Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SRK4

Protein Details
Accession A0A1E4SRK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-265DSSSNKRKASPPPAIKKQKVHydrophilic
335-359LLQVRGKDFTKNKNKMKKGAYRGGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSASRESVLAYIEEYLSRDKAFGKTLKAFQKEVAADSVKLSSVTNKLEDLIGDLDDEMKSESGSDDSSDSESSDSDSSDSSDSSDSEDEDEEMAEAEDKKEEYDSESSSSSSDSDSDSDSSSSSSDSESESESSSSSSDSDSDSDSSDSDSDSEAEAEEKEEEEEEQKEEKDTSSSSDSDSDSSSSSDSDSDSDSSSSSSDSDSDSDSSSSSDSDSSDSDSDSSDSSDSSDSDSDSDSSSSDSESDSSSNKRKASPPPAIKKQKVELASSQTESISSRSASPGIAATPEPELQPGQRRHFSRIDRSKISFENQALQDNTYKGAAGTWGEMASEKLLQVRGKDFTKNKNKMKKGAYRGGSITLASGSYKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.16
6 0.17
7 0.19
8 0.26
9 0.28
10 0.33
11 0.38
12 0.46
13 0.54
14 0.56
15 0.54
16 0.49
17 0.53
18 0.47
19 0.42
20 0.4
21 0.33
22 0.29
23 0.29
24 0.28
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.18
30 0.21
31 0.21
32 0.2
33 0.21
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.15
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.15
235 0.22
236 0.26
237 0.28
238 0.31
239 0.36
240 0.44
241 0.51
242 0.56
243 0.6
244 0.65
245 0.74
246 0.8
247 0.79
248 0.75
249 0.71
250 0.66
251 0.59
252 0.53
253 0.47
254 0.44
255 0.43
256 0.39
257 0.35
258 0.28
259 0.26
260 0.23
261 0.19
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.1
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.24
281 0.3
282 0.35
283 0.41
284 0.44
285 0.49
286 0.56
287 0.6
288 0.62
289 0.65
290 0.66
291 0.65
292 0.66
293 0.66
294 0.61
295 0.58
296 0.53
297 0.45
298 0.45
299 0.4
300 0.42
301 0.38
302 0.36
303 0.35
304 0.29
305 0.29
306 0.21
307 0.19
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.16
323 0.17
324 0.2
325 0.24
326 0.28
327 0.3
328 0.39
329 0.43
330 0.5
331 0.59
332 0.67
333 0.73
334 0.77
335 0.82
336 0.82
337 0.86
338 0.85
339 0.84
340 0.83
341 0.78
342 0.73
343 0.67
344 0.62
345 0.54
346 0.43
347 0.34
348 0.25
349 0.21
350 0.17
351 0.15