Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TNG9

Protein Details
Accession A0A1E4TNG9    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-198EEALKFMKRLQRKNKKRQHMKKKRIAQVDGBasic
246-265YEKVARVKNKWKCNLRDGIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-192KRLQRKNKKRQHMKKKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012860  Afi1_N  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF07792  Afi1  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MSNPETANIYQSIIEDVIAESRQDFEDSGIDEATLQDLRKIWMQKLAQSKVADFPWVNAKEDNGQLPPQASPGASQGSAGNFSLDHADSNTNGTNNNSSSLQINLNHPEPTISPDVAAALQYPSAISSSAGNQEDTGLILPGGGRVVNQSDGAFEITFDVDNNDSEQNEEALKFMKRLQRKNKKRQHMKKKRIAQVDGLYSSGEEDEDDVNIGSDDINSDLDDDEDSLNSDEENEDQEGNLMLCLYEKVARVKNKWKCNLRDGIANVNGKDYTFQKANGESEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.1
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.09
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.14
26 0.19
27 0.23
28 0.22
29 0.28
30 0.3
31 0.34
32 0.43
33 0.45
34 0.45
35 0.43
36 0.43
37 0.39
38 0.38
39 0.36
40 0.26
41 0.25
42 0.28
43 0.29
44 0.3
45 0.25
46 0.26
47 0.26
48 0.28
49 0.29
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.16
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.13
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.17
91 0.18
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.15
97 0.17
98 0.17
99 0.14
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.06
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.14
162 0.19
163 0.26
164 0.36
165 0.47
166 0.56
167 0.66
168 0.77
169 0.82
170 0.87
171 0.91
172 0.93
173 0.93
174 0.93
175 0.93
176 0.93
177 0.93
178 0.9
179 0.87
180 0.79
181 0.74
182 0.68
183 0.62
184 0.53
185 0.43
186 0.35
187 0.26
188 0.23
189 0.16
190 0.11
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.07
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.1
234 0.13
235 0.19
236 0.26
237 0.34
238 0.4
239 0.5
240 0.58
241 0.65
242 0.72
243 0.76
244 0.76
245 0.78
246 0.8
247 0.73
248 0.72
249 0.65
250 0.64
251 0.61
252 0.58
253 0.5
254 0.43
255 0.4
256 0.32
257 0.31
258 0.24
259 0.24
260 0.23
261 0.25
262 0.26
263 0.31