Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TTU6

Protein Details
Accession A0A1E4TTU6    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-46TEKDQSKWTNQKPSQWRSRLQKKGLSHydrophilic
58-80DSSSSKLKPKGPRGPRGKIPLNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-75LKPKGPRGPRGK
437-446DKRKKEKESK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MDLIGDIVEKEVVPPEAVSFTEKDQSKWTNQKPSQWRSRLQKKGLSSMSNSIENIDIDSSSSKLKPKGPRGPRGKIPLNYEGLSEAEKIHQESINILSSMSLKEKEEAKKELLDNLDPSILEMLLKRSEKRFSKNETDLKNVDEKIGEWYGSSQNEEWGKPMDESEVDKALGIINKEKKKVSFQDEEKSSNDKQEDENEDEEWEDLENLNDMMPTLEQIKEIESQSVKEMISNVHFPKAPQPQSLEDYKLDLNDPNFNEKLHEKYFPDLPVNIDQMKWMQPIPEPTLRSDIVENVKELRFDFPGNPLLPNESSAVPTHLGLHHHSAEPDLPGYTLSELAHYSRSTFNPQRCIAIQTIGRILYKLGKSFYNFIGIDDETENKEFLETTNITDQLWDLIYELRILDTLNEFSNEKLNKNLSVRNYSIDALWLWKQGGGDKRKKEKESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.16
6 0.15
7 0.17
8 0.24
9 0.25
10 0.25
11 0.31
12 0.36
13 0.42
14 0.51
15 0.57
16 0.6
17 0.64
18 0.72
19 0.75
20 0.8
21 0.81
22 0.78
23 0.79
24 0.79
25 0.85
26 0.86
27 0.83
28 0.8
29 0.74
30 0.77
31 0.74
32 0.67
33 0.61
34 0.58
35 0.54
36 0.5
37 0.44
38 0.36
39 0.31
40 0.26
41 0.23
42 0.17
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.19
50 0.24
51 0.32
52 0.4
53 0.5
54 0.59
55 0.66
56 0.74
57 0.78
58 0.82
59 0.82
60 0.82
61 0.8
62 0.75
63 0.72
64 0.68
65 0.64
66 0.56
67 0.48
68 0.4
69 0.32
70 0.27
71 0.21
72 0.15
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.17
88 0.15
89 0.13
90 0.16
91 0.24
92 0.29
93 0.33
94 0.35
95 0.35
96 0.39
97 0.39
98 0.41
99 0.37
100 0.33
101 0.29
102 0.26
103 0.25
104 0.19
105 0.18
106 0.14
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.1
111 0.14
112 0.16
113 0.18
114 0.21
115 0.3
116 0.35
117 0.41
118 0.46
119 0.49
120 0.56
121 0.63
122 0.67
123 0.63
124 0.64
125 0.57
126 0.53
127 0.5
128 0.41
129 0.33
130 0.26
131 0.22
132 0.2
133 0.2
134 0.17
135 0.12
136 0.14
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.14
141 0.17
142 0.2
143 0.2
144 0.19
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.16
161 0.22
162 0.27
163 0.29
164 0.31
165 0.31
166 0.36
167 0.42
168 0.43
169 0.44
170 0.44
171 0.5
172 0.52
173 0.53
174 0.48
175 0.46
176 0.4
177 0.35
178 0.32
179 0.24
180 0.22
181 0.25
182 0.28
183 0.26
184 0.27
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.14
190 0.09
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.11
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.22
225 0.29
226 0.3
227 0.28
228 0.3
229 0.31
230 0.34
231 0.36
232 0.31
233 0.23
234 0.22
235 0.21
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.14
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.21
246 0.2
247 0.24
248 0.21
249 0.24
250 0.2
251 0.22
252 0.26
253 0.26
254 0.26
255 0.21
256 0.22
257 0.22
258 0.23
259 0.21
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.11
267 0.13
268 0.17
269 0.22
270 0.25
271 0.25
272 0.25
273 0.29
274 0.28
275 0.27
276 0.24
277 0.23
278 0.23
279 0.23
280 0.22
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.2
285 0.18
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.21
291 0.21
292 0.21
293 0.19
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.19
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.16
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.15
307 0.16
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.11
326 0.13
327 0.12
328 0.14
329 0.16
330 0.19
331 0.27
332 0.33
333 0.37
334 0.42
335 0.43
336 0.45
337 0.43
338 0.44
339 0.37
340 0.36
341 0.32
342 0.27
343 0.29
344 0.26
345 0.25
346 0.21
347 0.21
348 0.22
349 0.23
350 0.23
351 0.22
352 0.24
353 0.26
354 0.3
355 0.3
356 0.3
357 0.28
358 0.26
359 0.28
360 0.24
361 0.24
362 0.22
363 0.23
364 0.18
365 0.19
366 0.18
367 0.14
368 0.14
369 0.12
370 0.12
371 0.17
372 0.15
373 0.18
374 0.23
375 0.23
376 0.23
377 0.23
378 0.22
379 0.17
380 0.17
381 0.13
382 0.09
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.15
395 0.15
396 0.16
397 0.24
398 0.24
399 0.23
400 0.28
401 0.29
402 0.34
403 0.38
404 0.44
405 0.42
406 0.48
407 0.48
408 0.45
409 0.45
410 0.4
411 0.35
412 0.31
413 0.25
414 0.22
415 0.22
416 0.21
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.24
421 0.33
422 0.39
423 0.46
424 0.54
425 0.64
426 0.72