FuNGI

A0A1E4SMT6

Protein Details

Accession

A0A1E4SMT6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-29	LDDLKSKSFDKKKHPNAYSKSFAD	Hydrophilic
464-492	EKKVYSKKLKTTNQWKKLLRKKKNVILDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
482-485	LRKK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto 5, pero 4, cyto_mito 3.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MYKSFLDDLKSKSFDKKKHPNAYSKSFADIDDQSFDRITDEDRKEVSWSSQYDPVTRSPFAKDVIHLHSLLDALLASKNFDRAERILGAIYPLLSNPESFIFTLNEYLKLWALEDTTTLDDVEASLSKFTTKFPATRLNDRTYAILLTKYMSTNTPYIDYISKFTVQKTRQIFTHIDIIGTEGLMEIFKHPEISESHVPNDFIHLFKQVRGELVQDVPQYFTQDLQAPTIEKDSEDLKPVDSFGLKIIRHTLLGLKEETGSGEFEAILKDLEKDLNGHLLHNASETPMSSKRDYFQLYKTLKTQEQKDKFNEALDLFNEARQRQLEIRGVDGAKEKWKHEFEEMQKRGGISLNKGLNAQLFKWYSEFLPYVEEEIKQCQNILLGTIDKEGLSAEELKVIKEREFYAPYLVLVPPQKMCVVTILELLKLTSTGGIDNGMRAARALISVGKAIELEYRSQALVNTEKKVYSKKLKTTNQWKKLLRKKKNVILDSTTNQPNDWSYTVYAKIGAVLVSLLKHVAKVPVKGIDPTTGKSITGSQPAIHHTYKYSNGQKLGVFIIHKEVVKQLAGKSFSNCVQPQLLPMLVPPRPWNSYNDGGYLFSQTQLVRIKDSVETSAYLKAASEMGNLDEIYQGLNVLGNTAWTVNRRVLDVITKHWNTGKEFLDIPPIIEEPNLPKAIPLDAEPNEKFEYQKKVRQAINDAASAKSQRCDTNYKLEIARGFLGEKLFFPHNVDFRGRAYPLSPHFNHLGNDLTRSLFLFWEGKEIGENGLRWLKIHLANVFGIDKAPLAKRVEFVNENLENIFQSAQNPYDPQAWWLKGEKPWQVLSVCFELNEAYKMSDPTKFVSHIPVHQDGTCNGLQHYAALGGDIEGARQVNLLPADKPQDVYSFVASLVQKRIDSEAEEGNKYALFLQDKITRKVVKQTVMTNVYGVTFVGAAAQIKKQLDHHFTKDMEEDVVDYARYLTLHVFASVRELFEGAHHIQDWLGESAKRISKSVRIDYEDSQVANKPNHLSSVIWTTPLGLPCVQPYRVAKNQLIKTNLQDISISDPFGTSQVDARKQQAAFPPNFVHSLDATHMLMTSRSCGEKGLSFAAVHDSYWTHASDVDIMNAEIRNQFVNLHKSNLINQVRDEFEKRYKDCLQVILIPGDHELAKKIKDIRRNIVKSLGRALTVADEIYLEKKRLQLLGSSDPSVVQTGKEMITTVSITEGYNVEELTVSSASSKAFQILVPLKFPEVPERGDLDVELVKESDYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.63
3	0.69
4	0.72
5	0.79
6	0.85
7	0.85
8	0.86
9	0.86
10	0.83
11	0.74
12	0.68
13	0.58
14	0.51
15	0.46
16	0.4
17	0.34
18	0.3
19	0.29
20	0.26
21	0.25
22	0.24
23	0.2
24	0.17
25	0.19
26	0.24
27	0.27
28	0.3
29	0.32
30	0.33
31	0.34
32	0.35
33	0.36
34	0.33
35	0.33
36	0.32
37	0.36
38	0.37
39	0.39
40	0.39
41	0.41
42	0.39
43	0.38
44	0.36
45	0.35
46	0.37
47	0.36
48	0.36
49	0.33
50	0.34
51	0.38
52	0.38
53	0.34
54	0.3
55	0.28
56	0.25
57	0.21
58	0.15
59	0.09
60	0.07
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.12
65	0.16
66	0.17
67	0.18
68	0.22
69	0.21
70	0.26
71	0.25
72	0.26
73	0.23
74	0.22
75	0.23
76	0.19
77	0.17
78	0.12
79	0.11
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.13
85	0.15
86	0.15
87	0.17
88	0.15
89	0.15
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.2
94	0.21
95	0.2
96	0.19
97	0.18
98	0.14
99	0.14
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.14
104	0.14
105	0.13
106	0.12
107	0.11
108	0.1
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.11
115	0.12
116	0.13
117	0.19
118	0.22
119	0.24
120	0.28
121	0.39
122	0.43
123	0.53
124	0.58
125	0.56
126	0.55
127	0.54
128	0.51
129	0.42
130	0.38
131	0.29
132	0.24
133	0.18
134	0.17
135	0.17
136	0.16
137	0.16
138	0.16
139	0.18
140	0.19
141	0.2
142	0.21
143	0.19
144	0.21
145	0.24
146	0.23
147	0.23
148	0.24
149	0.27
150	0.26
151	0.29
152	0.35
153	0.34
154	0.4
155	0.43
156	0.43
157	0.4
158	0.44
159	0.43
160	0.36
161	0.43
162	0.35
163	0.29
164	0.26
165	0.26
166	0.21
167	0.18
168	0.15
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.06
174	0.08
175	0.09
176	0.1
177	0.1
178	0.13
179	0.14
180	0.22
181	0.28
182	0.29
183	0.31
184	0.33
185	0.34
186	0.31
187	0.35
188	0.28
189	0.22
190	0.2
191	0.24
192	0.22
193	0.24
194	0.28
195	0.23
196	0.24
197	0.24
198	0.24
199	0.21
200	0.22
201	0.24
202	0.22
203	0.21
204	0.21
205	0.21
206	0.22
207	0.19
208	0.18
209	0.16
210	0.2
211	0.2
212	0.19
213	0.2
214	0.19
215	0.19
216	0.21
217	0.19
218	0.14
219	0.14
220	0.16
221	0.16
222	0.19
223	0.19
224	0.18
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.16
229	0.15
230	0.14
231	0.21
232	0.19
233	0.2
234	0.24
235	0.23
236	0.23
237	0.23
238	0.24
239	0.2
240	0.23
241	0.23
242	0.19
243	0.19
244	0.18
245	0.18
246	0.15
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.11
262	0.17
263	0.17
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.16
269	0.15
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.13
274	0.17
275	0.21
276	0.22
277	0.24
278	0.25
279	0.31
280	0.35
281	0.34
282	0.33
283	0.39
284	0.39
285	0.41
286	0.43
287	0.42
288	0.44
289	0.46
290	0.51
291	0.52
292	0.57
293	0.61
294	0.62
295	0.62
296	0.57
297	0.52
298	0.47
299	0.37
300	0.32
301	0.25
302	0.25
303	0.2
304	0.21
305	0.23
306	0.19
307	0.21
308	0.19
309	0.21
310	0.19
311	0.24
312	0.28
313	0.25
314	0.27
315	0.29
316	0.28
317	0.27
318	0.28
319	0.24
320	0.26
321	0.28
322	0.28
323	0.31
324	0.33
325	0.34
326	0.36
327	0.42
328	0.44
329	0.52
330	0.53
331	0.47
332	0.46
333	0.43
334	0.39
335	0.35
336	0.29
337	0.21
338	0.27
339	0.27
340	0.26
341	0.27
342	0.26
343	0.25
344	0.24
345	0.21
346	0.2
347	0.19
348	0.19
349	0.2
350	0.2
351	0.17
352	0.19
353	0.19
354	0.13
355	0.14
356	0.14
357	0.16
358	0.16
359	0.16
360	0.14
361	0.18
362	0.19
363	0.17
364	0.17
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.1
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.12
382	0.12
383	0.13
384	0.16
385	0.17
386	0.17
387	0.18
388	0.2
389	0.2
390	0.22
391	0.23
392	0.22
393	0.22
394	0.21
395	0.21
396	0.18
397	0.17
398	0.16
399	0.17
400	0.14
401	0.15
402	0.15
403	0.13
404	0.14
405	0.13
406	0.13
407	0.12
408	0.15
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.13
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.12
447	0.17
448	0.19
449	0.21
450	0.21
451	0.22
452	0.23
453	0.27
454	0.31
455	0.35
456	0.39
457	0.45
458	0.54
459	0.6
460	0.68
461	0.75
462	0.79
463	0.78
464	0.8
465	0.79
466	0.79
467	0.82
468	0.83
469	0.82
470	0.82
471	0.81
472	0.79
473	0.82
474	0.75
475	0.7
476	0.64
477	0.59
478	0.5
479	0.48
480	0.43
481	0.34
482	0.31
483	0.26
484	0.22
485	0.19
486	0.18
487	0.14
488	0.12
489	0.14
490	0.15
491	0.14
492	0.14
493	0.11
494	0.1
495	0.09
496	0.07
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.12
507	0.14
508	0.15
509	0.17
510	0.2
511	0.21
512	0.21
513	0.22
514	0.21
515	0.2
516	0.2
517	0.22
518	0.18
519	0.17
520	0.17
521	0.19
522	0.16
523	0.18
524	0.18
525	0.15
526	0.17
527	0.19
528	0.23
529	0.21
530	0.19
531	0.17
532	0.19
533	0.22
534	0.28
535	0.31
536	0.29
537	0.3
538	0.32
539	0.31
540	0.29
541	0.26
542	0.21
543	0.15
544	0.12
545	0.14
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.13
550	0.12
551	0.13
552	0.14
553	0.12
554	0.15
555	0.17
556	0.18
557	0.18
558	0.19
559	0.21
560	0.24
561	0.23
562	0.2
563	0.19
564	0.18
565	0.17
566	0.17
567	0.15
568	0.1
569	0.1
570	0.13
571	0.12
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.19
576	0.2
577	0.22
578	0.23
579	0.28
580	0.27
581	0.27
582	0.24
583	0.22
584	0.21
585	0.2
586	0.14
587	0.1
588	0.11
589	0.09
590	0.12
591	0.16
592	0.16
593	0.15
594	0.16
595	0.17
596	0.16
597	0.17
598	0.14
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.13
603	0.11
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.04
620	0.03
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.05
628	0.05
629	0.06
630	0.08
631	0.1
632	0.1
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.15
637	0.15
638	0.17
639	0.23
640	0.23
641	0.23
642	0.25
643	0.27
644	0.24
645	0.29
646	0.27
647	0.21
648	0.21
649	0.21
650	0.24
651	0.21
652	0.2
653	0.15
654	0.14
655	0.12
656	0.11
657	0.11
658	0.08
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.11
663	0.12
664	0.12
665	0.12
666	0.11
667	0.12
668	0.13
669	0.18
670	0.18
671	0.2
672	0.21
673	0.21
674	0.21
675	0.2
676	0.28
677	0.28
678	0.33
679	0.36
680	0.41
681	0.43
682	0.45
683	0.46
684	0.42
685	0.41
686	0.39
687	0.34
688	0.28
689	0.26
690	0.25
691	0.2
692	0.16
693	0.15
694	0.14
695	0.16
696	0.21
697	0.23
698	0.31
699	0.32
700	0.33
701	0.32
702	0.32
703	0.29
704	0.25
705	0.23
706	0.14
707	0.13
708	0.12
709	0.12
710	0.11
711	0.1
712	0.11
713	0.11
714	0.11
715	0.14
716	0.16
717	0.17
718	0.19
719	0.2
720	0.19
721	0.2
722	0.22
723	0.2
724	0.17
725	0.16
726	0.18
727	0.21
728	0.27
729	0.25
730	0.25
731	0.27
732	0.29
733	0.28
734	0.24
735	0.25
736	0.18
737	0.19
738	0.17
739	0.15
740	0.13
741	0.13
742	0.13
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.12
748	0.12
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.12
754	0.12
755	0.11
756	0.14
757	0.14
758	0.13
759	0.14
760	0.17
761	0.17
762	0.2
763	0.19
764	0.18
765	0.18
766	0.19
767	0.19
768	0.14
769	0.12
770	0.09
771	0.08
772	0.08
773	0.09
774	0.13
775	0.15
776	0.15
777	0.17
778	0.18
779	0.22
780	0.21
781	0.22
782	0.25
783	0.23
784	0.23
785	0.21
786	0.2
787	0.15
788	0.15
789	0.14
790	0.07
791	0.07
792	0.08
793	0.09
794	0.1
795	0.11
796	0.12
797	0.15
798	0.14
799	0.16
800	0.2
801	0.2
802	0.21
803	0.23
804	0.25
805	0.27
806	0.32
807	0.34
808	0.32
809	0.32
810	0.33
811	0.31
812	0.28
813	0.27
814	0.24
815	0.19
816	0.16
817	0.15
818	0.13
819	0.13
820	0.13
821	0.1
822	0.08
823	0.1
824	0.11
825	0.13
826	0.15
827	0.15
828	0.16
829	0.18
830	0.19
831	0.19
832	0.24
833	0.25
834	0.26
835	0.3
836	0.31
837	0.3
838	0.29
839	0.3
840	0.23
841	0.26
842	0.23
843	0.19
844	0.15
845	0.15
846	0.14
847	0.12
848	0.12
849	0.08
850	0.07
851	0.06
852	0.06
853	0.05
854	0.06
855	0.06
856	0.05
857	0.05
858	0.05
859	0.05
860	0.05
861	0.05
862	0.07
863	0.09
864	0.1
865	0.1
866	0.12
867	0.17
868	0.17
869	0.18
870	0.16
871	0.17
872	0.18
873	0.19
874	0.17
875	0.14
876	0.13
877	0.17
878	0.16
879	0.17
880	0.18
881	0.18
882	0.17
883	0.18
884	0.2
885	0.17
886	0.18
887	0.18
888	0.21
889	0.22
890	0.23
891	0.22
892	0.2
893	0.19
894	0.17
895	0.15
896	0.13
897	0.11
898	0.12
899	0.16
900	0.23
901	0.27
902	0.31
903	0.36
904	0.35
905	0.35
906	0.44
907	0.44
908	0.42
909	0.42
910	0.43
911	0.46
912	0.46
913	0.45
914	0.36
915	0.31
916	0.25
917	0.21
918	0.17
919	0.09
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.05
924	0.06
925	0.07
926	0.08
927	0.12
928	0.12
929	0.14
930	0.18
931	0.25
932	0.32
933	0.36
934	0.39
935	0.42
936	0.42
937	0.43
938	0.4
939	0.33
940	0.26
941	0.21
942	0.17
943	0.12
944	0.12
945	0.1
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.08
950	0.08
951	0.07
952	0.09
953	0.09
954	0.11
955	0.1
956	0.1
957	0.15
958	0.15
959	0.14
960	0.12
961	0.12
962	0.11
963	0.11
964	0.17
965	0.12
966	0.13
967	0.13
968	0.13
969	0.13
970	0.13
971	0.15
972	0.12
973	0.13
974	0.11
975	0.13
976	0.19
977	0.23
978	0.24
979	0.23
980	0.24
981	0.29
982	0.36
983	0.43
984	0.44
985	0.44
986	0.47
987	0.48
988	0.5
989	0.45
990	0.38
991	0.32
