Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SBP1

Protein Details
Accession A0A1E4SBP1    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-189SAPARAPKPAKPKRAKPVKKSADDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-55NKRGSSSRRGGLARKNPSSRVNKPGRASRPPPTRNPR
163-184PRSAPARAPKPAKPKRAKPVKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDILEKSLDDIIGENKSNKRGSSSRRGGLARKNPSSRVNKPGRASRPPPTRNPRSSPNSGLPREIVSMAGSRPVLRVRNIHPELNGEDLSNLFGTISPVDFVKFDNKNDSIAYVCFQRDNARSNGEAIAKYDGKKAMGQLLGVESATSLAARIGSLPVRNQPRSAPARAPKPAKPKRAKPVKKSADDLDNELEAYMNANGGATGASEPVQTQPVGEVASSENGATNNGANEGDDDMNVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.25
4 0.31
5 0.33
6 0.32
7 0.36
8 0.4
9 0.47
10 0.53
11 0.57
12 0.56
13 0.61
14 0.64
15 0.63
16 0.65
17 0.67
18 0.65
19 0.65
20 0.65
21 0.63
22 0.68
23 0.71
24 0.67
25 0.68
26 0.68
27 0.66
28 0.68
29 0.73
30 0.72
31 0.72
32 0.71
33 0.71
34 0.72
35 0.71
36 0.75
37 0.76
38 0.78
39 0.76
40 0.77
41 0.76
42 0.73
43 0.73
44 0.68
45 0.67
46 0.66
47 0.6
48 0.56
49 0.48
50 0.41
51 0.37
52 0.31
53 0.22
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.15
62 0.17
63 0.18
64 0.23
65 0.24
66 0.35
67 0.38
68 0.37
69 0.34
70 0.34
71 0.33
72 0.32
73 0.28
74 0.17
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.1
79 0.08
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.13
91 0.15
92 0.16
93 0.2
94 0.21
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.14
106 0.15
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.19
114 0.17
115 0.14
116 0.16
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.17
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.33
151 0.37
152 0.39
153 0.41
154 0.4
155 0.47
156 0.53
157 0.57
158 0.55
159 0.61
160 0.66
161 0.69
162 0.72
163 0.74
164 0.77
165 0.84
166 0.87
167 0.85
168 0.87
169 0.86
170 0.82
171 0.78
172 0.72
173 0.69
174 0.61
175 0.55
176 0.47
177 0.37
178 0.31
179 0.26
180 0.21
181 0.13
182 0.13
183 0.09
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.13