Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SS06

Protein Details
Accession A0A1E4SS06    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-278QLSNWFINARRRKIKSLKEQRRLNLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-267RRKIK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSNRNKINLPPISDILLNHPQGPVPVGSASPLAAGAYAPSRPAQSPPVLPPLSRQNSHLPLPMPQPQAAAHQYKYYDYYYGNSSQVPYPQPNYYNTPPYTGGQYYAPPYGARPAQSLSFAPKQPVMAANATPSGHILARSPLSNNASPVYTNDVTPPPLSLRHSYKGVPSAKMTSPSEEDDQDDDSSARSDSDSSPSSSSVLHGGSKRKTRNNLPKETTYILLKWLNDHLNHPYPNSFEKNQLMISTGLNQQQLSNWFINARRRKIKSLKEQRRLNLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.37
4 0.32
5 0.28
6 0.27
7 0.24
8 0.24
9 0.25
10 0.18
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.09
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.12
28 0.13
29 0.16
30 0.2
31 0.22
32 0.26
33 0.29
34 0.37
35 0.36
36 0.35
37 0.36
38 0.42
39 0.44
40 0.41
41 0.41
42 0.4
43 0.44
44 0.46
45 0.46
46 0.37
47 0.34
48 0.38
49 0.42
50 0.37
51 0.32
52 0.31
53 0.28
54 0.32
55 0.33
56 0.32
57 0.25
58 0.25
59 0.26
60 0.26
61 0.28
62 0.23
63 0.2
64 0.17
65 0.18
66 0.19
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.19
71 0.18
72 0.21
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.24
77 0.26
78 0.28
79 0.33
80 0.33
81 0.37
82 0.35
83 0.35
84 0.34
85 0.32
86 0.33
87 0.26
88 0.24
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.12
95 0.12
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.19
112 0.16
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.18
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.26
152 0.27
153 0.33
154 0.33
155 0.3
156 0.27
157 0.28
158 0.27
159 0.31
160 0.3
161 0.25
162 0.24
163 0.26
164 0.26
165 0.22
166 0.22
167 0.18
168 0.2
169 0.17
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.13
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.16
186 0.16
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.17
191 0.23
192 0.28
193 0.36
194 0.43
195 0.48
196 0.55
197 0.62
198 0.7
199 0.73
200 0.77
201 0.75
202 0.73
203 0.7
204 0.65
205 0.57
206 0.49
207 0.39
208 0.34
209 0.31
210 0.27
211 0.23
212 0.26
213 0.28
214 0.26
215 0.29
216 0.31
217 0.35
218 0.36
219 0.36
220 0.33
221 0.32
222 0.37
223 0.4
224 0.35
225 0.34
226 0.36
227 0.37
228 0.36
229 0.33
230 0.29
231 0.24
232 0.24
233 0.21
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.23
238 0.21
239 0.23
240 0.25
241 0.26
242 0.23
243 0.21
244 0.23
245 0.28
246 0.38
247 0.43
248 0.5
249 0.55
250 0.6
251 0.69
252 0.76
253 0.81
254 0.82
255 0.84
256 0.86
257 0.86
258 0.9