22
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.2
46 0.2
47 0.2
48 0.18
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.09
53 0.09
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.16
61 0.22
62 0.23
63 0.29
64 0.3
65 0.3
66 0.3
67 0.3
68 0.28
69 0.2
70 0.16
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.16
89 0.18
90 0.22
91 0.24
92 0.32
93 0.4
94 0.42
95 0.49
96 0.53
97 0.55
98 0.61
99 0.68
100 0.71
101 0.74
102 0.82
103 0.82
104 0.85
105 0.84
106 0.78
107 0.78
108 0.68
109 0.64
110 0.63
111 0.59
112 0.57
113 0.61
114 0.57
115 0.53
116 0.53
117 0.52
118 0.51
119 0.5
120 0.43
121 0.44
122 0.54
123 0.54
124 0.62
125 0.57
126 0.51
127 0.49
128 0.46
129 0.38
130 0.29
131 0.26
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.13
148 0.19
149 0.24
150 0.28
151 0.3
152 0.36
153 0.42
154 0.46
155 0.52
156 0.56
157 0.63
158 0.69
159 0.74
160 0.73
161 0.68
162 0.66
163 0.56
164 0.46
165 0.41
166 0.34
167 0.28
168 0.24
169 0.26
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.17
204 0.18
205 0.24
206 0.24
207 0.23
208 0.25
209 0.25
210 0.24
211 0.29
212 0.26
213 0.18
214 0.24
215 0.24
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.2
264 0.19
265 0.23
266 0.26
267 0.24
268 0.25
269 0.24
270 0.26
271 0.23
272 0.25
273 0.22
274 0.18
275 0.16
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.16
288 0.24
289 0.26
290 0.28
291 0.33
292 0.35
293 0.4
294 0.44
295 0.45
296 0.41
297 0.45
298 0.43
299 0.37
300 0.34
301 0.3
302 0.26
303 0.27
304 0.26
305 0.19
306 0.24
307 0.25
308 0.25
309 0.25
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.19
315 0.21
316 0.21
317 0.21
318 0.2
319 0.19
320 0.18
321 0.21
322 0.2
323 0.16
324 0.15
325 0.16
326 0.2
327 0.23
328 0.22
329 0.22
330 0.22
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.19
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.11
345 0.12
346 0.14
347 0.17
348 0.2
349 0.2
350 0.25
351 0.31
352 0.37
353 0.4
354 0.39
355 0.42
356 0.47
357 0.54
358 0.57
359 0.52
360 0.48
361 0.43
362 0.4
363 0.35
364 0.27
365 0.2
366 0.14
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.12
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.08
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.24
415 0.27
416 0.29
417 0.35
418 0.39
419 0.44
420 0.46
421 0.46
422 0.41
423 0.4
424 0.36
425 0.32
426 0.27
427 0.22
428 0.2
429 0.18
430 0.16
431 0.11
432 0.08
433 0.06
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.06
447 0.1
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.16
454 0.19
455 0.18
456 0.17
457 0.18
458 0.18
459 0.18
460 0.19
461 0.17
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.18
468 0.16
469 0.17
470 0.15
471 0.12
472 0.13
473 0.12
474 0.13
475 0.12
476 0.11
477 0.09
478 0.1
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.1
524 0.09
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.09
535 0.1
536 0.12
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.14
541 0.11
542 0.14
543 0.17
544 0.17
545 0.17
546 0.19
547 0.2
548 0.23
549 0.26
550 0.26
551 0.23
552 0.23
553 0.23
554 0.21
555 0.21
556 0.17
557 0.14
558 0.11
559 0.09
560 0.07
561 0.07
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.07
568 0.08
569 0.08
570 0.09
571 0.09
572 0.12
573 0.15
574 0.17
575 0.18
576 0.21
577 0.2
578 0.22
579 0.22
580 0.2
581 0.19
582 0.18
583 0.18
584 0.22
585 0.22
586 0.21
587 0.21
588 0.2
589 0.18
590 0.17
591 0.15
592 0.08
593 0.09
594 0.09
595 0.13
596 0.17
597 0.22
598 0.24
599 0.27
600 0.27
601 0.27
602 0.27
603 0.23
604 0.19
605 0.15
606 0.12
607 0.09
608 0.07
609 0.05
610 0.04
611 0.05
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.13
624 0.14
625 0.18
626 0.21
627 0.24
628 0.3
629 0.31
630 0.3
631 0.27
632 0.27
633 0.27
634 0.28
635 0.25
636 0.22
637 0.22
638 0.22
639 0.22
640 0.21
641 0.16
642 0.16
643 0.18
644 0.18
645 0.25
646 0.29
647 0.29
648 0.34
649 0.35
650 0.31
651 0.29
652 0.26
653 0.2
654 0.16
655 0.16
656 0.11
657 0.11
658 0.1
659 0.1
660 0.09
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.09
667 0.11
668 0.14
669 0.16
670 0.17
671 0.2
672 0.23
673 0.29
674 0.35
675 0.4
676 0.38
677 0.37
678 0.41
679 0.41
680 0.39
681 0.37
682 0.32
683 0.29
684 0.28
685 0.28
686 0.24
687 0.21
688 0.21
689 0.18
690 0.17
691 0.14
692 0.14
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.16
697 0.16
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.15
702 0.15
703 0.17
704 0.19
705 0.21
706 0.21
707 0.21
708 0.22
709 0.21
710 0.18
711 0.16
712 0.14
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.12
718 0.16
719 0.16
720 0.16
721 0.17
722 0.17
723 0.17
724 0.18
725 0.16
726 0.16
727 0.19
728 0.2
729 0.21
730 0.21
731 0.25
732 0.26
733 0.25
734 0.27
735 0.24
736 0.23
737 0.2
738 0.2
739 0.2
740 0.21
741 0.26
742 0.24
743 0.27
744 0.29
745 0.37
746 0.39
747 0.43
748 0.45
749 0.44
750 0.46
751 0.53
752 0.53
753 0.55
754 0.62
755 0.61
756 0.59
757 0.57
758 0.52
759 0.45
760 0.42
761 0.33
762 0.26
763 0.23
764 0.21
765 0.21
766 0.22
767 0.18
768 0.18
769 0.2
770 0.19
771 0.16
772 0.13
773 0.12
774 0.1
775 0.1
776 0.09
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.08
781 0.09
782 0.1
783 0.15
784 0.22
785 0.31
786 0.39
787 0.46
788 0.53
789 0.58
790 0.62
791 0.68
792 0.69
793 0.68
794 0.68
795 0.69
796 0.64
797 0.59
798 0.54
799 0.46
800 0.39
801 0.31
802 0.23
803 0.16
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.1
808 0.09
809 0.09
810 0.09
811 0.08
812 0.08
813 0.1
814 0.14
815 0.19
816 0.23
817 0.31
818 0.36
819 0.39
820 0.45
821 0.53
822 0.59
823 0.6
824 0.63
825 0.63
826 0.61
827 0.64
828 0.6
829 0.58
830 0.49
831 0.46
832 0.44
833 0.37
834 0.37
835 0.3
836 0.3
837 0.23
838 0.21
839 0.19
840 0.21
841 0.21
842 0.19
843 0.2
844 0.18
845 0.18
846 0.18
847 0.18
848 0.13
849 0.16
850 0.19
851 0.22
852 0.24
853 0.24
854 0.26
855 0.26
856 0.27
857 0.26
858 0.23
859 0.19
860 0.17
861 0.17
862 0.17
863 0.17
864 0.2
865 0.18
866 0.22
867 0.24
868 0.26
869 0.26
870 0.24
871 0.24
872 0.2
873 0.27
874 0.26
875 0.23
876 0.23
877 0.27
878 0.3
879 0.35
880 0.42
881 0.45
882 0.48
883 0.48
884 0.47
885 0.49
886 0.47
887 0.45
888 0.39
889 0.32
890 0.24
891 0.26
892 0.28
893 0.21
894 0.21