Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TRU9

Protein Details
Accession A0A1E4TRU9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31ANRRKALERLRQRQLDKNNDNHydrophilic
60-83IEENRRKALERKKQRENNLRDASSHydrophilic
202-221QIFKCKVCKRCKELRPEKYSHydrophilic
294-317RVDRRDKKFEMKLREMRKKTRAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-315MRVDRRDKKFEMKLREMRKKTRA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PF01286  XPA_N  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MDSERQKKIEANRRKALERLRQRQLDKNNDNNLGSKNTESVASVPQRPKINLTPEQMAIIEENRRKALERKKQRENNLRDASSTTTILNKNDYKISKEINNGSGSTTSLGKRPLDNIRPSIRKQDYIDYDFSTLKDSYGGFISEDSNVAGGNGGENSGQTLEQWKEEQKSKIVMEPPPPVDISSAPRCYECQSIDIDQNLFQIFKCKVCKRCKELRPEKYSLLTKTECREDYLLTDPELKDKNLLHRLEKPNPYSGTYSKMQLFLRYQVEEFAFKKWGGEEGLDKEWARREAMRVDRRDKKFEMKLREMRKKTRAEEYTRKLRENKQQHIHEWSLPLSKKNDKEEGVVRRRCIVCGMETEEFIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.73
4 0.73
5 0.73
6 0.73
7 0.74
8 0.77
9 0.78
10 0.8
11 0.8
12 0.8
13 0.79
14 0.78
15 0.76
16 0.73
17 0.69
18 0.64
19 0.57
20 0.5
21 0.43
22 0.34
23 0.28
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.18
28 0.22
29 0.25
30 0.31
31 0.34
32 0.39
33 0.43
34 0.44
35 0.48
36 0.47
37 0.51
38 0.51
39 0.52
40 0.51
41 0.46
42 0.46
43 0.4
44 0.33
45 0.26
46 0.21
47 0.24
48 0.23
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.28
53 0.35
54 0.43
55 0.46
56 0.55
57 0.61
58 0.71
59 0.79
60 0.87
61 0.89
62 0.86
63 0.86
64 0.84
65 0.75
66 0.65
67 0.59
68 0.52
69 0.44
70 0.37
71 0.26
72 0.23
73 0.25
74 0.25
75 0.29
76 0.27
77 0.26
78 0.32
79 0.33
80 0.31
81 0.33
82 0.36
83 0.34
84 0.38
85 0.4
86 0.37
87 0.37
88 0.33
89 0.31
90 0.28
91 0.23
92 0.19
93 0.17
94 0.14
95 0.15
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.23
100 0.3
101 0.35
102 0.39
103 0.42
104 0.47
105 0.51
106 0.52
107 0.57
108 0.51
109 0.48
110 0.46
111 0.48
112 0.46
113 0.45
114 0.45
115 0.36
116 0.36
117 0.32
118 0.29
119 0.25
120 0.18
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.13
152 0.17
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.25
158 0.28
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.31
163 0.3
164 0.27
165 0.27
166 0.23
167 0.2
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.21
176 0.23
177 0.19
178 0.15
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.12
190 0.11
191 0.15
192 0.22
193 0.27
194 0.36
195 0.45
196 0.54
197 0.58
198 0.67
199 0.7
200 0.74
201 0.79
202 0.8
203 0.79
204 0.75
205 0.69
206 0.65
207 0.62
208 0.53
209 0.48
210 0.4
211 0.35
212 0.34
213 0.37
214 0.31
215 0.29
216 0.28
217 0.23
218 0.24
219 0.26
220 0.24
221 0.19
222 0.23
223 0.2
224 0.24
225 0.25
226 0.23
227 0.21
228 0.21
229 0.29
230 0.33
231 0.35
232 0.34
233 0.42
234 0.49
235 0.55
236 0.59
237 0.54
238 0.53
239 0.52
240 0.51
241 0.46
242 0.39
243 0.36
244 0.31
245 0.32
246 0.27
247 0.3
248 0.28
249 0.28
250 0.29
251 0.29
252 0.31
253 0.29
254 0.27
255 0.25
256 0.26
257 0.26
258 0.24
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.19
263 0.17
264 0.18
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.19
269 0.22
270 0.24
271 0.23
272 0.23
273 0.26
274 0.26
275 0.25
276 0.22
277 0.24
278 0.3
279 0.4
280 0.47
281 0.5
282 0.57
283 0.65
284 0.68
285 0.72
286 0.67
287 0.66
288 0.67
289 0.68
290 0.68
291 0.69
292 0.72
293 0.76
294 0.83
295 0.81
296 0.81
297 0.81
298 0.8
299 0.75
300 0.77
301 0.74
302 0.73
303 0.76
304 0.76
305 0.78
306 0.75
307 0.76
308 0.72
309 0.73
310 0.74
311 0.74
312 0.75
313 0.74
314 0.76
315 0.75
316 0.76
317 0.71
318 0.64
319 0.57
320 0.5
321 0.48
322 0.43
323 0.43
324 0.42
325 0.46
326 0.5
327 0.53
328 0.58
329 0.51
330 0.55
331 0.59
332 0.63
333 0.65
334 0.64
335 0.59
336 0.6
337 0.59
338 0.54
339 0.5
340 0.42
341 0.35
342 0.36
343 0.4
344 0.34