Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E4SFS4

Protein Details
Accession A0A1E4SFS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-30NANRGNPQKNGHRRSNSRYNNQNGHLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MKGQNANRGNPQKNGHRRSNSRYNNQNGHLATDDGTDRLLYLVTKSIGKKVTVTITNGARYQGLLLSADLSSQGTSPLSVVIMHPTQVSKGLISEKSNIDENEVPEKLIIQSKDLIDLEVAEVDLNDSSRQTPQPEVVPPPQPSQQAQPASKNQPEFKTDSDISGRFQLKERELQRWVPEDDNNPVLSLDDDAFGSNNGQWDQFKVNEEKFGVEASYDEHLYTTRINTTASDYQERLAKAERLAKEIEGQTTSDRHILEERGIQVDDSGMDEEDKYSGVDRRGDELMAALRNASISSDASSSLRASSPGKYVPPRQRAAQYHNDPAIISSSAASKSKATAASPAPATETDATSSVQEKEAGTSKAQLAKPDSIPAKPQVPQHNESFRLNAQSEINSLREFSANFKIPHKMPQDLLPILSKDKLKQDEILKKQQETQRQKLAKEQAALQPPVQANSQQTPAQKKKADTAKAAFKLNPKAVAFTPSNKHVPLSPNPPKANFHRSPNNPSPRISNSRPYSGSGSSAGSNSSSRRHHQISPAEFFGGADRIPTKESQEKKAADFKFAFSLFITTKKNHQAKGAKTPVAYERTFKTPPTWDSNFDDTHDKLFPSVESLSKGPGMIIPSSQFIPSPLMGNPNVPAGYPAPNGSKFPMSPHQQQAVAAAIHFQQQQQFHAAMLYQQQFPGGVPPGQPPMPMYPGGEPPFMPPGGFMPPPGGFVPGGSPVNANLMMGQGSPYSGGNHHNYNNHHNGNGRRYNQNSSKRGGHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.76
4 0.8
5 0.82
6 0.85
7 0.85
8 0.84
9 0.85
10 0.84
11 0.83
12 0.77
13 0.76
14 0.65
15 0.59
16 0.51
17 0.42
18 0.33
19 0.27
20 0.25
21 0.17
22 0.17
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.09
29 0.13
30 0.14
31 0.2
32 0.21
33 0.27
34 0.3
35 0.31
36 0.31
37 0.32
38 0.38
39 0.37
40 0.39
41 0.39
42 0.4
43 0.43
44 0.42
45 0.38
46 0.31
47 0.26
48 0.24
49 0.19
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.18
75 0.18
76 0.13
77 0.15
78 0.2
79 0.23
80 0.25
81 0.29
82 0.28
83 0.3
84 0.34
85 0.31
86 0.31
87 0.31
88 0.32
89 0.34
90 0.31
91 0.29
92 0.24
93 0.25
94 0.23
95 0.25
96 0.22
97 0.17
98 0.21
99 0.21
100 0.26
101 0.25
102 0.23
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.12
107 0.11
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.19
120 0.22
121 0.26
122 0.3
123 0.35
124 0.36
125 0.41
126 0.41
127 0.43
128 0.45
129 0.43
130 0.41
131 0.41
132 0.44
133 0.45
134 0.46
135 0.48
136 0.52
137 0.56
138 0.59
139 0.58
140 0.55
141 0.51
142 0.52
143 0.49
144 0.43
145 0.44
146 0.39
147 0.37
148 0.37
149 0.33
150 0.31
151 0.35
152 0.34
153 0.28
154 0.32
155 0.34
156 0.33
157 0.4
158 0.41
159 0.41
160 0.43
161 0.46
162 0.47
163 0.46
164 0.45
165 0.4
166 0.41
167 0.37
168 0.37
169 0.35
170 0.3
171 0.25
172 0.22
173 0.19
174 0.15
175 0.13
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.16
190 0.17
191 0.2
192 0.23
193 0.24
194 0.26
195 0.27
196 0.25
197 0.22
198 0.21
199 0.17
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.18
216 0.21
217 0.24
218 0.26
219 0.24
220 0.25
221 0.29
222 0.28
223 0.24
224 0.22
225 0.21
226 0.21
227 0.28
228 0.28
229 0.27
230 0.28
231 0.26
232 0.28
233 0.27
234 0.25
235 0.19
236 0.19
237 0.17
238 0.18
239 0.19
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.07
264 0.1
265 0.12
266 0.16
267 0.16
268 0.19
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.16
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.19
297 0.22
298 0.31
299 0.38
300 0.44
301 0.45
302 0.45
303 0.51
304 0.52
305 0.55
306 0.56
307 0.51
308 0.49
309 0.48
310 0.45
311 0.37
312 0.32
313 0.27
314 0.17
315 0.13
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.18
330 0.17
331 0.15
332 0.14
333 0.16
334 0.12
335 0.11
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.13
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.21
352 0.22
353 0.22
354 0.22
355 0.23
356 0.24
357 0.27
358 0.26
359 0.2
360 0.22
