FuNGI

A0A1E4SFJ2

Protein Details

Accession

A0A1E4SFJ2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-91	STSQDRSQAKKLKRARKKNKDDYLGPW	Hydrophilic
437-456	FWDWKTCKLVKKLKVSTRVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
73-83	AKKLKRARKKN

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.5, nucl 13, cyto 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MLIVQGYESSDGDESDKDRHESLAVGVITEQSASPIRSTTNKLKRTFAGSIEQVHYDAALFKSTSTSQDRSQAKKLKRARKKNKDDYLGPWAAWDQSEPEPEHEQESNEAHGLESDKENDRDAENEENVDEDDLDDSSVETTQFFGTKKGDYLGRSYLHVPTDVNINLKQDPGSHQCFVPKKLEHTFAGHSKGINKLELFPRSGHLMLSAGNDPVIRLWDMYHDRELLREYYGHKQAVKDVVFNKIGDKFLSCGYDKLIHLWNTESGKIEKTIRVKAIPNVIKFNPNNEAEFIVGLSNHNIEHYDMSTLSYEVPIQTYDHHLGAINSLTIIDDEKRFISTADDKTVRFWDWQINIPIKFISDPSQHSMPTSALYPGGAFVALQSMDNTIQTIQGRGKFRTNNKTFRGHNVAGYGIDIDFSPDGKLIVSGDSKGNSYFWDWKTCKLVKKLKVSTRVISSIKFHPQEPSGVVMGGMSGEIYYYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.19
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.24
7	0.23
8	0.22
9	0.22
10	0.24
11	0.2
12	0.18
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.15
17	0.13
18	0.08
19	0.12
20	0.12
21	0.13
22	0.13
23	0.16
24	0.21
25	0.28
26	0.37
27	0.44
28	0.52
29	0.54
30	0.58
31	0.59
32	0.62
33	0.59
34	0.52
35	0.49
36	0.44
37	0.46
38	0.43
39	0.4
40	0.33
41	0.29
42	0.25
43	0.17
44	0.17
45	0.12
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.14
50	0.15
51	0.21
52	0.24
53	0.27
54	0.28
55	0.37
56	0.44
57	0.46
58	0.55
59	0.58
60	0.59
61	0.65
62	0.72
63	0.74
64	0.78
65	0.83
66	0.85
67	0.88
68	0.92
69	0.94
70	0.94
71	0.91
72	0.85
73	0.8
74	0.78
75	0.68
76	0.57
77	0.46
78	0.37
79	0.3
80	0.25
81	0.19
82	0.13
83	0.14
84	0.19
85	0.2
86	0.23
87	0.26
88	0.27
89	0.3
90	0.27
91	0.25
92	0.24
93	0.24
94	0.22
95	0.18
96	0.18
97	0.14
98	0.14
99	0.15
100	0.13
101	0.13
102	0.15
103	0.19
104	0.19
105	0.21
106	0.21
107	0.2
108	0.19
109	0.21
110	0.22
111	0.19
112	0.19
113	0.17
114	0.17
115	0.16
116	0.15
117	0.11
118	0.07
119	0.07
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.06
126	0.06
127	0.05
128	0.06
129	0.07
130	0.09
131	0.1
132	0.12
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.19
138	0.18
139	0.21
140	0.24
141	0.23
142	0.24
143	0.25
144	0.25
145	0.23
146	0.22
147	0.19
148	0.14
149	0.18
150	0.17
151	0.18
152	0.16
153	0.18
154	0.17
155	0.18
156	0.18
157	0.14
158	0.18
159	0.21
160	0.25
161	0.23
162	0.23
163	0.29
164	0.33
165	0.34
166	0.37
167	0.32
168	0.33
169	0.36
170	0.4
171	0.35
172	0.35
173	0.36
174	0.33
175	0.36
176	0.31
177	0.28
178	0.25
179	0.29
180	0.27
181	0.24
182	0.21
183	0.21
184	0.25
185	0.26
186	0.26
187	0.21
188	0.21
189	0.22
190	0.22
191	0.18
192	0.13
193	0.11
194	0.1
195	0.12
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.11
207	0.14
208	0.16
209	0.17
210	0.17
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.15
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.19
219	0.23
220	0.23
221	0.23
222	0.22
223	0.24
224	0.29
225	0.27
226	0.24
227	0.21
228	0.24
229	0.24
230	0.23
231	0.22
232	0.18
233	0.18
234	0.15
235	0.15
236	0.11
237	0.11
238	0.14
239	0.13
240	0.11
241	0.12
242	0.16
243	0.15
244	0.17
245	0.21
246	0.19
247	0.19
248	0.2
249	0.22
250	0.19
251	0.2
252	0.19
253	0.15
254	0.15
255	0.17
256	0.18
257	0.18
258	0.2
259	0.24
260	0.24
261	0.26
262	0.27
263	0.28
264	0.36
265	0.37
266	0.35
267	0.36
268	0.35
269	0.39
270	0.37
271	0.37
272	0.33
273	0.3
274	0.29
275	0.25
276	0.24
277	0.17
278	0.17
279	0.14
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.12
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.14
311	0.13
312	0.08
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.14
326	0.19
327	0.22
328	0.27
329	0.29
330	0.29
331	0.31
332	0.34
333	0.3
334	0.25
335	0.24
336	0.24
337	0.24
338	0.3
339	0.33
340	0.36
341	0.34
342	0.34
343	0.32
344	0.26
345	0.24
346	0.2
347	0.2
348	0.18
349	0.21
350	0.26
351	0.28
352	0.27
353	0.27
354	0.28
355	0.22
356	0.2
357	0.17
358	0.13
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.05
366	0.04
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.08
376	0.11
377	0.12
378	0.14
379	0.17
380	0.23
381	0.27
382	0.3
383	0.37
384	0.41
385	0.5
386	0.58
387	0.62
388	0.65
389	0.66
390	0.72
391	0.67
392	0.68
393	0.68
394	0.59
395	0.53
396	0.46
397	0.41
398	0.33
399	0.3
400	0.23
401	0.13
402	0.12
403	0.09
404	0.09
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.08
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.16
417	0.17
418	0.18
419	0.18
420	0.18
421	0.16
422	0.19
423	0.26
424	0.26
425	0.36
426	0.36
427	0.4
428	0.49
429	0.54
430	0.57
431	0.59
432	0.66
433	0.64
434	0.74
435	0.78
436	0.78
437	0.82
438	0.8
439	0.76
440	0.73
441	0.72
442	0.64
443	0.57
444	0.53
445	0.5
446	0.53
447	0.49
448	0.44
449	0.42
450	0.41
451	0.42
452	0.4
453	0.36
454	0.28
455	0.26
456	0.24
457	0.18
458	0.16
459	0.12
460	0.09
461	0.05
462	0.04

A0A1E4SFJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer