Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SJJ0

Protein Details
Accession A0A1E4SJJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30LSQEINKKRKANDRGRISKKGKPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-31KKRKANDRGRISKKGKPSV
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFSSLLSQEINKKRKANDRGRISKKGKPSVPPKESVPDEEKQLATLEGEQKQTQDKDGQTTHQDEESELVNSISDEQLREKLLEFNETDTDSDKLTLVKKLQILTRNQNRLNKYRDQIQLESRLHEAPEKKMITMESILNTHKFQDELYVQLRVYIKDLIKEWEEEESKKPEQEALLHETKVDLVKVLYKLRVHKLTPDMLTSLTTIMYYIQNSEYRKANESYMKLSIGNVAWPIGVRDVGIHARSADLKIAKANANIMIDDKTRRWITSIKRLLTFKERQWDKSHIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.65
3 0.73
4 0.74
5 0.74
6 0.79
7 0.83
8 0.86
9 0.89
10 0.84
11 0.8
12 0.79
13 0.79
14 0.73
15 0.72
16 0.74
17 0.75
18 0.75
19 0.72
20 0.66
21 0.65
22 0.62
23 0.59
24 0.53
25 0.44
26 0.44
27 0.44
28 0.39
29 0.32
30 0.3
31 0.24
32 0.19
33 0.21
34 0.22
35 0.21
36 0.25
37 0.24
38 0.25
39 0.3
40 0.3
41 0.29
42 0.29
43 0.27
44 0.31
45 0.32
46 0.35
47 0.34
48 0.37
49 0.35
50 0.31
51 0.3
52 0.24
53 0.23
54 0.2
55 0.16
56 0.13
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.17
70 0.17
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.15
86 0.18
87 0.2
88 0.21
89 0.25
90 0.29
91 0.33
92 0.4
93 0.48
94 0.52
95 0.55
96 0.58
97 0.59
98 0.6
99 0.6
100 0.56
101 0.5
102 0.5
103 0.51
104 0.5
105 0.48
106 0.46
107 0.49
108 0.43
109 0.42
110 0.36
111 0.3
112 0.25
113 0.26
114 0.24
115 0.17
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.19
122 0.19
123 0.17
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.17
140 0.18
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.16
152 0.18
153 0.18
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.2
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.22
167 0.21
168 0.21
169 0.18
170 0.14
171 0.08
172 0.06
173 0.1
174 0.13
175 0.15
176 0.18
177 0.2
178 0.25
179 0.31
180 0.36
181 0.33
182 0.36
183 0.38
184 0.4
185 0.38
186 0.35
187 0.29
188 0.24
189 0.24
190 0.19
191 0.15
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.16
201 0.18
202 0.21
203 0.25
204 0.26
205 0.3
206 0.3
207 0.32
208 0.34
209 0.35
210 0.36
211 0.33
212 0.32
213 0.28
214 0.27
215 0.25
216 0.19
217 0.18
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.1
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.15
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.17
237 0.17
238 0.19
239 0.23
240 0.24
241 0.24
242 0.25
243 0.24
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.21
248 0.2
249 0.23
250 0.22
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.29
255 0.34
256 0.4
257 0.47
258 0.55
259 0.53
260 0.57
261 0.59
262 0.61
263 0.63
264 0.62
265 0.57
266 0.59
267 0.59
268 0.57
269 0.62