FuNGI

C7Z6W2

Protein Details

Accession

C7Z6W2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
328-356	KEAEYKRALKQKKKDKWKKNDTKAGREPH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
333-354	KRALKQKKKDKWKKNDTKAGRE
406-430	QRGRRGEFRGGRGGRGRGSGRGGRG

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, extr 8, cyto_nucl 7.5, nucl 2.5, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	nhe:NECHADRAFT_90849 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSGFQIPGLGQAKPNETLPPLPADVLVAAASVQGTETTNPEANNQAPAPAAEQPKPSEAQSTPAAAEPDAMVVDQPESPPSLTGALEAALGGLDNTPAQPAPAAATETVPLQNDQGENPEWEVDSSPYDSSSESSSSDSSEDDSDNEGYELLGVEETARLLMQAEGGSDDEGERGGKGSSSAQVRTKNEVAEEVIPKPEVTITPEMKIEELGAIEHIVENIMLVKAITPGEYQVLDSGSVLCTAERVVIGVVSETIGKVLQPMYTVRFTSEDEIKELGLEVGTKLFYPVDHASYVFTEPLKNMKGSDASNLHDEEVGDDEMEFSDDEKEAEYKRALKQKKKDKWKKNDTKAGREPHPLRQETRPDGGLNYDDDDDGPYKPLARPPGYGSGPSTTETYEPPPGRNFQRGRRGEFRGGRGGRGRGSGRGGRGGFNQPRDGYSMPPQGHQQQQQQPAPPAQWGNNQPPSQSAAAPAVPNFGFQFPGWPQPPAPANTGAAGASAVPPPPPGWPNAQGQQGANGGAFVNPAFFAALMSTMQAQQNGQSPWGQQQHPPNNGNGAKEAFKALEFSLRGVGFRDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.26
3	0.27
4	0.28
5	0.27
6	0.28
7	0.26
8	0.24
9	0.23
10	0.2
11	0.17
12	0.15
13	0.13
14	0.08
15	0.07
16	0.06
17	0.06
18	0.05
19	0.05
20	0.05
21	0.07
22	0.08
23	0.1
24	0.14
25	0.17
26	0.18
27	0.2
28	0.23
29	0.23
30	0.27
31	0.25
32	0.22
33	0.2
34	0.2
35	0.21
36	0.23
37	0.27
38	0.25
39	0.29
40	0.3
41	0.33
42	0.34
43	0.32
44	0.32
45	0.28
46	0.29
47	0.28
48	0.28
49	0.26
50	0.26
51	0.27
52	0.2
53	0.2
54	0.16
55	0.14
56	0.11
57	0.1
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.09
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.09
73	0.09
74	0.08
75	0.07
76	0.05
77	0.05
78	0.04
79	0.04
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.08
89	0.09
90	0.11
91	0.1
92	0.11
93	0.11
94	0.13
95	0.14
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.14
100	0.14
101	0.14
102	0.16
103	0.16
104	0.16
105	0.16
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.15
110	0.12
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.12
115	0.13
116	0.13
117	0.12
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.12
129	0.11
130	0.13
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.11
135	0.09
136	0.08
137	0.07
138	0.05
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.06
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.08
166	0.12
167	0.15
168	0.18
169	0.23
170	0.3
171	0.32
172	0.37
173	0.37
174	0.34
175	0.31
176	0.29
177	0.26
178	0.24
179	0.24
180	0.19
181	0.18
182	0.17
183	0.17
184	0.15
185	0.14
186	0.1
187	0.12
188	0.18
189	0.18
190	0.19
191	0.21
192	0.21
193	0.2
194	0.19
195	0.15
196	0.09
197	0.08
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.03
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.03
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.03
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.06
249	0.07
250	0.1
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.14
256	0.16
257	0.19
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.15
262	0.14
263	0.13
264	0.1
265	0.06
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.11
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.14
292	0.14
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.18
297	0.18
298	0.17
299	0.15
300	0.15
301	0.11
302	0.1
303	0.09
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.08
316	0.08
317	0.1
318	0.11
319	0.14
320	0.2
321	0.28
322	0.35
323	0.42
324	0.51
325	0.6
326	0.68
327	0.76
328	0.81
329	0.83
330	0.87
331	0.9
332	0.92
333	0.91
334	0.92
335	0.87
336	0.87
337	0.84
338	0.8
339	0.73
340	0.71
341	0.64
342	0.62
343	0.64
344	0.56
345	0.51
346	0.51
347	0.54
348	0.5
349	0.49
350	0.42
351	0.34
352	0.32
353	0.3
354	0.25
355	0.18
356	0.15
357	0.13
358	0.11
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.11
364	0.09
365	0.11
366	0.12
367	0.15
368	0.21
369	0.22
370	0.23
371	0.26
372	0.33
373	0.33
374	0.33
375	0.31
376	0.27
377	0.26
378	0.25
379	0.22
380	0.15
381	0.15
382	0.15
383	0.17
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.25
388	0.3
389	0.33
390	0.41
391	0.43
392	0.44
393	0.54
394	0.56
395	0.61
396	0.63
397	0.65
398	0.65
399	0.65
400	0.61
401	0.61
402	0.56
403	0.53
404	0.51
405	0.47
406	0.39
407	0.39
408	0.36
409	0.29
410	0.33
411	0.33
412	0.3
413	0.34
414	0.33
415	0.29
416	0.32
417	0.38
418	0.38
419	0.38
420	0.4
421	0.34
422	0.34
423	0.36
424	0.34
425	0.28
426	0.3
427	0.34
428	0.31
429	0.32
430	0.35
431	0.36
432	0.42
433	0.45
434	0.47
435	0.48
436	0.56
437	0.59
438	0.6
439	0.58
440	0.54
441	0.48
442	0.43
443	0.38
444	0.32
445	0.35
446	0.36
447	0.4
448	0.46
449	0.45
450	0.42
451	0.41
452	0.41
453	0.36
454	0.3
455	0.24
456	0.18
457	0.2
458	0.21
459	0.19
460	0.19
461	0.17
462	0.18
463	0.17
464	0.15
465	0.15
466	0.13
467	0.19
468	0.17
469	0.26
470	0.26
471	0.27
472	0.26
473	0.3
474	0.35
475	0.32
476	0.34
477	0.28
478	0.28
479	0.26
480	0.27
481	0.21
482	0.16
483	0.14
484	0.1
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.09
490	0.1
491	0.14
492	0.16
493	0.17
494	0.22
495	0.26
496	0.32
497	0.37
498	0.41
499	0.39
500	0.38
501	0.4
502	0.35
503	0.31
504	0.24
505	0.19
506	0.14
507	0.12
508	0.12
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.11
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.22
527	0.22
528	0.23
529	0.22
530	0.23
531	0.3
532	0.37
533	0.36
534	0.36
535	0.46
536	0.54
537	0.6
538	0.61
539	0.55
540	0.57
541	0.58
542	0.54
543	0.47
544	0.41
545	0.35
546	0.34
547	0.33
548	0.25
549	0.22
550	0.23
551	0.19
552	0.23
553	0.21
554	0.22
555	0.25
556	0.25
557	0.25

C7Z6W2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer