Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SJ56

Protein Details
Accession A0A1E4SJ56    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-327PSFSQTGKSKKSKNKLRKKKGAMTDTSSHydrophilic
411-435DAASKSKVAARRKKERETSDPLGRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
307-320KSKKSKNKLRKKKG
414-425SKSKVAARRKKE
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKFNKKNAQTFSVVHRAHDDALYYDNDASTHVLVPAPSKSKQGQAPPLTKKIYSTQELAQKLAPEEVKAIRENEGLAAQYGIYFDDSKYDYMQHLRPIGESEDGVFIEANKKEEKKKVGNIEDLFRDQLPSKEKRKIKLDELENIPSQLKGFNPDMDPRLREVLEALEDEAYIDNDAAEEGDDVFADLLQSGEIDEEDEDYYGSEYDNDYDEWDMDNYEDEYNEKYNSDNYEEQYEEAELPYNEGEAPAELDTTDVKLINTNWQDDFMKFKHATKNKTNEWDSDNEEEEEDDVVAELPSFSQTGKSKKSKNKLRKKKGAMTDTSSFSMTSSALFRSEGLTLLDDRYEQLAKKFEEDEEPEEYQHFDMGSERHDLESMLDDFLDNYELEGGGRKLVKKNEDRAKLQEAADAASKSKVAARRKKERETSDPLGRLGSSFGKMNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.57
3 0.47
4 0.43
5 0.39
6 0.36
7 0.34
8 0.27
9 0.18
10 0.21
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.15
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.27
28 0.29
29 0.35
30 0.41
31 0.47
32 0.51
33 0.55
34 0.64
35 0.66
36 0.71
37 0.68
38 0.62
39 0.56
40 0.53
41 0.52
42 0.46
43 0.42
44 0.4
45 0.45
46 0.46
47 0.45
48 0.39
49 0.34
50 0.31
51 0.33
52 0.27
53 0.2
54 0.22
55 0.24
56 0.25
57 0.25
58 0.25
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.2
63 0.18
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.16
79 0.17
80 0.21
81 0.25
82 0.25
83 0.27
84 0.27
85 0.26
86 0.27
87 0.27
88 0.23
89 0.2
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.22
101 0.28
102 0.35
103 0.43
104 0.45
105 0.52
106 0.59
107 0.61
108 0.65
109 0.62
110 0.6
111 0.55
112 0.48
113 0.42
114 0.32
115 0.28
116 0.21
117 0.23
118 0.25
119 0.29
120 0.34
121 0.41
122 0.46
123 0.52
124 0.59
125 0.61
126 0.62
127 0.64
128 0.63
129 0.62
130 0.62
131 0.58
132 0.5
133 0.45
134 0.37
135 0.28
136 0.24
137 0.17
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.17
143 0.2
144 0.23
145 0.25
146 0.25
147 0.23
148 0.24
149 0.22
150 0.19
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.16
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.17
252 0.19
253 0.2
254 0.19
255 0.24
256 0.17
257 0.23
258 0.22
259 0.26
260 0.33
261 0.38
262 0.45
263 0.48
264 0.56
265 0.55
266 0.63
267 0.61
268 0.55
269 0.52
270 0.49
271 0.44
272 0.38
273 0.34
274 0.26
275 0.24
276 0.21
277 0.18
278 0.15
279 0.1
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.1
291 0.14
292 0.21
293 0.29
294 0.37
295 0.46
296 0.55
297 0.65
298 0.71
299 0.78
300 0.83
301 0.86
302 0.9
303 0.91
304 0.92
305 0.9
306 0.89
307 0.87
308 0.81
309 0.76
310 0.7
311 0.62
312 0.54
313 0.45
314 0.35
315 0.27
316 0.22
317 0.15
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.13
337 0.16
338 0.22
339 0.22
340 0.25
341 0.26
342 0.25
343 0.29
344 0.32
345 0.32
346 0.31
347 0.31
348 0.28
349 0.27
350 0.27
351 0.21
352 0.18
353 0.14
354 0.09
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.16
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.14
364 0.18
365 0.17
366 0.14
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.11
378 0.1
379 0.13
380 0.16
381 0.2
382 0.26
383 0.32
384 0.42
385 0.47
386 0.57
387 0.63
388 0.68
389 0.7
390 0.7
391 0.7
392 0.65
393 0.58
394 0.5
395 0.41
396 0.35
397 0.34
398 0.29
399 0.23
400 0.19
401 0.19
402 0.16
403 0.21
404 0.26
405 0.32
406 0.42
407 0.5
408 0.6
409 0.7
410 0.8
411 0.84
412 0.86
413 0.84
414 0.84
415 0.82
416 0.81
417 0.75
418 0.66
419 0.58
420 0.49
421 0.4
422 0.34
423 0.29
424 0.22