Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SQB3

Protein Details
Accession A0A1E4SQB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-314MSSSTPKKGHKKSSSKGKIKLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
296-312STPKKGHKKSSSKGKIK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences NLSISSHFNLFNLDDSKKQLQPSQSQSRPQIGSQSLQQVSQSLPATESVTNDLLINLISVDGSNINNYLLTILYKLNFQIPLDDFYNMLYNNDKLASLLQMNYQTKIDKTFLNTNNELSMETIHLLLNVFKTPELLGEYFPSMENKDLKLANINYHELLRTFLAIKILFDVLIQMPLNSNEEPQNYTIPRLSIYKTYYIICQKLIMKYPSSSNTTNEQQKLILGQSKLGKLIKLVYPNLLIKRLGSRGESKYNYLGVIWNENIIDNEIKELCDKYELIDLNDIFNDERKGRAMSSSTPKKGHKKSSSKGKIKLESIPISLNAPETRNIGPAPIATEFSDPISSPNLSFIKPFLKYPSDDHFTILNDEENWFNDVRIRIYSNFPQLSRSVIHKIFLTNDNLLTSSSLLSNLIEQLVIPLGSSIDQEATDLNLYLIIVIEILPYLLLIKSSSNMNFLKNLRLNLLHLINNLNNELKRLGFTKFGINNSTIFLILLKKLINLNDLLITFIKLIIKDDSKSMMSVDIENFLKVSNSIGSQPGGAAPEGSVKLEESQEEDFFLNLNSNLTSNSLNELNFSFKNDILSNDLIYTLIGYNFDPLVSDELKSSISMNFINQEINIIDEFFKKDLLSFLSESDHTRSSSSSSVSNVIESSDQEEKSPVGGDSLLSIKELNKLYSLIRLIDKRLLSTHFKSKYPILIYNNFINFILNDILKFIFLKQQQFQLQGHSLGGSNDGESDGNQNSFGNWWVFNSFIQEYLSLMGEIVGLEDSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.31
3 0.36
4 0.37
5 0.4
6 0.4
7 0.43
8 0.5
9 0.57
10 0.61
11 0.62
12 0.67
13 0.69
14 0.71
15 0.67
16 0.59
17 0.58
18 0.5
19 0.47
20 0.44
21 0.47
22 0.4
23 0.38
24 0.37
25 0.3
26 0.28
27 0.3
28 0.26
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.21
33 0.2
34 0.21
35 0.19
36 0.18
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.13
41 0.12
42 0.1
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.18
65 0.17
66 0.21
67 0.21
68 0.26
69 0.26
70 0.26
71 0.22
72 0.21
73 0.25
74 0.19
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.15
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.24
88 0.25
89 0.27
90 0.27
91 0.26
92 0.25
93 0.29
94 0.27
95 0.22
96 0.27
97 0.35
98 0.39
99 0.45
100 0.46
101 0.43
102 0.43
103 0.4
104 0.34
105 0.25
106 0.2
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.14
130 0.17
131 0.19
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.28
137 0.28
138 0.3
139 0.31
140 0.32
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.21
145 0.21
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.09
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.24
172 0.22
173 0.24
174 0.24
175 0.21
176 0.21
177 0.22
178 0.22
179 0.22
180 0.24
181 0.25
182 0.26
183 0.26
184 0.3
185 0.33
186 0.32
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.31
191 0.36
192 0.33
193 0.3
194 0.3
195 0.34
196 0.34
197 0.36
198 0.34
199 0.3
200 0.33
201 0.38
202 0.43
203 0.4
204 0.37
205 0.32
206 0.3
207 0.29
208 0.26
209 0.25
210 0.17
211 0.2
212 0.23
213 0.24
214 0.27
215 0.26
216 0.23
217 0.19
218 0.23
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.22
223 0.24
224 0.28
225 0.29
226 0.28
227 0.24
228 0.2
229 0.23
230 0.24
231 0.23
232 0.21
233 0.26
234 0.28
235 0.36
236 0.37
237 0.35
238 0.35
239 0.33
240 0.31
241 0.25
242 0.23
243 0.16
244 0.18
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.19
266 0.18
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.12
278 0.14
279 0.15
280 0.19
281 0.28
282 0.36
283 0.39
284 0.43
285 0.49
286 0.56
287 0.61
288 0.66
289 0.66
290 0.68
291 0.71
292 0.78
293 0.82
294 0.81
295 0.81
296 0.79
297 0.74
298 0.67
299 0.64
300 0.59
301 0.5
302 0.44
303 0.36
304 0.29
305 0.24