992	0.29
993	0.28
994	0.26
995	0.27
996	0.24
997	0.23
998	0.25
999	0.24
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.27
1003	0.24
1004	0.22
1005	0.21
1006	0.21
1007	0.23
1008	0.24
1009	0.23
1010	0.16
1011	0.16
1012	0.2
1013	0.25
1014	0.23
1015	0.25
1016	0.28
1017	0.34
1018	0.39
1019	0.44
1020	0.44
1021	0.49
1022	0.55
1023	0.57
1024	0.57
1025	0.5
1026	0.48
1027	0.51
1028	0.47
1029	0.38
1030	0.32
1031	0.26
1032	0.3
1033	0.28
1034	0.25
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.09
1041	0.13
1042	0.19
1043	0.25
1044	0.27
1045	0.3
1046	0.35
1047	0.35
1048	0.39
1049	0.42
1050	0.44
1051	0.4
1052	0.42
1053	0.42
1054	0.38
1055	0.39
1056	0.35
1057	0.29
1058	0.21
1059	0.22
1060	0.19
1061	0.18
1062	0.16
1063	0.15
1064	0.15
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.13
1070	0.14
1071	0.14
1072	0.15
1073	0.17
1074	0.18
1075	0.21
1076	0.21
1077	0.2
1078	0.19
1079	0.19
1080	0.24
1081	0.21
1082	0.19
1083	0.17
1084	0.15
1085	0.15
1086	0.17
1087	0.17
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.13
1091	0.16
1092	0.16
1093	0.16
1094	0.15
1095	0.15
1096	0.16
1097	0.16
1098	0.16
1099	0.13
1100	0.13
1101	0.12
1102	0.12
1103	0.15
1104	0.19
1105	0.27
1106	0.28
1107	0.31
1108	0.33
1109	0.34
1110	0.38
1111	0.46
1112	0.44
1113	0.38
1114	0.37
1115	0.38
1116	0.39
1117	0.41
1118	0.4
1119	0.36
1120	0.39
1121	0.46
1122	0.46
1123	0.49
1124	0.5
1125	0.52
1126	0.52
1127	0.5
1128	0.46
1129	0.42
1130	0.43
1131	0.39
1132	0.34
1133	0.29
1134	0.26
1135	0.23
1136	0.19
1137	0.15
1138	0.16
1139	0.16
1140	0.17
1141	0.22
1142	0.31
1143	0.35
1144	0.43
1145	0.51
1146	0.57
1147	0.65
1148	0.68
1149	0.66
1150	0.68
1151	0.66
1152	0.61
1153	0.61
1154	0.53
1155	0.42
1156	0.37
1157	0.35
1158	0.27
1159	0.24
1160	0.2
1161	0.12
1162	0.1
1163	0.11
1164	0.16
1165	0.18
1166	0.17
1167	0.18
1168	0.21
1169	0.25
1170	0.27
1171	0.27
1172	0.28
1173	0.31
1174	0.39
1175	0.41
1176	0.39
1177	0.36
1178	0.34
1179	0.33
1180	0.3
1181	0.24
1182	0.15
1183	0.14
1184	0.15
1185	0.15
1186	0.15
1187	0.15
1188	0.13
1189	0.15
1190	0.15
1191	0.12
1192	0.11
1193	0.12
1194	0.11
1195	0.13
1196	0.13
1197	0.12
1198	0.13
1199	0.12
1200	0.11
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.12
1204	0.11
1205	0.1
1206	0.1
1207	0.11
1208	0.11
1209	0.13
1210	0.14
1211	0.12
1212	0.13
1213	0.13
1214	0.21
1215	0.27
1216	0.29
1217	0.3
1218	0.31
1219	0.31
1220	0.32
1221	0.34
1222	0.34
1223	0.3
1224	0.3
1225	0.31
1226	0.33
1227	0.32
1228	0.31
1229	0.29
1230	0.24
1231	0.23
1232	0.21
1233	0.18
1234	0.15
1235	0.14
1236	0.14

A0A1E4SMT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer