Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SN10

Protein Details
Accession A0A1E4SN10    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
352-374LTGVIKKRKTPGKPAGPVKKAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-374KKRKTPGKPAGPVKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 8.833, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MAYTPGISKIIADGSRAYSAKDYDLASEKYAEACELFSEENSEEDADLLLLYGKALFQSAVSKSDVFGGSSEAKQEEKEEKEDQEKEEEDDGKFQFYDAPPLEGEEVDSDPQPELEGEEQEEEGEGEQHENGEEEQSDFEVAWEILDLTRTLFESQADSKKDLLQDIEEPYFKDSEETTNEYVTLVKKLSETYDLLGEVSLEAGNFAQAVEDFESCLNLRLKLYDPKKSTLISESHYKLSLALEFSVDDPELRNKAVEQMKLAIESVVLRNKTEDDESKIKENDELIQDLKLRLQDLEKDPAEEIQQEQLDIIKGLLGEPTSDGQSGSSSTAAAAINDLTSIVKKKVPVNDLTGVIKKRKTPGKPAGPVKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.27
3 0.27
4 0.27
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.26
9 0.23
10 0.21
11 0.27
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.23
17 0.23
18 0.19
19 0.14
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.11
46 0.12
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.17
51 0.21
52 0.21
53 0.17
54 0.15
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.2
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.2
63 0.23
64 0.24
65 0.28
66 0.3
67 0.33
68 0.39
69 0.42
70 0.4
71 0.38
72 0.36
73 0.34
74 0.35
75 0.33
76 0.27
77 0.28
78 0.27
79 0.23
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.24
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.21
89 0.22
90 0.16
91 0.17
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.13
143 0.19
144 0.2
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.18
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.13
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.23
210 0.27
211 0.32
212 0.34
213 0.36
214 0.38
215 0.37
216 0.36
217 0.32
218 0.3
219 0.25
220 0.29
221 0.28
222 0.27
223 0.27
224 0.25
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.19
243 0.24
244 0.23
245 0.22
246 0.24
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.16
251 0.12
252 0.12
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.15
257 0.16
258 0.17
259 0.19
260 0.22
261 0.21
262 0.23
263 0.3
264 0.32
265 0.37
266 0.37
267 0.35
268 0.33
269 0.31
270 0.29
271 0.25
272 0.24
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.2
277 0.21
278 0.18
279 0.16
280 0.15
281 0.16
282 0.22
283 0.24
284 0.32
285 0.3
286 0.31
287 0.3
288 0.3
289 0.3
290 0.23
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.07
327 0.09
328 0.13
329 0.14
330 0.17
331 0.21
332 0.27
333 0.35
334 0.4
335 0.42
336 0.45
337 0.47
338 0.48
339 0.49
340 0.5
341 0.47
342 0.48
343 0.47
344 0.46
345 0.5
346 0.56
347 0.59
348 0.62
349 0.68
350 0.73
351 0.79
352 0.84
353 0.86
354 0.85