Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SQJ8

Protein Details
Accession A0A1E4SQJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-56TESPLASPSVKKNKKKPAKKTKEATPEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-49SVKKNKKKPAKKTK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 12.999, cyto_nucl 10.333, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MARTRSKPATSPKTPTSAKAKKVGSVATESPLASPSVKKNKKKPAKKTKEATPEAEAVPVKESTEVKEPVSSFISEKVATKAIDEITKYLQRESENTDKEKLFDDDDDNLKTLFLQLNTKKFSASRPQFKPKFIKLSHSIYPSETKACLIIRDQLVKTTEQLEALESENLPYVSQILPVNELKTTYKSFEKRRQLHDEYDLFIVDDAVFNLMPSLLGKTFYGVGHRKIPLPIRVTSTKSHNELSITTLKNQLEKCLNSTIYLPPTGVNISIKVGAITDKFETSQLVQNLQDALSAFEKDSLKSVMVRTVKSPSLPLYYAEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.64
4 0.63
5 0.61
6 0.62
7 0.59
8 0.55
9 0.57
10 0.54
11 0.46
12 0.44
13 0.4
14 0.34
15 0.33
16 0.29
17 0.25
18 0.23
19 0.21
20 0.16
21 0.18
22 0.25
23 0.34
24 0.44
25 0.52
26 0.61
27 0.71
28 0.8
29 0.87
30 0.89
31 0.89
32 0.91
33 0.92
34 0.91
35 0.9
36 0.9
37 0.85
38 0.78
39 0.71
40 0.64
41 0.54
42 0.5
43 0.4
44 0.29
45 0.26
46 0.22
47 0.17
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.23
52 0.24
53 0.22
54 0.26
55 0.26
56 0.26
57 0.28
58 0.25
59 0.19
60 0.2
61 0.22
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.2
74 0.24
75 0.24
76 0.22
77 0.23
78 0.22
79 0.24
80 0.29
81 0.33
82 0.34
83 0.36
84 0.4
85 0.37
86 0.37
87 0.37
88 0.31
89 0.24
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.22
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.17
103 0.21
104 0.27
105 0.3
106 0.3
107 0.29
108 0.28
109 0.31
110 0.34
111 0.39
112 0.43
113 0.48
114 0.58
115 0.61
116 0.66
117 0.7
118 0.65
119 0.66
120 0.57
121 0.56
122 0.51
123 0.53
124 0.51
125 0.46
126 0.41
127 0.33
128 0.35
129 0.29
130 0.25
131 0.2
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.15
138 0.15
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.2
144 0.2
145 0.17
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.21
174 0.27
175 0.35
176 0.43
177 0.53
178 0.56
179 0.63
180 0.69
181 0.67
182 0.64
183 0.63
184 0.55
185 0.47
186 0.41
187 0.33
188 0.24
189 0.19
190 0.16
191 0.08
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.17
209 0.18
210 0.21
211 0.25
212 0.27
213 0.28
214 0.3
215 0.35
216 0.35
217 0.35
218 0.35
219 0.35
220 0.38
221 0.39
222 0.39
223 0.41
224 0.4
225 0.39
226 0.38
227 0.34
228 0.31
229 0.28
230 0.3
231 0.31
232 0.27
233 0.26
234 0.3
235 0.29
236 0.33
237 0.33
238 0.34
239 0.33
240 0.32
241 0.34
242 0.34
243 0.34
244 0.3
245 0.32
246 0.31
247 0.27
248 0.26
249 0.23
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.14
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.23
271 0.23
272 0.24
273 0.23
274 0.24
275 0.25
276 0.22
277 0.21
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.13
283 0.18
284 0.19
285 0.18
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.21
290 0.23
291 0.25
292 0.29
293 0.3
294 0.3
295 0.34
296 0.36
297 0.35
298 0.36
299 0.32
300 0.34
301 0.33
302 0.33