Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4U2S1

Protein Details
Accession A0A1E4U2S1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-254DQLQQQKTKIENKNKNKNNNKNLEELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025742  CSTF2_hinge  
IPR038192  CSTF_C_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14327  CSTF2_hinge  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDIKPSKVIYVGSIPYDQTEEQVLEIAKSVGPVVDLKLLFDKETGKSKGYAFVEYSDLESAQSAVRNLSRYNIGNRTLKCNFSNETTLLNGNNNNNNNVISGTITDSVLGDNRKKIRNNKFKQLQSQSQSQSQSQTIPPLPPGIELSNNAQQSASDVITTELNKLDRKRLLNLVKDAKKMSTMNPTLMKTLLKETPQLSYALVEAALLLGLTGSSQLQTLLVDDGKIDQLQQQKTKIENKNKNKNNNKNLEELTLEQRELIKEVINMSDDQVNILPDDKKSVILQLKALYGNNIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.23
4 0.25
5 0.22
6 0.17
7 0.17
8 0.15
9 0.14
10 0.17
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.07
19 0.08
20 0.09
21 0.1
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.19
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.19
31 0.28
32 0.29
33 0.27
34 0.29
35 0.29
36 0.36
37 0.34
38 0.33
39 0.26
40 0.26
41 0.26
42 0.24
43 0.25
44 0.18
45 0.16
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.1
53 0.13
54 0.15
55 0.15
56 0.16
57 0.2
58 0.22
59 0.27
60 0.3
61 0.34
62 0.38
63 0.39
64 0.45
65 0.43
66 0.44
67 0.4
68 0.38
69 0.35
70 0.32
71 0.35
72 0.28
73 0.26
74 0.24
75 0.24
76 0.21
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.25
81 0.25
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.21
86 0.18
87 0.15
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.16
100 0.21
101 0.27
102 0.33
103 0.42
104 0.51
105 0.59
106 0.64
107 0.7
108 0.74
109 0.73
110 0.77
111 0.75
112 0.72
113 0.64
114 0.65
115 0.57
116 0.53
117 0.5
118 0.41
119 0.37
120 0.29
121 0.28
122 0.21
123 0.22
124 0.19
125 0.17
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.12
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.14
152 0.15
153 0.2
154 0.23
155 0.25
156 0.27
157 0.34
158 0.39
159 0.41
160 0.47
161 0.51
162 0.5
163 0.5
164 0.48
165 0.39
166 0.37
167 0.33
168 0.29
169 0.29
170 0.26
171 0.28
172 0.32
173 0.32
174 0.29
175 0.3
176 0.27
177 0.19
178 0.21
179 0.2
180 0.17
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.21
185 0.2
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.08
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.18
218 0.24
219 0.29
220 0.32
221 0.34
222 0.4
223 0.5
224 0.55
225 0.59
226 0.64
227 0.71
228 0.78
229 0.82
230 0.88
231 0.89
232 0.9
233 0.9
234 0.89
235 0.82
236 0.77
237 0.71
238 0.63
239 0.55
240 0.47
241 0.43
242 0.35
243 0.32
244 0.26
245 0.26
246 0.24
247 0.23
248 0.2
249 0.16
250 0.14
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.16
256 0.19
257 0.16
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.17
263 0.17
264 0.14
265 0.2
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.28
270 0.31
271 0.31
272 0.34
273 0.32
274 0.35
275 0.35
276 0.35