FuNGI

A0A1E4TVP9

Protein Details

Accession

A0A1E4TVP9

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-74	LTQFERPIRLHRKDPRNLQFQL	Hydrophilic
88-111	EREAKLKERMLQKQRQKQEQDDNV	Hydrophilic
176-199	PDGGARKPKKNLFKKKTRQINIMD	Hydrophilic
601-632	LLAILKPKIHRHPQNKVRIKELFKKCLRNHDG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
82-94	RKKEREEREAKLK
179-192	GARKPKKNLFKKKT

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSSRGEVKEENRDQSVNNAYTDFTLKCCSEEEVDGIRHHILKFQTKNKIDPLTQFERPIRLHRKDPRNLQFQLTRKEIDERKKEREEREAKLKERMLQKQRQKQEQDDNVSINVDNDSSVAGNSEAIDGSGNNIDDSEEDEIDQEIKRRAAQEKEEANKNKKNNKPETDMSIVAPDGGARKPKKNLFKKKTRQINIMDEQKRKLRYEEYYPWVIEDYNGKNTWVGSYEAGNSDSYVLFVFDKDGFKMVPAEKVYKFTPRNNYATLTLEEAESRMQKNAQVPRWLMKHMADDSKQSGSKDPRFRKRGGNFKTVVGSTDDSNGRNHDGDDYGNFNDDDNGHNEDIDYDDEFDDDEEAPIIEDEQQNRDSEQRMRREMLSANALGNDKDYRDEDEDDDDEFADLFGSRKTVDKDVKKLRKALVKTEMNEAYDTDDSENPYLSESEEEEEDEDEEVAKDENEASKIKKENEDNVIAPKNRSQSPQPRKIVVKSNKNLMITIKVPKETLASFPKSEWDNNYSSRPSFVGLRSVDVSEKDKKVKEEQTEMDTIPIIKKEDEVDMKSALSPKNSNRSRSHTPSDDDLLTEEDIKQIIQAGPISVKELLAILKPKIHRHPQNKVRIKELFKKCLRNHDGLLYLKN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.48
4	0.4
5	0.35
6	0.31
7	0.28
8	0.28
9	0.31
10	0.25
11	0.18
12	0.21
13	0.2
14	0.21
15	0.22
16	0.23
17	0.22
18	0.24
19	0.26
20	0.27
21	0.29
22	0.29
23	0.29
24	0.29
25	0.29
26	0.27
27	0.27
28	0.27
29	0.34
30	0.42
31	0.49
32	0.57
33	0.58
34	0.63
35	0.65
36	0.67
37	0.6
38	0.58
39	0.58
40	0.55
41	0.54
42	0.55
43	0.51
44	0.51
45	0.5
46	0.54
47	0.56
48	0.55
49	0.61
50	0.65
51	0.73
52	0.75
53	0.83
54	0.82
55	0.81
56	0.77
57	0.74
58	0.72
59	0.7
60	0.68
61	0.62
62	0.54
63	0.47
64	0.54
65	0.54
66	0.56
67	0.59
68	0.59
69	0.63
70	0.71
71	0.76
72	0.73
73	0.77
74	0.74
75	0.71
76	0.75
77	0.74
78	0.68
79	0.69
80	0.67
81	0.62
82	0.64
83	0.66
84	0.65
85	0.67
86	0.74
87	0.75
88	0.81
89	0.84
90	0.81
91	0.8
92	0.81
93	0.8
94	0.77
95	0.71
96	0.63
97	0.54
98	0.49
99	0.4
100	0.3
101	0.21
102	0.13
103	0.1
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.06
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.06
117	0.08
118	0.09
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.09
123	0.08
124	0.11
125	0.11
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.12
132	0.13
133	0.14
134	0.15
135	0.17
136	0.2
137	0.26
138	0.31
139	0.35
140	0.41
141	0.46
142	0.51
143	0.59
144	0.63
145	0.65
146	0.65
147	0.68
148	0.69
149	0.67
150	0.71
151	0.72
152	0.71
153	0.71
154	0.68
155	0.66
156	0.61
157	0.56
158	0.46
159	0.38
160	0.31
161	0.23
162	0.19
163	0.13
164	0.1
165	0.11
166	0.18
167	0.2
168	0.25
169	0.33
170	0.4
171	0.51
172	0.59
173	0.69
174	0.71
175	0.8
176	0.85
177	0.88
178	0.91
179	0.86
180	0.83
181	0.79
182	0.78
183	0.74
184	0.74
185	0.71
186	0.64
187	0.61
188	0.59
189	0.56
190	0.49
191	0.44
192	0.39
193	0.37
194	0.42
195	0.46
196	0.46
197	0.46
198	0.44
199	0.41
200	0.36
201	0.31
202	0.23
203	0.21
204	0.19
205	0.2
206	0.2
207	0.2
208	0.2
209	0.2
210	0.2
211	0.16
212	0.14
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.14
235	0.13
236	0.16
237	0.17
238	0.21
239	0.21
240	0.24
241	0.25
242	0.29
243	0.33
244	0.34
245	0.42
246	0.43
247	0.46
248	0.45
249	0.46
250	0.39
251	0.38
252	0.33
253	0.25
254	0.2
255	0.16
256	0.14
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.12
264	0.19
265	0.25
266	0.28
267	0.31
268	0.32
269	0.36
270	0.37
271	0.36
272	0.31
273	0.26
274	0.26
275	0.24
276	0.27
277	0.23
278	0.23
279	0.24
280	0.25
281	0.25
282	0.21
283	0.24
284	0.27
285	0.34
286	0.41
287	0.48
288	0.55
289	0.58
290	0.61
291	0.65
292	0.66
293	0.69
294	0.65
295	0.64
296	0.55
297	0.52
298	0.51
299	0.41
300	0.35
301	0.26
302	0.21
303	0.14
304	0.16
305	0.16
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.13
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.1
318	0.11
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.13
326	0.12
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.08
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.08
348	0.09
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.14
353	0.16
354	0.16
355	0.22
356	0.28
357	0.31
358	0.34
359	0.36
360	0.36
361	0.37
362	0.35
363	0.31
364	0.27
365	0.21
366	0.18
367	0.18
368	0.18
369	0.15
370	0.15
371	0.12
372	0.09
373	0.1
374	0.11
375	0.12
376	0.15
377	0.17
378	0.16
379	0.19
380	0.19
381	0.18
382	0.17
383	0.14
384	0.11
385	0.09
386	0.08
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.09
394	0.11
395	0.18
396	0.26
397	0.31
398	0.4
399	0.5
400	0.59
401	0.6
402	0.63
403	0.62
404	0.62
405	0.59
406	0.57
407	0.57
408	0.54
409	0.51
410	0.53
411	0.49
412	0.42
413	0.4
414	0.32
415	0.26
416	0.2
417	0.19
418	0.14
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.14
423	0.11
424	0.12
425	0.11
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.1
446	0.12
447	0.14
448	0.19
449	0.24
450	0.28
451	0.33
452	0.36
453	0.4
454	0.44
455	0.46
456	0.41
457	0.43
458	0.46
459	0.41
460	0.39
461	0.36
462	0.35
463	0.34
464	0.36
465	0.39
466	0.44
467	0.53
468	0.62
469	0.62
470	0.64
471	0.66
472	0.68
473	0.7
474	0.68
475	0.68
476	0.62
477	0.66
478	0.64
479	0.6
480	0.56
481	0.47
482	0.43
483	0.35
484	0.38
485	0.33
486	0.29
487	0.28
488	0.28
489	0.29
490	0.25
491	0.28
492	0.28
493	0.29
494	0.29
495	0.29
496	0.33
497	0.33
498	0.35
499	0.33
500	0.31
501	0.31
502	0.33
503	0.38
504	0.37
505	0.35
506	0.33
507	0.29
508	0.26
509	0.26
510	0.24
511	0.26
512	0.24
513	0.26
514	0.26
515	0.27
516	0.26
517	0.24
518	0.28
519	0.28
520	0.32
521	0.35
522	0.37
523	0.4
524	0.47
525	0.53
526	0.55
527	0.55
528	0.55
529	0.54
530	0.54
531	0.5
532	0.42
533	0.35
534	0.29
535	0.24
536	0.22
537	0.18
538	0.15
539	0.17
540	0.17
541	0.23
542	0.28
543	0.28
544	0.28
545	0.27
546	0.28
547	0.28
548	0.32
549	0.27
550	0.27
551	0.3
552	0.34
553	0.44
554	0.49
555	0.54
556	0.56
557	0.62
558	0.67
559	0.69
560	0.71
561	0.66
562	0.65
563	0.63
564	0.61
565	0.54
566	0.44
567	0.38
568	0.32
569	0.26
570	0.23
571	0.17
572	0.14
573	0.13
574	0.12
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.13
579	0.14
580	0.14
581	0.16
582	0.17
583	0.19
584	0.16
585	0.15
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.16
590	0.19
591	0.18
592	0.24
593	0.29
594	0.37
595	0.45
596	0.54
597	0.6
598	0.66
599	0.75
600	0.79
601	0.86
602	0.88
603	0.83
604	0.81
605	0.79
606	0.77
607	0.77
608	0.77
609	0.76
610	0.75
611	0.81
612	0.78
613	0.8
614	0.79
615	0.75
616	0.69
617	0.65
618	0.64

A0A1E4TVP9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer