FuNGI

A0A1E4SM79

Protein Details

Accession

A0A1E4SM79

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-92	VEDFTKPVRLHRKDPRNIQFQ	Hydrophilic
149-171	PDGGARRSKKNIFKKKTRQISLV	Hydrophilic
488-507	ASPKKKAKVDGDKSPKKIKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
153-165	ARRSKKNIFKKKT
383-385	GKK
479-506	GRKRPAPVLASPKKKAKVDGDKSPKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSLSPAKKEIKVKSEAETTPLTSQSSSNSTPKPSSSSDGWQDIPLKSCTKEEVSDIRYHIMKFQSTRDVDVVEDFTKPVRLHRKDPRNIQFQLTRQEIDRRKKQLAIDKANGVVHEPTEEELIAEDEAAIARGEEPRRYPRADMSQVAPDGGARRSKKNIFKKKTRQISLVDDAKRKLRYEEYYPWVIEDYDGSNVFVGNYEAGASDTQHVLFVFDKDGFKMVPAEKVYKFTPRNKYATLTLEEAEAKMEKNSSVPRWLMKHMEEKSIADNTQDSRFRGSAPGNGIVAPASTNNSRRLRTVLGGGSNDRDSDHDDLDFDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSERRVKKEMLKAAHFDGQSDAEIDDELDDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSEDDDQLNPYLSKSDLESDDESDDEPTVKQEDAEGVSKESDTKKSGRSLIAQNVGDGFVVIKAPAEFLNTFPKGNWIPNGRKRPAPVLASPKKKAKVDGDKSPKKIKSETERSISPTPIISLSVDLDSSGPDGVLVTIKEVLNMVKNNPLTTKELLLSLKTRVNAHRDNKQRIISIVKQNLKLVDGKLVLKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.54
3	0.5
4	0.45
5	0.41
6	0.37
7	0.36
8	0.31
9	0.24
10	0.24
11	0.24
12	0.27
13	0.29
14	0.32
15	0.34
16	0.38
17	0.4
18	0.42
19	0.43
20	0.4
21	0.41
22	0.39
23	0.43
24	0.44
25	0.46
26	0.45
27	0.43
28	0.44
29	0.41
30	0.4
31	0.36
32	0.33
33	0.3
34	0.31
35	0.31
36	0.3
37	0.3
38	0.32
39	0.37
40	0.38
41	0.41
42	0.41
43	0.4
44	0.39
45	0.38
46	0.37
47	0.33
48	0.34
49	0.31
50	0.35
51	0.4
52	0.39
53	0.42
54	0.38
55	0.34
56	0.3
57	0.3
58	0.28
59	0.19
60	0.19
61	0.16
62	0.15
63	0.19
64	0.19
65	0.25
66	0.32
67	0.37
68	0.46
69	0.56
70	0.66
71	0.7
72	0.81
73	0.82
74	0.8
75	0.77
76	0.74
77	0.7
78	0.65
79	0.64
80	0.57
81	0.49
82	0.43
83	0.5
84	0.52
85	0.55
86	0.59
87	0.58
88	0.58
89	0.61
90	0.65
91	0.65
92	0.67
93	0.66
94	0.62
95	0.58
96	0.57
97	0.53
98	0.46
99	0.39
100	0.29
101	0.2
102	0.16
103	0.13
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.09
108	0.08
109	0.09
110	0.08
111	0.07
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.06
116	0.05
117	0.04
118	0.05
119	0.1
120	0.13
121	0.15
122	0.2
123	0.27
124	0.32
125	0.34
126	0.35
127	0.38
128	0.45
129	0.47
130	0.46
131	0.41
132	0.42
133	0.4
134	0.38
135	0.3
136	0.22
137	0.19
138	0.19
139	0.23
140	0.2
141	0.25
142	0.32
143	0.4
144	0.49
145	0.58
146	0.67
147	0.69
148	0.78
149	0.84
150	0.88
151	0.9
152	0.85
153	0.79
154	0.74
155	0.72
156	0.69
157	0.66
158	0.61
159	0.54
160	0.51
161	0.51
162	0.48
163	0.41
164	0.37
165	0.35
166	0.34
167	0.38
168	0.44
169	0.44
170	0.45
171	0.44
172	0.41
173	0.35
174	0.3
175	0.23
176	0.16
177	0.12
178	0.1
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.07
186	0.05
187	0.04
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.07
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.12
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.13
210	0.16
211	0.17
212	0.21
213	0.21
214	0.24
215	0.25
216	0.3
217	0.35
218	0.38
219	0.46
220	0.48
221	0.52
222	0.51
223	0.52
224	0.47
225	0.46
226	0.4
227	0.32
228	0.26
229	0.23
230	0.21
231	0.18
232	0.15
233	0.11
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.09
239	0.13
240	0.14
241	0.17
242	0.18
243	0.21
244	0.23
245	0.26
246	0.26
247	0.26
248	0.33
249	0.31
250	0.33
251	0.31
252	0.29
253	0.29
254	0.27
255	0.24
256	0.16
257	0.16
258	0.14
259	0.19
260	0.2
261	0.18
262	0.19
263	0.19
264	0.19
265	0.21
266	0.2
267	0.18
268	0.19
269	0.2
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.13
274	0.12
275	0.08
276	0.06
277	0.06
278	0.08
279	0.1
280	0.18
281	0.22
282	0.22
283	0.23
284	0.26
285	0.25
286	0.24
287	0.26
288	0.2
289	0.19
290	0.19
291	0.19
292	0.18
293	0.16
294	0.15
295	0.12
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.12
304	0.11
305	0.08
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.08
328	0.15
329	0.19
330	0.23
331	0.28
332	0.33
333	0.39
334	0.46
335	0.52
336	0.51
337	0.48
338	0.46
339	0.44
340	0.44
341	0.37
342	0.3
343	0.25
344	0.2
345	0.17
346	0.15
347	0.12
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.12
362	0.15
363	0.18
364	0.19
365	0.25
366	0.34
367	0.41
368	0.51
369	0.58
370	0.65
371	0.7
372	0.77
373	0.77
374	0.77
375	0.75
376	0.74
377	0.73
378	0.66
379	0.6
380	0.55
381	0.49
382	0.41
383	0.34
384	0.26
385	0.18
386	0.15
387	0.14
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.1
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.13
401	0.13
402	0.16
403	0.18
404	0.18
405	0.18
406	0.18
407	0.17
408	0.14
409	0.13
410	0.1
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.11
418	0.13
419	0.16
420	0.15
421	0.15
422	0.15
423	0.15
424	0.18
425	0.18
426	0.19
427	0.2
428	0.22
429	0.25
430	0.3
431	0.35
432	0.34
433	0.38
434	0.41
435	0.45
436	0.49
437	0.44
438	0.39
439	0.36
440	0.33
441	0.27
442	0.2
443	0.13
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.07
450	0.07
451	0.1
452	0.1
453	0.12
454	0.21
455	0.21
456	0.22
457	0.21
458	0.27
459	0.26
460	0.28
461	0.33
462	0.32
463	0.41
464	0.5
465	0.6
466	0.58
467	0.6
468	0.61
469	0.61
470	0.6
471	0.55
472	0.53
473	0.54
474	0.6
475	0.64
476	0.66
477	0.68
478	0.67
479	0.65
480	0.64
481	0.63
482	0.65
483	0.64
484	0.69
485	0.72
486	0.75
487	0.78
488	0.81
489	0.75
490	0.69
491	0.67
492	0.65
493	0.65
494	0.67
495	0.68
496	0.65
497	0.63
498	0.65
499	0.63
500	0.55
501	0.46
502	0.36
503	0.3
504	0.25
505	0.23
506	0.17
507	0.15
508	0.15
509	0.14
510	0.13
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.08
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.08
522	0.09
523	0.13
524	0.13
525	0.13
526	0.14
527	0.15
528	0.19
529	0.21
530	0.21
531	0.25
532	0.26
533	0.28
534	0.29
535	0.31
536	0.3
537	0.3
538	0.32
539	0.26
540	0.29
541	0.29
542	0.3
543	0.29
544	0.29
545	0.3
546	0.3
547	0.34
548	0.35
549	0.42
550	0.48
551	0.53
552	0.58
553	0.64
554	0.7
555	0.73
556	0.72
557	0.67
558	0.61
559	0.62
560	0.61
561	0.62
562	0.62
563	0.62
564	0.6
565	0.6
566	0.58
567	0.52
568	0.47
569	0.38
570	0.36
571	0.32

A0A1E4SM79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer