Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YN23

Protein Details
Accession C7YN23    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-77VTPVNVEAPPKKRKRNDDDANTADVKKKAKKEKKDKKHKKESRKERKDKRKNLQDLPEQDDBasic
108-135AADSDKAAKKKKKDKKNKDKESQQEEEEBasic
142-168ANDESSSKKKKKSKKDKKSSSETTTNDHydrophilic
278-316GGGGKTKRRQEKIQEKNRKLDENRTKRIQREKNAKVEARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-31PKKRKR
41-67VKKKAKKEKKDKKHKKESRKERKDKRK
113-126KAAKKKKKDKKNKD
149-159KKKKKSKKDKK
281-309GKTKRRQEKIQEKNRKLDENRTKRIQREK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nhe:NECHADRAFT_78080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MKSKRAREAVEAEDKHVTPVNVEAPPKKRKRNDDDANTADVKKKAKKEKKDKKHKKESRKERKDKRKNLQDLPEQDDDEEVVDEPAAAAEDSPMADADVKPASATADAADSDKAAKKKKKDKKNKDKESQQEEEEPTADAEANDESSSKKKKKSKKDKKSSSETTTNDNNNNEAIPNGAEADTAAADADSKADRHIVFVGNLPFTATADTIQAHFASLSPIHVRCMSDPNDSKPCRGFAFVEFAKVWHMRTCLDKFHHSMFEDGVSPARRINVELTAGGGGKTKRRQEKIQEKNRKLDENRTKRIQREKNAKVEARANTDQEQHMEDAIHPSRRGRVPGNACLMNQVLDGYTKVVTKPKELLPIWNPGQSQLSRRIASPSSMT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.42
3 0.39
4 0.31
5 0.22
6 0.24
7 0.26
8 0.25
9 0.3
10 0.35
11 0.39
12 0.5
13 0.58
14 0.65
15 0.69
16 0.75
17 0.8
18 0.84
19 0.87
20 0.86
21 0.87
22 0.8
23 0.77
24 0.69
25 0.61
26 0.55
27 0.48
28 0.45
29 0.43
30 0.49
31 0.54
32 0.62
33 0.71
34 0.77
35 0.85
36 0.89
37 0.93
38 0.95
39 0.95
40 0.97
41 0.96
42 0.96
43 0.96
44 0.96
45 0.96
46 0.96
47 0.96
48 0.96
49 0.97
50 0.96
51 0.96
52 0.96
53 0.95
54 0.93
55 0.91
56 0.9
57 0.87
58 0.82
59 0.78
60 0.7
61 0.6
62 0.5
63 0.41
64 0.32
65 0.23
66 0.17
67 0.11
68 0.07
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.1
99 0.14
100 0.18
101 0.26
102 0.31
103 0.4
104 0.51
105 0.61
106 0.69
107 0.77
108 0.84
109 0.87
110 0.92
111 0.94
112 0.93
113 0.93
114 0.92
115 0.89
116 0.82
117 0.73
118 0.68
119 0.59
120 0.5
121 0.4
122 0.31
123 0.22
124 0.18
125 0.15
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.12
134 0.21
135 0.25
136 0.33
137 0.41
138 0.5
139 0.61
140 0.72
141 0.78
142 0.81
143 0.88
144 0.91
145 0.91
146 0.92
147 0.88
148 0.83
149 0.8
150 0.7
151 0.64
152 0.6
153 0.54
154 0.48
155 0.41
156 0.34
157 0.26
158 0.25
159 0.19
160 0.13
161 0.1
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.19
213 0.2
214 0.25
215 0.27
216 0.31
217 0.39
218 0.4
219 0.4
220 0.36
221 0.36
222 0.3
223 0.29
224 0.26
225 0.18
226 0.25
227 0.23
228 0.25
229 0.22
230 0.21
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.16
235 0.17
236 0.15
237 0.21
238 0.24
239 0.26
240 0.3
241 0.33
242 0.33
243 0.36
244 0.39
245 0.33
246 0.32
247 0.26
248 0.23
249 0.21
250 0.18
251 0.18
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.16
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.18
269 0.24
270 0.31
271 0.39
272 0.45
273 0.53
274 0.6
275 0.7
276 0.75
277 0.8
278 0.83
279 0.8
280 0.83
281 0.81
282 0.79
283 0.72
284 0.72
285 0.72
286 0.71
287 0.74
288 0.74
289 0.74
290 0.73
291 0.8
292 0.78
293 0.77
294 0.78
295 0.78
296 0.79
297 0.82
298 0.77
299 0.71
300 0.69
301 0.64
302 0.61
303 0.56
304 0.5
305 0.44
306 0.45
307 0.41
308 0.36
309 0.33
310 0.26
311 0.23
312 0.2
313 0.18
314 0.22
315 0.25
316 0.27
317 0.25
318 0.26
319 0.33
320 0.36
321 0.41
322 0.38
323 0.43
324 0.46
325 0.53
326 0.58
327 0.53
328 0.49
329 0.47
330 0.43
331 0.34
332 0.27
333 0.2
334 0.13
335 0.11
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.2
342 0.21
343 0.25
344 0.3
345 0.34
346 0.42
347 0.42
348 0.48
349 0.46
350 0.53
351 0.52
352 0.51
353 0.46
354 0.39
355 0.45
356 0.39
357 0.4
358 0.4
359 0.45
360 0.41
361 0.42
362 0.45
363 0.41