306 0.22
307 0.18
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.14
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.17
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.2
342 0.23
343 0.28
344 0.28
345 0.27
346 0.28
347 0.25
348 0.23
349 0.23
350 0.2
351 0.14
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.16
366 0.19
367 0.23
368 0.24
369 0.23
370 0.24
371 0.22
372 0.22
373 0.2
374 0.2
375 0.2
376 0.19
377 0.19
378 0.18
379 0.18
380 0.19
381 0.2
382 0.2
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.11
389 0.09
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.02
426 0.02
427 0.02
428 0.02
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.08
436 0.08
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.18
441 0.19
442 0.26
443 0.26
444 0.27
445 0.24
446 0.24
447 0.24
448 0.23
449 0.25
450 0.19
451 0.17
452 0.19
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.16
457 0.13
458 0.13
459 0.13
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.14
466 0.21
467 0.24
468 0.25
469 0.26
470 0.25
471 0.24
472 0.23
473 0.22
474 0.14
475 0.11
476 0.1
477 0.09
478 0.08
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.08
496 0.1
497 0.12
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.14
506 0.13
507 0.14
508 0.13
509 0.14
510 0.14
511 0.14
512 0.13
513 0.11
514 0.11
515 0.09
516 0.1
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.07
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.13
539 0.12
540 0.14
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.08
547 0.09
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.12
555 0.13
556 0.12
557 0.13
558 0.14
559 0.16
560 0.16
561 0.19
562 0.18
563 0.17
564 0.2
565 0.19
566 0.2
567 0.2
568 0.21
569 0.18
570 0.16
571 0.16
572 0.13
573 0.12
574 0.11
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.11
588 0.12
589 0.13
590 0.12
591 0.13
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.12
600 0.13
601 0.11
602 0.12
603 0.11
604 0.1
605 0.1
606 0.12
607 0.14
608 0.13
609 0.13
610 0.12
611 0.12
612 0.14
613 0.15
614 0.17
615 0.16
616 0.16
617 0.19
618 0.2
619 0.22
620 0.23
621 0.22
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.21
627 0.2
628 0.19
629 0.19
630 0.22
631 0.21
632 0.22
633 0.18
634 0.17
635 0.16
636 0.14
637 0.17
638 0.18
639 0.18
640 0.18
641 0.19
642 0.18
643 0.18
644 0.19
645 0.14
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.11
650 0.13
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.17
656 0.19
657 0.18
658 0.17
659 0.19
660 0.19
661 0.24
662 0.25
663 0.22
664 0.26
665 0.28
666 0.3
667 0.35
668 0.34
669 0.31
670 0.32
671 0.34
672 0.35
673 0.39
674 0.45
675 0.44
676 0.45
677 0.47
678 0.47
679 0.5
680 0.48
681 0.5
682 0.47
683 0.48
684 0.51
685 0.54
686 0.51
687 0.45
688 0.39
689 0.33
690 0.26
691 0.23
692 0.22
693 0.15
694 0.13
695 0.14
696 0.14
697 0.14
698 0.14
699 0.13
700 0.17
701 0.21
702 0.28
703 0.29
704 0.37
705 0.41
706 0.46
707 0.45
708 0.44
709 0.44
710 0.38
711 0.36
712 0.29
713 0.25
714 0.2
715 0.22
716 0.15
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.14
723 0.14
724 0.14
725 0.15
726 0.14
727 0.14
728 0.15
729 0.17
730 0.16
731 0.14
732 0.15
733 0.16
734 0.18
735 0.18
736 0.22
737 0.2
738 0.19
739 0.2
740 0.18
741 0.17
742 0.17
743 0.18
744 0.12
745 0.11
746 0.1
747 0.08
748 0.08
749 0.08