361 0.22
362 0.22
363 0.22
364 0.27
365 0.31
366 0.35
367 0.37
368 0.4
369 0.42
370 0.42
371 0.4
372 0.37
373 0.29
374 0.27
375 0.24
376 0.21
377 0.17
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.16
389 0.19
390 0.2
391 0.22
392 0.25
393 0.25
394 0.32
395 0.32
396 0.28
397 0.25
398 0.29
399 0.32
400 0.29
401 0.29
402 0.23
403 0.21
404 0.2
405 0.22
406 0.17
407 0.14
408 0.2
409 0.22
410 0.22
411 0.26
412 0.33
413 0.4
414 0.45
415 0.52
416 0.49
417 0.47
418 0.52
419 0.51
420 0.53
421 0.52
422 0.53
423 0.53
424 0.54
425 0.54
426 0.55
427 0.59
428 0.52
429 0.45
430 0.42
431 0.38
432 0.4
433 0.4
434 0.33
435 0.31
436 0.27
437 0.27
438 0.24
439 0.2
440 0.17
441 0.17
442 0.2
443 0.18
444 0.22
445 0.3
446 0.34
447 0.4
448 0.41
449 0.4
450 0.45
451 0.5
452 0.52
453 0.48
454 0.48
455 0.5
456 0.49
457 0.5
458 0.45
459 0.42
460 0.43
461 0.4
462 0.39
463 0.31
464 0.3
465 0.28
466 0.31
467 0.27
468 0.26
469 0.27
470 0.27
471 0.29
472 0.26
473 0.26
474 0.25
475 0.29
476 0.3
477 0.37
478 0.42
479 0.48
480 0.49
481 0.52
482 0.52
483 0.53
484 0.57
485 0.51
486 0.49
487 0.5
488 0.54
489 0.61
490 0.66
491 0.7
492 0.63
493 0.6
494 0.57
495 0.55
496 0.57
497 0.52
498 0.52
499 0.46
500 0.49
501 0.49
502 0.46
503 0.43
504 0.36
505 0.34
506 0.26
507 0.24
508 0.19
509 0.18
510 0.15
511 0.12
512 0.13
513 0.13
514 0.17
515 0.2
516 0.22
517 0.29
518 0.32
519 0.35
520 0.42
521 0.49
522 0.49
523 0.5
524 0.48
525 0.42
526 0.37
527 0.33
528 0.27
529 0.19
530 0.12
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.11
535 0.12
536 0.16
537 0.23
538 0.27
539 0.32
540 0.39
541 0.4
542 0.43
543 0.51
544 0.47
545 0.45
546 0.42
547 0.38
548 0.35
549 0.33
550 0.3
551 0.21
552 0.24
553 0.19
554 0.23
555 0.25
556 0.21
557 0.27
558 0.36
559 0.41
560 0.39
561 0.47
562 0.5
563 0.52
564 0.62
565 0.63
566 0.56
567 0.51
568 0.52
569 0.5
570 0.47
571 0.42
572 0.35
573 0.3
574 0.34
575 0.35
576 0.33
577 0.32
578 0.33
579 0.37
580 0.42
581 0.42
582 0.4
583 0.44
584 0.48
585 0.44
586 0.4
587 0.4
588 0.32
589 0.32
590 0.29
591 0.23
592 0.19
593 0.19
594 0.16
595 0.15
596 0.16
597 0.15
598 0.16
599 0.17
600 0.18
601 0.18
602 0.18
603 0.14
604 0.14
605 0.15
606 0.13
607 0.14
608 0.13
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.13
613 0.12
614 0.15
615 0.14
616 0.15
617 0.14
618 0.18
619 0.18
620 0.19
621 0.19
622 0.19
623 0.18
624 0.16
625 0.17
626 0.14
627 0.18
628 0.18
629 0.2
630 0.22
631 0.23
632 0.25
633 0.26
634 0.28
635 0.24
636 0.29
637 0.35
638 0.37
639 0.43
640 0.49
641 0.5
642 0.47
643 0.47
644 0.43
645 0.38
646 0.31
647 0.23
648 0.18
649 0.14
650 0.17
651 0.18
652 0.17
653 0.18
654 0.19
655 0.22
656 0.24
657 0.23
658 0.2
659 0.19
660 0.18
661 0.16
662 0.22
663 0.23
664 0.2
665 0.2
666 0.2
667 0.19
668 0.19
669 0.22
670 0.18
671 0.17
672 0.17
673 0.2
674 0.25
675 0.25
676 0.26
677 0.24
678 0.25
679 0.26
680 0.26
681 0.25
682 0.23
683 0.31
684 0.33
685 0.32
686 0.27
687 0.27
688 0.31
689 0.28
690 0.25
691 0.18
692 0.18
693 0.22
694 0.22
695 0.19
696 0.19
697 0.19
698 0.22
699 0.22
700 0.21
701 0.16
702 0.16
703 0.18
704 0.19
705 0.19
706 0.17
707 0.17
708 0.15
709 0.19
710 0.19
711 0.16
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.11
717 0.08
718 0.08
719 0.09
720 0.1
721 0.11
722 0.12
723 0.18
724 0.21
725 0.27
726 0.32
727 0.37
728 0.42
729 0.49
730 0.56
731 0.53
732 0.51
733 0.52
734 0.55
735 0.59
736 0.63
737 0.59
738 0.59
739 0.61
740 0.68
741 0.71
742 0.74
743 0.69
744 0.66