Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SHC3

Protein Details
Accession A0A1E4SHC3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53LQGLWEYKEQRKRKKNIDDHPGPVPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.333, cyto 14, nucl 12.5, mito_nucl 7.332, cyto_pero 7.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040770  Rtt106_PH  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18469  PH_18  
PF08512  Rtt106  
Amino Acid Sequences MSWISSLPPDLQSKVQALVATHPASLDVLQGLWEYKEQRKRKKNIDDHPGPVPDAAKTSTSAPSSAAGAGTPAKSAAGATIIKLSAPVEPSTVIFSLSQMSFQSPLRKRMDLTFHLVELEGQAVPVLSVVNKLVAELSIVNLDRAIRLCVLVPILGNSNTSKKNIVCLSVWIHGHKDPIVCQLNLDQIKKQMVQEGKLPESVLDQPDEASGLLISSIHERIIDYFQRQFRLCGINLINYLPCSTLFKNEVLLHTDTAISLRLNLQGQKQGGGQFVMVEAHKGLKDGSLLFLSENDFHGTYIIFGFKKPILVYEIANIVSTSYSSITRLTFSLLLTVVKNGVETSVEFGMIDQEYFQVIDDFIKAQSINDNSYDDSLKEKTNLKKEKEDKDENLAQVVAGGDADADEDEEDDDYEGGDDSDAGEDSDSDAESGESGDSADESDPDSADEGEQASEDEEEEGEEEDDGVFHKSKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.23
5 0.25
6 0.29
7 0.26
8 0.24
9 0.22
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.15
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.13
21 0.16
22 0.25
23 0.35
24 0.44
25 0.54
26 0.64
27 0.72
28 0.8
29 0.86
30 0.88
31 0.88
32 0.9
33 0.87
34 0.81
35 0.78
36 0.7
37 0.59
38 0.5
39 0.41
40 0.31
41 0.26
42 0.23
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.22
47 0.22
48 0.21
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.15
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.11
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.11
82 0.11
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.16
90 0.26
91 0.27
92 0.36
93 0.39
94 0.4
95 0.41
96 0.46
97 0.51
98 0.45
99 0.48
100 0.41
101 0.36
102 0.35
103 0.33
104 0.26
105 0.19
106 0.16
107 0.08
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.21
149 0.18
150 0.24
151 0.24
152 0.25
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.26
157 0.27
158 0.22
159 0.23
160 0.21
161 0.22
162 0.2
163 0.18
164 0.15
165 0.22
166 0.24
167 0.22
168 0.21
169 0.21
170 0.27
171 0.3
172 0.3
173 0.23
174 0.22
175 0.25
176 0.26
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.22
181 0.26
182 0.27
183 0.26
184 0.25
185 0.25
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.15
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.18
212 0.2
213 0.24
214 0.24
215 0.23
216 0.22
217 0.24
218 0.22
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.17
225 0.14
226 0.14
227 0.09
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.17
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.13
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.15
259 0.13
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.11
293 0.13
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.14
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.2
359 0.21
360 0.15
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.2
365 0.27
366 0.33
367 0.42
368 0.5
369 0.52
370 0.61
371 0.67
372 0.74
373 0.76
374 0.76
375 0.7
376 0.7
377 0.7
378 0.61
379 0.54
380 0.44
381 0.34
382 0.26
383 0.22
384 0.14
385 0.07
386 0.06
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.05
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.11
454 0.11