Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SEK9

Protein Details
Accession A0A1E4SEK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-91EEDAASKPQKPKRQEAKPKATSSGHydrophilic
130-152NQLSSQQVKKNKKKNLDNLKDIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-85KPKRQEAKP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSYLKVKKYAESAVANIIPLDPDSCKELVDYALTLPSNQAIQNHFLNMLGETEESLKFITKFLQLKQEEDAASKPQKPKRQEAKPKATSSGSNAWISTPSPPKEPVRKGRLDRNKSSHNTSELLDLKPSNQLSSQQVKKNKKKNLDNLKDIEAILTELELKSSNETNRRCNCMATRHPLFEMAPNCLNCGKIICVKEGLQPCSFCGHELLNHKERLEIMNVLRQEKDELENKQDNLQNKKIQEQKTTLSKPKSKKIVVSMNAGENLWKAQDRALKQAELEAKRAKELEDKKEAERKEVEEQEEELKKYELSKQVNPDLLKAQERLETLLNFQSTGAERTKIIDNAADYQLPSSGGSMWLSPVERALQLKKQQKILRKHEESIQARSGRGKVTVEMVIKNGKVTMVEKQHTGRIVEDKDEEINALEEELQQEKQLHEQDLSKNIWDYEKDQKKWERPVYMGKAPGNDSIEVKHGRVQFAFDPEENELL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.3
4 0.25
5 0.19
6 0.16
7 0.16
8 0.1
9 0.11
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.12
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.18
27 0.17
28 0.21
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.17
35 0.15
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.16
47 0.2
48 0.24
49 0.27
50 0.37
51 0.35
52 0.37
53 0.39
54 0.41
55 0.34
56 0.32
57 0.31
58 0.29
59 0.33
60 0.37
61 0.43
62 0.45
63 0.53
64 0.58
65 0.67
66 0.7
67 0.76
68 0.81
69 0.84
70 0.87
71 0.88
72 0.85
73 0.78
74 0.71
75 0.62
76 0.57
77 0.53
78 0.46
79 0.38
80 0.34
81 0.3
82 0.29
83 0.27
84 0.27
85 0.28
86 0.26
87 0.28
88 0.33
89 0.4
90 0.48
91 0.57
92 0.6
93 0.61
94 0.68
95 0.71
96 0.77
97 0.8
98 0.79
99 0.79
100 0.77
101 0.77
102 0.73
103 0.74
104 0.68
105 0.6
106 0.53
107 0.45
108 0.44
109 0.38
110 0.34
111 0.29
112 0.25
113 0.22
114 0.26
115 0.25
116 0.19
117 0.17
118 0.2
119 0.24
120 0.33
121 0.39
122 0.41
123 0.5
124 0.59
125 0.68
126 0.73
127 0.75
128 0.77
129 0.79
130 0.83
131 0.85
132 0.83
133 0.81
134 0.75
135 0.71
136 0.62
137 0.52
138 0.42
139 0.3
140 0.22
141 0.14
142 0.1
143 0.07
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.12
150 0.16
151 0.23
152 0.27
153 0.36
154 0.4
155 0.46
156 0.45
157 0.45
158 0.45
159 0.46
160 0.5
161 0.49
162 0.48
163 0.43
164 0.42
165 0.4
166 0.37
167 0.34
168 0.28
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.23
173 0.22
174 0.22
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.24
184 0.28
185 0.29
186 0.26
187 0.25
188 0.25
189 0.25
190 0.24
191 0.19
192 0.15
193 0.13
194 0.15
195 0.21
196 0.26
197 0.29
198 0.3
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.26
203 0.22
204 0.18
205 0.14
206 0.17
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.23
217 0.26
218 0.26
219 0.3
220 0.32
221 0.33
222 0.35
223 0.38
224 0.36
225 0.34
226 0.4
227 0.42
228 0.43
229 0.42
230 0.39
231 0.38
232 0.43
233 0.48
234 0.48
235 0.47
236 0.51
237 0.52
238 0.56
239 0.6
240 0.53
241 0.51
242 0.52
243 0.54
244 0.5
245 0.5
246 0.44
247 0.37
248 0.36
249 0.32
250 0.25
251 0.16
252 0.13
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.09
257 0.14
258 0.15
259 0.22
260 0.23
261 0.23
262 0.23
263 0.27
264 0.31
265 0.28
266 0.3
267 0.28
268 0.26
269 0.26
270 0.27
271 0.23
272 0.25
273 0.3
274 0.32
275 0.37
276 0.39
277 0.42
278 0.48
279 0.47
280 0.43
281 0.39
282 0.36
283 0.35
284 0.37
285 0.35
286 0.31
287 0.32
288 0.33
289 0.34
290 0.31
291 0.25
292 0.21
293 0.19
294 0.19
295 0.23
296 0.24
297 0.26
298 0.3
299 0.35
300 0.39
301 0.44
302 0.42
303 0.38
304 0.34
305 0.32
306 0.3
307 0.26
308 0.23
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.2
316 0.18
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.16
322 0.16
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.2
327 0.18
328 0.18
329 0.16
330 0.16
331 0.19
332 0.2
333 0.18
334 0.15
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.12
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.18
353 0.24
354 0.32
355 0.4
356 0.43
357 0.5
358 0.54
359 0.6
360 0.67
361 0.7
362 0.72
363 0.7
364 0.69
365 0.67
366 0.72
367 0.67
368 0.62
369 0.6
370 0.51
371 0.46
372 0.47
373 0.42
374 0.33
375 0.32
376 0.27
377 0.21
378 0.22
379 0.26
380 0.25
381 0.24
382 0.24
383 0.26
384 0.24
385 0.23
386 0.2
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.21
391 0.25
392 0.27
393 0.3
394 0.32
395 0.36
396 0.37
397 0.36
398 0.32
399 0.31
400 0.32
401 0.31
402 0.31
403 0.29
404 0.27
405 0.26
406 0.23
407 0.17
408 0.15
409 0.12
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.11
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.15
418 0.15
419 0.21
420 0.24
421 0.24
422 0.25
423 0.3
424 0.33
425 0.38
426 0.39
427 0.35
428 0.32
429 0.32
430 0.32
431 0.3
432 0.29
433 0.34
434 0.42
435 0.42
436 0.5
437 0.58
438 0.63
439 0.71
440 0.75
441 0.7
442 0.66
443 0.74
444 0.73
445 0.7
446 0.69
447 0.61
448 0.57
449 0.53
450 0.53
451 0.45
452 0.39
453 0.34
454 0.29
455 0.33
456 0.31
457 0.29
458 0.3
459 0.3
460 0.32
461 0.32
462 0.35
463 0.32
464 0.36
465 0.39
466 0.34
467 0.34